ARID5B

La proteína 5B que contiene un dominio interactivo rico en AT es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ARID5B . ^[5]^[6]^[7]

Los nombres alternativos para este gen incluyen factor de reconocimiento modulador 23.

Genómica

El gen se encuentra en el brazo largo del cromosoma 10 (10q21.2), en la cadena "positiva". Tiene una longitud de 195.261 pares de bases y codifica una proteína con una longitud y un peso molecular previstos de 1188 aminoácidos y 132,375 kilodaltons, respectivamente.

Importancia clínica

A través de estudios de asociación del genoma completo (GWAS), se ha observado que algunos de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) ubicados en este gen están significativamente asociados con la susceptibilidad ^[8]^[9]^[10] así como con los resultados del tratamiento ^{[11] de}la leucemia linfoblástica aguda infantil en poblaciones étnicamente diversas.

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000150347 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000019947 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ Lahoud MH, Ristevski S, Venter DJ, Jermiin LS, Bertoncello I, Zavarsek S, Hasthorpe S, Drago J, de Kretser D, Hertzog PJ, Kola I (agosto de 2001). "La orientación genética de Desrt, una nueva proteína de unión al ADN de clase ARID, provoca un retraso en el crecimiento y un desarrollo anormal de los órganos reproductivos". Investigación del genoma . 11 (8): 1327– 34. doi : 10.1101/gr.168801 . hdl : 10536/DRO/DU:30121320 . PMID 11483573.
^ Zhu L, Hu J, Lin D, Whitson R, Itakura K, Chen Y (agosto de 2001). "Dinámica del dominio de unión al ADN de Mrf-2 libre y en complejo con el ADN". Bioquímica . 40 (31): 9142– 50. doi :10.1021/bi010476a. PMID 11478881.
^ "Gen Entrez: dominio interactivo rico en ARID5B AT 5B (similar a MRF1)".
^ Xu H, Yang W, Perez-Andreu V, Devidas M, Fan Y, Cheng C, et al. (mayo de 2013). "Nuevas variantes de susceptibilidad en 10p12.31-12.2 para la leucemia linfoblástica aguda infantil en poblaciones étnicamente diversas". Journal of the National Cancer Institute . 105 (10): 733– 42. doi :10.1093/jnci/djt042. PMC 3691938 . PMID 23512250.
^ Treviño LR, Yang W, French D, Hunger SP, Carroll WL, Devidas M, et al. (septiembre de 2009). "Variantes genómicas de la línea germinal asociadas con la leucemia linfoblástica aguda infantil". Nature Genetics . 41 (9): 1001– 5. doi :10.1038/ng.432. PMC 2762391 . PMID 19684603.
^ Papaemmanuil E, Hosking FJ, Vijayakrishnan J, Price A, Olver B, Sheridan E, et al. (septiembre de 2009). "Los loci en 7p12.2, 10q21.2 y 14q11.2 están asociados con el riesgo de leucemia linfoblástica aguda infantil". Nature Genetics . 41 (9): 1006– 10. doi :10.1038/ng.430. PMC 4915548 . PMID 19684604.
^ Xu H, Cheng C, Devidas M, Pei D, Fan Y, Yang W, et al. (marzo de 2012). "Los polimorfismos genéticos de ARID5B contribuyen a las disparidades raciales en la incidencia y el resultado del tratamiento de la leucemia linfoblástica aguda infantil". Journal of Clinical Oncology . 30 (7): 751– 7. doi :10.1200/JCO.2011.38.0345. PMC 3295551 . PMID 22291082.

Enlaces externos

Página de detalles del gen ARID5B y ubicación del genoma humano en el navegador de genomas UCSC .

Lectura adicional

Yuan YC, Whitson RH, Liu Q, Itakura K, Chen Y (noviembre de 1998). "Un nuevo motivo de unión al ADN comparte homología estructural con las nucleasas y polimerasas de replicación y reparación del ADN". Nature Structural Biology . 5 (11): 959– 64. doi :10.1038/2934. PMID 9808040. S2CID 10099806.
Whitson RH, Huang T, Itakura K (mayo de 1999). "El nuevo dominio de unión al ADN de Mrf-2 reconoce una secuencia central de cinco bases a través de contactos de surco mayor y menor". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 258 (2): 326– 31. doi :10.1006/bbrc.1999.0643. PMID 10329386.
Patsialou A, Wilsker D, Moran E (2005). "Propiedades de unión al ADN de las proteínas de la familia ARID". Nucleic Acids Research . 33 (1): 66– 80. doi :10.1093/nar/gki145. PMC 546134 . PMID 15640446.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000150347 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000019947 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[pmid11483573-5] Lahoud MH, Ristevski S, Venter DJ, Jermiin LS, Bertoncello I, Zavarsek S, Hasthorpe S, Drago J, de Kretser D, Hertzog PJ, Kola I (agosto de 2001). "La orientación genética de Desrt, una nueva proteína de unión al ADN de clase ARID, provoca un retraso en el crecimiento y un desarrollo anormal de los órganos reproductivos". Investigación del genoma . 11 (8): 1327– 34. doi : 10.1101/gr.168801 . hdl : 10536/DRO/DU:30121320 . PMID 11483573.

[pmid11478881-6] Zhu L, Hu J, Lin D, Whitson R, Itakura K, Chen Y (agosto de 2001). "Dinámica del dominio de unión al ADN de Mrf-2 libre y en complejo con el ADN". Bioquímica . 40 (31): 9142– 50. doi :10.1021/bi010476a. PMID 11478881.

[entrez-7] "Gen Entrez: dominio interactivo rico en ARID5B AT 5B (similar a MRF1)".

[8] Xu H, Yang W, Perez-Andreu V, Devidas M, Fan Y, Cheng C, et al. (mayo de 2013). "Nuevas variantes de susceptibilidad en 10p12.31-12.2 para la leucemia linfoblástica aguda infantil en poblaciones étnicamente diversas". Journal of the National Cancer Institute . 105 (10): 733– 42. doi :10.1093/jnci/djt042. PMC 3691938 . PMID 23512250.

[9] Treviño LR, Yang W, French D, Hunger SP, Carroll WL, Devidas M, et al. (septiembre de 2009). "Variantes genómicas de la línea germinal asociadas con la leucemia linfoblástica aguda infantil". Nature Genetics . 41 (9): 1001– 5. doi :10.1038/ng.432. PMC 2762391 . PMID 19684603.

[10] Papaemmanuil E, Hosking FJ, Vijayakrishnan J, Price A, Olver B, Sheridan E, et al. (septiembre de 2009). "Los loci en 7p12.2, 10q21.2 y 14q11.2 están asociados con el riesgo de leucemia linfoblástica aguda infantil". Nature Genetics . 41 (9): 1006– 10. doi :10.1038/ng.430. PMC 4915548 . PMID 19684604.

[11] Xu H, Cheng C, Devidas M, Pei D, Fan Y, Yang W, et al. (marzo de 2012). "Los polimorfismos genéticos de ARID5B contribuyen a las disparidades raciales en la incidencia y el resultado del tratamiento de la leucemia linfoblástica aguda infantil". Journal of Clinical Oncology . 30 (7): 751– 7. doi :10.1200/JCO.2011.38.0345. PMC 3295551 . PMID 22291082.