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proteína hierro-azufre

Las proteínas hierro-azufre son proteínas caracterizadas por la presencia de cúmulos hierro-azufre que contienen centros de di-, tri- y tetrahierro unidos por sulfuro en estados...

Las proteínas hierro-azufre son proteínas caracterizadas por la presencia de cúmulos hierro-azufre que contienen centros de di-, tri- y tetrahierro unidos por sulfuro en estados de oxidación variables . Los cúmulos hierro-azufre se encuentran en una variedad de metaloproteínas , como las ferredoxinas , así como la NADH deshidrogenasa , las hidrogenasas , la coenzima Q-citocromo c reductasa , la succinato-coenzima Q reductasa y la nitrogenasa . [ 1 ] Los cúmulos hierro-azufre son más conocidos por su papel en las reacciones de oxidación-reducción del transporte de electrones en mitocondrias y cloroplastos . Tanto el Complejo I como el Complejo II de la fosforilación oxidativa tienen múltiples cúmulos Fe-S. Tienen muchas otras funciones, incluyendo la catálisis , como lo ilustra la aconitasa , la generación de radicales, como lo ilustran las enzimas dependientes de SAM , y como donantes de azufre en la biosíntesis del ácido lipoico y la biotina . Adicionalmente, algunas proteínas Fe-S regulan la expresión génica. Las proteínas Fe-S son vulnerables al ataque del óxido nítrico biogénico , formando complejos de hierro dinitrosilo . En la mayoría de las proteínas Fe-S, los ligandos terminales del Fe son tiolato , pero existen excepciones. [ 2 ]

La prevalencia de estas proteínas en las vías metabólicas de la mayoría de los organismos lleva a teorías que sugieren que los compuestos de hierro-azufre tuvieron un papel importante en el origen de la vida, según la teoría del mundo de hierro-azufre .

En algunos casos, los cúmulos de Fe-S son redox-inactivos, pero se propone que desempeñan funciones estructurales. Algunos ejemplos son la endonucleasa III y MutY. [ 3 ] [ 4 ]

Motivos estructurales

En casi todas las proteínas Fe-S, los centros de Fe son tetraédricos y los ligandos terminales son centros de azufre tiolato provenientes de residuos de cisteína. Los grupos sulfuro son de dos o tres coordinaciones. Los tres tipos distintos de clústeres Fe-S con estas características son los más comunes.

Principios de estructura y función

Las proteínas hierro-azufre participan en diversos procesos biológicos de transporte de electrones, como la fotosíntesis y la respiración celular, que requieren una rápida transferencia de electrones para satisfacer las necesidades energéticas o bioquímicas del organismo. Para desempeñar sus diversas funciones biológicas, las proteínas hierro-azufre realizan transferencias rápidas de electrones y abarcan todo el rango de potenciales redox fisiológicos, desde -600 mV hasta +460 mV.

Los enlaces Fe 3+ -SR tienen una covalencia inusualmente alta, lo cual es esperado. Al comparar la covalencia de Fe 3+ con la de Fe 2+ , Fe 3+ tiene casi el doble de covalencia que Fe 2+ (20% a 38,4%). [ 5 ] Fe 3+ también está mucho más estabilizado que Fe 2+ . Los iones duros como Fe 3+ normalmente tienen baja covalencia debido al desajuste de energía entre el orbital molecular desocupado más bajo del metal y el orbital molecular ocupado más alto del ligando .

Las moléculas de agua externas situadas cerca del sitio activo hierro-azufre reducen la covalencia; esto se puede demostrar mediante experimentos de liofilización en los que se elimina el agua de la proteína. Esta reducción se debe a que el agua externa forma enlaces de hidrógeno con el azufre de la cisteína, disminuyendo la donación de electrones del par solitario de este último al Fe³⁺ /²⁺ al atraer los electrones del azufre. [ 5 ] Dado que la covalencia estabiliza más al Fe³⁺ que al Fe²⁺ , el Fe³⁺ se desestabiliza más por el enlace de hidrógeno HOH-S.

Las energías de los orbitales 3d del Fe³⁺ siguen el esquema de enlace "invertido" que, fortuitamente, hace que los orbitales d del Fe³⁺ coincidan estrechamente en energía con los orbitales 3p del azufre, lo que da una alta covalencia en el orbital molecular de enlace resultante. [ 3 ] Esta alta covalencia reduce la energía de reorganización de la esfera interna [ 3 ] y, en última instancia, contribuye a una rápida transferencia de electrones.

cúmulos 2Fe–2S

cúmulos 2Fe–2S

El sistema polimetálico más simple, el clúster [Fe₂S₂ ] , está constituido por dos iones de hierro unidos por dos iones sulfuro y coordinados por cuatro ligandos de cisteinilo (en las ferredoxinas Fe₂S₂ ) o por dos cisteínas y dos histidinas (en las proteínas de Rieske ). Las proteínas oxidadas contienen dos iones Fe³⁺ , mientras que las proteínas reducidas contienen un ion Fe³⁺ y un ion Fe²⁺ . Estas especies existen en dos estados de oxidación, (Fe³⁺ ) y Fe³⁺Fe²⁺ . El dominio hierro-azufre de CDGSH también se asocia con clústeres 2Fe-2S.

Estados de oxidación del clúster 2Fe-2S de Rieske para Fe 3+ y Fe 2+

Las proteínas de Rieske contienen cúmulos de Fe-S que se coordinan formando una estructura 2Fe-2S y se encuentran en el complejo citocromo bc1 III, unido a la membrana, en las mitocondrias de eucariotas y bacterias. También forman parte de las proteínas del cloroplasto , como el complejo citocromo b6f en organismos fotosintéticos. Estos organismos fotosintéticos incluyen plantas, algas verdes y cianobacterias , precursoras bacterianas de los cloroplastos. Ambos forman parte de la cadena de transporte de electrones de sus respectivos organismos , un paso crucial en la obtención de energía para muchos organismos. [ 6 ]

cúmulos 4Fe–4S

Un motivo común presenta cuatro iones de hierro y cuatro iones de sulfuro ubicados en los vértices de un clúster de tipo cubano . Los centros de Fe suelen estar coordinados además por ligandos de cisteinilo. Las proteínas de transferencia de electrones [Fe₄S₄] (ferredoxinas [Fe₄S₄ ] ) pueden subdividirse en ferredoxinas de bajo potencial (tipo bacteriano) y de alto potencial (HiPIP) . Las ferredoxinas de bajo y alto potencial están relacionadas por el siguiente esquema redox:

Los cúmulos 4Fe-4S actúan como relés de electrones en las proteínas.

En HiPIP, el clúster alterna entre [2Fe 3+ , 2Fe 2+ ] (Fe 4 S 4 2+ ) y [3Fe 3+ , Fe 2+ ] (Fe 4 S 4 3+ ). Los potenciales para este par redox varían de 0,4 a 0,1 V. En las ferredoxinas bacterianas, el par de estados de oxidación es [Fe 3+ , 3Fe 2+ ] (Fe 4 S 4 + ) y [2Fe 3+ , 2Fe 2+ ] (Fe 4 S 4 2+ ). Los potenciales para este par redox varían de −0,3 a −0,7 V. Las dos familias de clústeres 4Fe–4S comparten el estado de oxidación Fe 4 S 4 2+ . La diferencia en los pares redox se atribuye al grado de enlaces de hidrógeno, que modifica fuertemente la basicidad de los ligandos tiolato de cisteinilo. Un par redox adicional, que es aún más reductor que las ferredoxinas bacterianas, está implicado en la nitrogenasa .

Algunos clústeres 4Fe–4S se unen a sustratos y, por lo tanto, se clasifican como cofactores enzimáticos. En la aconitasa , el clúster Fe–S se une al aconitato en el centro Fe que carece de un ligando tiolato. El clúster no experimenta reacciones redox, sino que actúa como catalizador ácido de Lewis para convertir el citrato en isocitrato . En las enzimas SAM radicalarias , el clúster se une a la S-adenosilmetionina y la reduce para generar un radical, que participa en numerosas biosíntesis. [ 7 ]

Estados de oxidación 4Fe-4S de Fe 3+ , Fe 2.5+ , y Fe 2+ .

El segundo cubano que se muestra aquí, con pares de valencia mixta (2 Fe3+ y 2 Fe2+), tiene una mayor estabilidad debido a la comunicación covalente y a la fuerte deslocalización covalente del electrón "extra" del Fe2+ reducido, lo que da como resultado un acoplamiento ferromagnético completo.

cúmulos 3Fe–4S

También se sabe que las proteínas contienen centros [Fe₃S₄ ] , que presentan un hierro menos que los núcleos [Fe₄S₄] más comunes. Tres iones sulfuro unen dos iones hierro cada uno, mientras que el cuarto sulfuro une tres iones hierro. Sus estados de oxidación formales pueden variar desde [Fe₃S₄ ] ( forma totalmente Fe³⁺) hasta [Fe₃S₄] ²⁻ ( forma totalmente Fe²⁺ ) . En varias proteínas hierro - azufre , el clúster [Fe₄S₄ ] puede convertirse reversiblemente por oxidación y pérdida de un ion hierro en un clúster [Fe₃S₄ ] . Por ejemplo, la forma inactiva de la aconitasa posee un [Fe₃S₄ ] y se activa mediante la adición de Fe²⁺ y un reductor .

