AMAP

AMAP es un programa de alineación de secuencias múltiples basado en el recocido de secuencias . ^{[ 1 ]} Este enfoque consiste en construir la alineación múltiple coincidencia por coincidencia, evitando así muchos de los problemas de la alineación progresiva. Los parámetros de AMAP se pueden usar para ajustar el equilibrio entre sensibilidad y especificidad.

El programa puede utilizarse a través del servidor web AMAP o como un programa independiente que puede instalarse junto con el código fuente.

Entrada/Salida

Este programa acepta secuencias en formato FASTA .

El formato de salida incluye: formato FASTA , Clustal .

Referencias

↑ S. Schwartz, A.; Pachter, L. (19 de enero de 2007). "Alineamiento múltiple mediante recocido de secuencias". Bioinformatics . 23 (2): e24– e29. doi : 10.1093/bioinformatics/btl311 .

Enlaces externos

Servidor web AMAP

[amap-paper-1] S. Schwartz, A.; Pachter, L. (19 de enero de 2007). "Alineamiento múltiple mediante recocido de secuencias". Bioinformatics . 23 (2): e24– e29. doi : 10.1093/bioinformatics/btl311 .

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