Articulo de referencia

Deshidratasa del ácido delta-aminolevulínico

La aminolevulinato deshidratasa ( porfobilinógeno sintasa , o ALA deshidratasa , o aminolevulinato deshidratasa ) es una enzima ( EC 4.2.1.24 ) que en humanos está codificada po...

La aminolevulinato deshidratasa ( porfobilinógeno sintasa , o ALA deshidratasa , o aminolevulinato deshidratasa ) es una enzima ( EC 4.2.1.24 ) que en humanos está codificada por el gen ALAD . [ 5 ] [ 6 ] La porfobilinógeno sintasa (o ALA deshidratasa , o aminolevulinato deshidratasa ) sintetiza porfobilinógeno mediante la condensación asimétrica de dos moléculas de ácido aminolevulínico . Todos los tetrapirroles naturales , incluidos los hemo , las clorofilas y la vitamina B 12 , comparten el porfobilinógeno como precursor común. La porfobilinógeno sintasa es el prototipo de la morfeína . [ 7 ]

Función

Cataliza la siguiente reacción, el segundo paso de la biosíntesis de porfirinas : [ 8 ]

Dos moléculas de ácido aminolevulínico se condensan para formar porfobilinógeno (un precursor del hemo , los citocromos y otras hemoproteínas). Esta reacción es el primer paso común en la biosíntesis de todos los tetrapirroles biológicos. En los seres humanos, el zinc es esencial para la actividad enzimática. [ 9 ]

Estructura

La base estructural de la regulación alostérica de la porfobilinógeno sintasa (PBGS) es la modulación de un equilibrio de estructura cuaternaria entre octámero y hexámero (a través de dímeros), que se representa esquemáticamente como 6mer* ↔ 2mer* ↔ 2mer ↔ 8mer. El * representa una reorientación entre dos dominios de cada subunidad que ocurre en el estado disociado porque está estéricamente prohibida en los multímeros más grandes. [ 7 ]

Equilibrio de la estructura cuaternaria del PBGS.
El equilibrio de la estructura cuaternaria PBGS incluye un hexámero inactivo (PDB id 1PV8) que carece de las interacciones entre subunidades necesarias para una tapa del sitio activo ordenada. La disociación al dímero pro-hexámero puede ir seguida de un cambio conformacional que reorienta los dos dominios de barril αβ para formar el dímero pro-octámero. La asociación del dímero pro-octámero con el octámero (PDB id 1E51) implica la formación de interfaces entre subunidades que sustentan el orden en la tapa del sitio activo.

La PBGS está codificada por un único gen y cada multímero de PBGS se compone de múltiples copias de la misma proteína. Cada subunidad de PBGS consta de un dominio de barril αβ de aproximadamente 300 residuos , que alberga el sitio activo de la enzima en su centro, y un dominio de brazo N-terminal de más de 25 residuos. La regulación alostérica de la PBGS puede describirse en términos de la orientación del dominio de barril αβ con respecto al dominio de brazo N-terminal.

Cada brazo N -terminal presenta hasta dos interacciones con otras subunidades en un multímero de PBGS. Una de estas interacciones contribuye a estabilizar una conformación "cerrada" de la tapa del sitio activo. La otra interacción restringe el acceso del solvente desde el otro extremo del barril αβ.

En el estado multimérico inactivo, el dominio del brazo N-terminal no participa en la interacción estabilizadora de la tapa, y en la estructura cristalina del ensamblaje inactivo, la tapa del sitio activo está desordenada.

Reguladores alostéricos

Como enzima casi universal con un sitio activo altamente conservado, la PBGS no sería un objetivo principal para el desarrollo de antimicrobianos y/o herbicidas . Por el contrario, los sitios alostéricos pueden ser mucho más variables filogenéticamente que los sitios activos, lo que ofrece más oportunidades para el desarrollo de fármacos. [ 7 ]

La variación filogenética en la alostería de PBGS lleva a plantear el debate sobre la regulación alostérica de PBGS en términos de factores intrínsecos y extrínsecos.

Reguladores alostéricos intrínsecos

Magnesio

El ion magnesio alostérico se encuentra en la interfaz altamente hidratada de dos dímeros pro-octámeros. Parece ser fácilmente disociable, y se ha demostrado que los hexámeros se acumulan cuando se elimina el magnesio in vitro . [ 10 ]

pH

Aunque no es común considerar a los iones hidronio como reguladores alostéricos, en el caso del PBGS, se ha demostrado que la protonación de la cadena lateral en lugares distintos del sitio activo afecta al equilibrio de la estructura cuaternaria y, por lo tanto, también a la velocidad de su reacción catalizada.

