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Articulo de referencia

ARID2

La proteína 2 que contiene un dominio interactivo rico en AT ( ARID2 ) es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARID2 . [ 5 ] Función ARID2 es una subunidad del...

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La proteína 2 que contiene un dominio interactivo rico en AT ( ARID2 ) es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARID2 . [ 5 ]

Función

ARID2 es una subunidad del complejo de remodelación de la cromatina PBAF, que facilita la activación transcripcional dependiente de ligando por receptores nucleares. [ 5 ]

Estructura

La proteína ARID2 contiene dos motivos de dedos de zinc C2H2 conservados en el extremo C-terminal , una región rica en los residuos de aminoácidos prolina y glutamina , un dominio de unión al ADN de hélice alada de tipo RFX (factor regulador X) y un dominio de interacción con el ADN rico en AT conservado en el extremo N-terminal ; este último dominio da nombre a la proteína. [ 6 ]

Importancia clínica

Los estudios de mutación han revelado que ARID2 es un supresor tumoral significativo en muchos subtipos de cáncer. Las mutaciones de ARID2 son frecuentes en el carcinoma hepatocelular [ 7 ] y el melanoma [ 8 , 9 ] . Las mutaciones están presentes en una fracción menor, pero significativa , en una amplia gama de otros tumores [ 10 ] . Las mutaciones de ARID2 están enriquecidas en el carcinoma hepatocelular asociado al virus de la hepatitis C en las poblaciones de pacientes de EE. UU. y Europa en comparación con la frecuencia general de mutación [ 6 ] .

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000189079 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000033237 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 "Gen Entrez: dominio interactivo rico en AT ARID2 2 (ARID, similar a RFX)" .
  6. 1 2 Zhao H, Wang J, Han Y, Huang Z, Ying J, Bi X, Zhao J, Fang Y, Zhou H, Zhou J, Li Z, Zhang Y, Yang X, Yan T, Wang L, Torbenson MS, Cai J (noviembre de 2011). " ARID2: un nuevo gen supresor de tumores en el carcinoma hepatocelular" . Oncotarget . 2 (11): 886– 91. doi : 10.18632/oncotarget.355 . PMC 3259997. PMID 22095441 .  
  7. ^ Li M, Zhao H, Zhang X, Wood LD, Anders RA, Choti MA, Pawlik TM, Daniel HD, Kannangai R, Offerhaus GJ, Velculescu VE, Wang L, Zhou S, Vogelstein B, Hruban RH, Papadopoulos N, Cai J, Torbenson MS, Kinzler KW (septiembre de 2011). "Inactivación de mutaciones del gen ARID2 remodelador de la cromatina en el carcinoma hepatocelular" . Genética de la Naturaleza . 43 (9): 828– 9. doi : 10.1038/ng.903 . PMC 3163746 . PMID 21822264 .  
  8. ^ Hodis E, Watson IR, Kryukov GV, Arold ST, Imielinski M, Theurillat JP, Nickerson E, Auclair D, Li L, Place C, Dicara D, Ramos AH, Lawrence MS, Cibulskis K, Sivachenko A, Voet D, Saksena G, Stransky N, Onofrio RC, Winckler W, Ardlie K, Wagle N, Wargo J, Chong K, Morton DL, Stemke-Hale K, Chen G, Noble M, Meyerson M, Ladbury JE, Davies MA, Gershenwald JE, Wagner SN, Hoon DS, Schadendorf D, Lander ES, Gabriel SB, Getz G, Garraway LA, Chin L (julio de 2012). "Un panorama de mutaciones conductoras en melanoma" . Celúla . 150 (2): 251– 63. doi : 10.1016/j.cell.2012.06.024 . PMC 3600117 . PMID 22817889 .  
  9. ↑ Krauthammer M, Kong Y, Ha BH, Evans P, Bacchiocchi A, McCusker JP, Cheng E, Davis MJ, Goh G, Choi M, Ariyan S, Narayan D, Dutton-Regester K, Capatana A, Holman EC, Bosenberg M, Sznol M, Kluger HM, Brash DE, Stern DF, Materin MA, Lo RS, Mane S, Ma S, Kidd KK, Hayward NK, Lifton RP, Schlessinger J, Boggon TJ, Halaban R (septiembre de 2012). "La secuenciación del exoma identifica mutaciones somáticas recurrentes de RAC1 en el melanoma" . Nature Genetics . 44 (9): 1006–14 . doi : 10.1038/ng.2359 . PMC 3432702. PMID 22842228 .  
  10. ↑ Shain AH, Pollack JR (2013). "El espectro de mutaciones SWI/SNF, ubicuas en cánceres humanos" . PLOS ONE . 8 (1) e55119. Bibcode : 2013PLoSO...855119S . doi : 10.1371/ journal.pone.0055119 . PMC 3552954. PMID 23355908 .  