Otros cúmulos de Fe-S

Algunos ejemplos son los sitios activos de varias enzimas:

  • Estructura del clúster FeMoco en la nitrogenasa . El clúster está unido a la proteína por los residuos de aminoácidos cisteína e histidina .
    La nitrogenasa incluye dos clústeres P ([8Fe-7S]) y dos FeMocos ([7Fe-9S-C-Mo- R homocitrato]). [ 8 ]
  • La monóxido de carbono deshidrogenasa y la acetil coenzima A sintasa presentan cada una clústeres Fe-N-iS 4. [ 9 ] [ 10 ]
  • La hidrogenasa [FeFe] presenta un "cluster H", que consiste en un puente Fe₄S₄ unido a Fe₂ a través de una cistina . La mitad Fe₂ presenta ligandos únicos: 3 CO, 2 CN⁻ y un azaditiolato HN( CH₂S⁻ ) . [ 11 ]
  • Se encontró un clúster especial [Fe 4 S 3 ] coordinado con 6 cisteínas en hidrogenasas [NiFe] unidas a la membrana tolerantes al oxígeno. [ 12 ] [ 13 ]
  • El "grupo cubano doble" [Fe 8 S 9 ], presente en algunas ATPasas relacionadas con la nitrogenasa, consta de dos [Fe 4 S 4 ] unidos por una cisteína. Las funciones de estas proteínas aún no están claras. [ 14 ]
Rangos de potenciales de reducción, E o (mV), cubiertos por las diferentes clases de proteínas hierro-azufre, hemoproteínas y proteínas de cobre. (HiPIP = Proteínas hierro-azufre de alto potencial, Rdx = rubredoxinas, Fdx = ferredoxinas, Cyt = citocromos).

Biosíntesis

La biosíntesis de los clústeres Fe–S ha sido bien estudiada. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] La biogénesis de los clústeres de hierro-azufre ha sido estudiada más extensamente en las bacterias E. coli y A. vinelandii y la levadura S. cerevisiae . Hasta ahora se han identificado al menos tres sistemas biosintéticos diferentes, a saber, los sistemas nif, suf e isc, que fueron identificados por primera vez en bacterias. El sistema nif es responsable de los clústeres en la enzima nitrogenasa. Los sistemas suf e isc son más generales.

El sistema isc de la levadura es el mejor descrito. Varias proteínas constituyen la maquinaria biosintética a través de la vía isc. El proceso se desarrolla en dos etapas principales: (1) el clúster Fe/S se ensambla sobre una proteína andamiaje, seguido de (2) la transferencia del clúster preformado a las proteínas receptoras. La primera etapa de este proceso tiene lugar en el citoplasma de los organismos procariotas o en las mitocondrias de los organismos eucariotas . En los organismos superiores, los clústeres se transportan fuera de la mitocondria para incorporarse a las enzimas extramitocondriales. Estos organismos también poseen un conjunto de proteínas implicadas en los procesos de transporte e incorporación de los clústeres Fe/S que no son homólogas a las proteínas presentes en los sistemas procariotas.

análogos sintéticos

Holm y colaboradores informaron por primera vez sobre análogos sintéticos de los clústeres Fe–S que se encuentran en la naturaleza . [ 18 ] El tratamiento de sales de hierro con una mezcla de tiolatos y sulfuro produce derivados como ( Et 4 N ) 2 Fe 4 S 4 (SCH 2 Ph) 4 ]. [ 19 ] [ 20 ]

Véase también

Referencias

  1. SJ Lippard, JM Berg “Principios de Química Bioinorgánica” University Science Books: Mill Valley, CA; 1994. ISBN 0-935702-73-3.
  2. Bak, DW; Elliott, SJ (2014). "Ligandos alternativos de clústeres de FeS: ajuste de potenciales redox y química". Curr. Opin. Chem. Biol . 19 : 50–58 . doi : 10.1016/j.cbpa.2013.12.015 . PMID 24463764 . 
  3. 1 2 3 Kennepohl, Pierre; Solomon, Edward I. (2003-01-16). "Contribuciones de la estructura electrónica a la reactividad de transferencia de electrones en sitios activos de hierro-azufre: 3. Cinética de la transferencia de electrones" . Química inorgánica . 42 (3): 696– 708. doi : 10.1021/ic0203320 . ISSN 0020-1669 . PMID 12562183 .  
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  5. 1 2 Sun, Ning; Dey, Abhishek; Xiao, Zhiguang; Wedd, Anthony G.; Hodgson, Keith O.; Hedman, Britt; Solomon, Edward I. (2010-08-20). "Efectos de solvatación en los espectros XAS del borde K del azufre de las proteínas Fe−S: efectos normales e inversos en la rubredoxina WT y mutante" . Journal of the American Chemical Society . 132 (36): 12639– 12647. doi : 10.1021/ja102807x . ISSN 0002-7863 . PMC 2946794. PMID 20726554 .   
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Lecturas adicionales

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