Reguladores alostéricos extrínsecos

Estabilización de hexámeros de moléculas pequeñas

El análisis del PBGS 6mer* revela una cavidad superficial que no está presente en el 8mer. Se ha propuesto que la unión de moléculas pequeñas a esta cavidad filogenéticamente variable estabiliza el 6mer* del PBGS objetivo y, en consecuencia, inhibe su actividad.

Estos reguladores alostéricos se conocen como morphlocks porque bloquean el PBGS en una forma específica de morfeína (6mer*). [ 11 ]

Saturnismo

ALAD envenenado por iones de plomo gris

La actividad enzimática de ALAD se inhibe por el plomo , comenzando en niveles de plomo en sangre que antes se consideraban seguros (<10 μg/dL) y continuando con una correlación negativa en el rango de 5 a 95 μg/dL. [ 12 ] La inhibición de ALAD por el plomo conduce a anemia principalmente porque inhibe la síntesis de hemo y acorta la vida útil de los glóbulos rojos circulantes , pero también porque estimula la producción excesiva de la hormona eritropoyetina , lo que lleva a una maduración inadecuada de los glóbulos rojos a partir de sus progenitores. Un defecto en el gen estructural de ALAD puede causar una mayor sensibilidad a la intoxicación por plomo y porfiria hepática aguda . Se han identificado variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican diferentes isoformas. [ 13 ]

Deficiencia

La deficiencia de porfobilinógeno sintasa suele ser adquirida (en lugar de hereditaria) y puede ser causada por intoxicación por metales pesados , especialmente por plomo , ya que la enzima es muy susceptible a la inhibición por metales pesados. [ 14 ]

La insuficiencia hereditaria de la porfobilinógeno sintasa se denomina porfiria por deficiencia de porfobilinógeno sintasa (o ALA deshidratasa) . Es una causa extremadamente rara de porfiria , [ 15 ] con menos de 10 casos reportados. [ 16 ] Todas las variantes proteicas asociadas a la enfermedad favorecen la formación de hexámeros en relación con la enzima humana de tipo silvestre. [ 15 ]

PBGS como prototipo de morfeína

El modelo de alostería de morfeína ejemplificado por PBGS añade una capa adicional de comprensión a los posibles mecanismos de regulación de la función proteica y complementa el creciente enfoque que la comunidad científica de proteínas está poniendo en la dinámica de la estructura proteica. [ 7 ]

Este modelo ilustra cómo la dinámica de fenómenos como las conformaciones proteicas alternativas, los estados oligoméricos alternativos y las interacciones proteína-proteína transitorias pueden aprovecharse para la regulación alostérica de la actividad catalítica.

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000148218 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000028393 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ^ Eiberg H, Mohr J, Nielsen LS (febrero de 1983). "delta-aminolevulinadodehidrasa: sintenia con ABO-AK1-ORM (y asignación al cromosoma 9)". Genética Clínica . 23 (2): 150– 4. doi : 10.1111/j.1399-0004.1983.tb01864.x . PMID 6839527 . S2CID 27267679 .  
  6. Beaumont C, Foubert C, Grandchamp B, Weil D, Gross MS, Nordmann Y (mayo de 1984). "Asignación del gen humano para la delta aminolevulinato deshidratasa al cromosoma 9 mediante hibridación de células somáticas e inmunoensayo enzimático específico". Annals of Human Genetics . 48 (2): 153– 9. doi : 10.1111/j.1469-1809.1984.tb01010.x . PMID 6378062. S2CID 24098976 .  
  7. 1 2 3 4 Jaffe EK, Lawrence SH (marzo de 2012). " Alostería y oligomerización dinámica de la porfobilinógeno sintasa" . Archives of Biochemistry and Biophysics . 519 (2): 144– 53. doi : 10.1016/j.abb.2011.10.010 . PMC 3291741. PMID 22037356 .  
  8. Battersby, Alan R. (2000). "Tetrapirroles: Los pigmentos de la vida". Natural Product Reports . 17 (6): 507– 526. doi : 10.1039/B002635M . PMID 11152419 . 
  9. Enzima 4.2.1.24 en la base de datos de vías metabólicas KEGG .
  10. Breinig S, Kervinen J, Stith L, Wasson AS, Fairman R, Wlodawer A, et al. (septiembre de 2003). "Control de la biosíntesis de tetrapirroles por formas cuaternarias alternativas de la porfobilinógeno sintasa". Nature Structural Biology . 10 (9): 757– 63. doi : 10.1038/nsb963 . PMID 12897770. S2CID 24188785 .   
  11. Lawrence SH, Jaffe EK (2008). "Ampliando los conceptos en las relaciones estructura-función de las proteínas y la cinética enzimática: enseñanza con morfeínas" . Biochemistry and Molecular Biology Education . 36 (4): 274– 283. doi : 10.1002/bmb.20211 . PMC 2575429. PMID 19578473 .  
  12. Abadin H, Ashizawa A, Stevens YW, Llados F, Diamond G, Sage G, Citra M, Quinones A, Bosch SJ, Swarts SG (agosto de 2007). Perfil toxicológico del plomo (PDF) . Atlanta, GA: Agencia para Sustancias Tóxicas y Registro de Enfermedades (EE. UU.). págs. 22, 30. PMID 24049859. Consultado el 22 de noviembre de 2015 .  
  13. «Entrez Gene: ALAD aminolevulinato, delta-, deshidratasa» .
  14. Reacción de la ALA deshidratasa , de NetBiochem en la Universidad de Utah. Última modificación: 1/5/95
  15. 1 2 Jaffe EK, Stith L (febrero de 2007). " La porfiria ALAD es una enfermedad conformacional" . American Journal of Human Genetics . 80 (2): 329– 37. doi : 10.1086/511444 . PMC 1785348. PMID 17236137 .  
  16. Resumen de las porfirias Archivado el 22/07/2011 en Wayback Machine en The Porphyrias Consortium (parte de la Red de Investigación Clínica de Enfermedades Raras de los NIH (RDCRN)) Consultado en junio de 2011