Lecturas adicionales

  • Martens JA, Winston F (abril de 2003). "Avances recientes en la comprensión de la remodelación de la cromatina por los complejos Swi/Snf". Current Opinion in Genetics & Development . 13 (2): 136– 42. doi : 10.1016/S0959-437X(03)00022-4 . PMID 12672490 . 
  • Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (agosto de 2000). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XVIII. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Research . 7 (4): 273–81 . doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877 . 
  • Mohrmann L, Langenberg K, Krijgsveld J, Kal AJ, Heck AJ, Verrijzer CP (abril de 2004). "Diferencial targeting of two distinct SWI/SNF-related Drosophila chromatin-remodeling complexes" . Molecular and Cellular Biology . 24 (8): 3077–88 . doi : 10.1128/MCB.24.8.3077-3088.2004 . PMC 381637. PMID 15060132 .  
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (junio de 2004). "La caracterización del transcriptoma dilucida las redes de señalización que controlan el crecimiento y la diferenciación de las células ES humanas". Nature Biotechnology . 22 (6): 707–16 . doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197. S2CID 27764390 .  
  • Diederichs S, Bäumer N, Ji P, Metzelder SK, Idos GE, Cauvet T, Wang W, Möller M, Pierschalski S, Gromoll J, Schrader MG, Koeffler HP, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (agosto de 2004). "Identificación de socios de interacción y sustratos del complejo ciclina A1-CDK2" . The Journal of Biological Chemistry . 279 (32): 33727–41 . doi : 10.1074/jbc.M401708200 . PMID 15159402 . 
  • Patsialou A, Wilsker D, Moran E (2005). "Propiedades de unión al ADN de las proteínas de la familia ARID" . Nucleic Acids Research . 33 (1): 66– 80. doi : 10.1093/nar/gki145 . PMC 546134. PMID 15640446 .  
  • Wilsker D, Probst L, Wain HM, Maltais L, Tucker PW, Moran E (agosto de 2005). "Nomenclatura de la familia ARID de proteínas de unión al ADN". Genomics . 86 (2): 242– 51. doi : 10.1016/j.ygeno.2005.03.013 . PMID 15922553 . 
  • Yan Z, Cui K, Murray DM, Ling C, Xue Y, Gerstein A, Parsons R, Zhao K, Wang W (julio de 2005). "El complejo de remodelación de la cromatina PBAF requiere una nueva subunidad de especificidad, BAF200, para regular la expresión de genes selectivos que responden al interferón" . Genes & Development . 19 (14): 1662–7 . doi : 10.1101/gad.1323805 . PMC 1176002. PMID 15985610 .  
  • Zhang X, Azhar G, Zhong Y, Wei JY (agosto de 2006). "Zipzap/p200 es una nueva proteína de dedo de zinc que contribuye a la regulación génica cardíaca". Biochemical and Biophysical Research Communications . 346 (3): 794– 801. Bibcode : 2006BBRC..346..794Z . doi : 10.1016/j.bbrc.2006.05.211 . PMID 16782067 . 

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .