Análisis de similitudes

El análisis de similitudes (ANOSIM) es una prueba estadística no paramétrica ampliamente utilizada en el campo de la ecología . La prueba fue propuesta por primera vez por KR Clarke ^{[ 1 ]} como una prueba similar a ANOVA , donde en lugar de operar sobre datos brutos , opera sobre una matriz de disimilitud clasificada .

Dada una matriz de disimilitudes de rango entre un conjunto de muestras, cada una perteneciente a un único sitio (por ejemplo, un único grupo de tratamiento ), la prueba ANOSIM determina si podemos rechazar la hipótesis nula de que la similitud entre sitios es mayor o igual que la similitud dentro de cada sitio.

El estadístico de prueba R se calcula de la siguiente manera:

${\displaystyle R={\frac {r_{B}-r_{W}}{M/2}}}$

donde r _B es el promedio de similitudes de rango de pares de muestras (o réplicas) originadas en diferentes sitios, r _W es el promedio de similitud de rango de pares entre réplicas dentro de los sitios, y M  = n ( n − 1)/2 donde n es el número de muestras.   

El estadístico de prueba R² se encuentra entre -1 y 1, donde los valores positivos indican mayor similitud dentro de los sitios y los valores cercanos a cero representan la ausencia de diferencias entre sitios y dentro de ellos. Los valores negativos de R² sugieren mayor similitud entre sitios que dentro de ellos y pueden aumentar la posibilidad de una asignación errónea de muestras a los sitios.

Para la comprobación de hipótesis , donde la hipótesis nula es que las similitudes dentro de los sitios son menores o iguales a las similitudes entre sitios, el estadístico R se suele comparar con un conjunto de valores R ′ que se obtienen mediante la permutación aleatoria de las etiquetas de los sitios entre las muestras y el cálculo del R ′ resultante , proceso que se repite muchas veces. El porcentaje de veces que el R real superó los valores R ′ derivados de las permutaciones constituye el valor p del estadístico R real.

La clasificación de la disimilitud en ANOSIM y NMDS (escalamiento multidimensional no métrico) van de la mano. La combinación de ambos métodos complementa la visualización de las diferencias entre grupos junto con las pruebas de significancia . ^{[ 2 ]}

ANOSIM está implementado en varios programas estadísticos, incluidos PRIMER, el paquete R Vegan ^{[ 3 ]} y PAST.

• http://www.pisces-conservation.com/caphelp/index.html?analysisofsimilarity(anosim.html
• https://bizfluent.com/about-5475541-similarities-between-swot-pest-analysis.html