Lecturas adicionales

  • Bernard A, Lauwerys R (1988). "Alteraciones inducidas por metales de la delta-aminolevulinato deshidratasa". Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 514 : 41–7 . doi : 10.1111 /j.1749-6632.1987.tb48759.x . PMID 3327436. S2CID 41966070 .  
  • Jaffe EK (octubre de 2004). "El mecanismo de reacción catalizado por la porfobilinógeno sintasa". Bioorganic Chemistry . 32 (5): 316– 25. doi : 10.1016/j.bioorg.2004.05.010 . PMID 15381398 . 
  • Roels HA, Buchet JP, Lauwerys RR, Sonnet J (agosto de 1975). "Comparación del efecto in vivo del plomo y el cadmio inorgánicos sobre el sistema de la glutatión reductasa y la delta-aminolevulinato deshidratasa en eritrocitos humanos" . British Journal of Industrial Medicine . 32 (3): 181– 92. doi : 10.1136/oem.32.3.181 . PMC 1008057. PMID 1156566 .  
  • Ishida N, Fujita H, Fukuda Y, Noguchi T, Doss M, Kappas A, Sassa S (mayo de 1992). "Clonación y expresión de los genes defectuosos de un paciente con porfiria por deficiencia de delta-aminolevulinato deshidratasa" . The Journal of Clinical Investigation . 89 (5): 1431– 7. doi : 10.1172/JCI115732 . PMC 443012. PMID 1569184 .  
  • Dawson SJ, White LA (mayo de 1992). "Tratamiento de la endocarditis por Haemophilus aphrophilus con ciprofloxacino". The Journal of Infection . 24 (3): 317– 20. doi : 10.1016/S0163-4453(05)80037-4 . PMID 1602151 . 
  • Astrin KH, Kaya AH, Wetmur JG, Desnick RJ (agosto de 1991). "Polimorfismo RsaI en el gen de la delta-aminolevulinato deshidratasa humana en 9q34" . Nucleic Acids Research . 19 (15): 4307. doi : 10.1093 / nar/19.15.4307-a . PMC 328595. PMID 1678509 .  
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  • Plewinska M, Thunell S, Holmberg L, Wetmur JG, Desnick RJ (julio de 1991). "Porfiria por deficiencia de delta-aminolevulinato deshidratasa: identificación de las lesiones moleculares en un homocigoto gravemente afectado" . American Journal of Human Genetics . 49 (1): 167–74 . PMC 1683193. PMID 2063868 .  
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  • Kervinen J, Jaffe EK, Stauffer F, Neier R, Wlodawer A, Zdanov A (julio de 2001). "Base mecanística de la inactivación suicida de la porfobilinógeno sintasa por el ácido 4,7-dioxosebácico, un inhibidor que muestra una selectividad de especie dramática". Biochemistry . 40 (28): 8227–36 . CiteSeerX 10.1.1.374.9639 . doi : 10.1021/bi010656k . PMID 11444968 .