Hispanopedia WikiLa proteína 4 que interactúa con el factor 6 similar a la ADP-ribosilación (ARL6IP4), también llamada SRp25 , es el producto del gen ARL6IP4 ubicado en el cromosoma 12q 24. 31. Se desconoce su función.
Estructura
Tiene una longitud de 360 aminoácidos . Se expresa de forma ubicua, pero solo en la fase G1/S del ciclo celular . [ 5 ] Los ARNm humanos y de ratón de esta proteína tienen un 77 % de homología . [ 6 ]
Se han observado dos tipos de grupos de aminoácidos : un grupo de serina y un grupo básico. [ 6 ]
Función
Se desconocen sus funciones. Sin embargo, debido a la homología de secuencia de su proteína con los factores de empalme SR, se cree ampliamente que la proteína es nuclear y podría desempeñar un papel en la regulación del empalme. [ 6 ] Se cree que la proteína es un mediador en la vía de señalización RAC1 . [ 7 ]
Edición de ARN
El pre-ARNm del producto del gen ARL6IP4 está sujeto a edición de ARN . [ 8 ]
Tipo
La edición de ARN de A a I está catalizada por una familia de adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR), las cuales reconocen específicamente las adenosinas dentro de las regiones de doble cadena de los pre- ARNm y las desaminan a inosina . La maquinaria de traducción celular reconoce las inosinas como guanosina . ADAR 1 y ADAR 2 son los únicos miembros enzimáticamente activos. Se cree que ADAR3 tiene una función reguladora en el cerebro. ADAR1 y ADAR 2 se expresan ampliamente en los tejidos, mientras que ADAR 3 se restringe al cerebro. Las regiones de doble cadena del ARN se forman mediante el apareamiento de bases entre residuos en la región cercana al sitio de edición con residuos generalmente en un intrón vecino , pero también pueden ser una secuencia exónica . La región que se aparea con la región de edición se conoce como Secuencia Complementaria de Edición (ECS).
Ubicación
La edición se produce en un sitio de edición K/R dentro de la posición 225 del aminoácido de la proteína final. Mediante RT-PCR y secuenciación de 100 clones individuales, el 7% de la isoforma 3 de la proteína mostró una G en lugar de una A en esta posición durante la secuenciación. Es posible que existan otros sitios de edición menores, incluyendo algunos en el mismo exón que el sitio de edición principal. Al igual que en el caso de IGFBP7 , la edición del pre-ARNm es inusual, ya que la estructura de plegamiento del ARN está formada únicamente por secuencias exónicas. [ 8 ]
Efectos sobre la estructura de las proteínas
La edición en este sitio produce un cambio de codón de lisina a arginina . Esto ocurre en una región altamente básica de la proteína. [ 8 ]
Efectos sobre la función de las proteínas
La función de la proteína no editada está en gran medida sin caracterizar. Por lo tanto, también se desconoce el efecto de la edición del pre-ARNm sobre la función de las proteínas. El cambio de aminoácido es conservador y es improbable que altere drásticamente la función de la proteína. Sin embargo, el sitio de edición puede ser importante, ya que el aminoácido que se modifica es una lisina , que puede estar implicada en la regulación de la expresión proteica. Las lisinas pueden ser sitios de modificación postraduccional y la conversión de lisina a arginina podría afectar dicha modificación. [ 8 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000182196 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000029404 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ "Gen ARL6IP4 - GeneCards | Proteína AR6P4 | Anticuerpo AR6P4" . Archivado del original el 26 de julio de 2011. Consultado el 14 de febrero de 2011 .
- ^ Sasahara K, Yamaoka T, Moritani M, Tanaka M, Iwahana H, Yoshimoto K, Miyagawa J, Kuroda Y, Itakura M (marzo de 2000 ) . "Clonación molecular y análisis de expresión de una supuesta proteína nuclear, SR-25". Bioquímica. Biofísica. Res. Comunitario . 269 (2): 444– 50. doi : 10.1006/bbrc.2000.2301 . PMID 10708573 .
- ↑ Li Q, Zhao H, Jiang L, Che Y, Dong C, Wang L, Wang J, Liu L (marzo de 2002). "Una proteína SR inducida por la unión del HSVI a las células funciona como un inhibidor del empalme del pre-ARNm viral". J. Mol. Biol . 316 (4): 887–94 . doi : 10.1006/jmbi.2001.5318 . PMID 11884129 .
- 1 2 3 4 Gommans WM, Tatalias NE, Sie CP, Dupuis D, Vendetti N, Smith L, Kaushal R, Maas S (octubre de 2008). " El cribado de la base de datos de SNP humanos identifica sitios de recodificación de la edición de ARN de A a I" . RNA . 14 (10): 2074– 85. doi : 10.1261/rna.816908 . PMC 2553741. PMID 18772245 .
Enlaces externos
- Kiran A, Baranov PV. "DARNED" . Base de datos de edición de ARN . Archivado del original el 21 de julio de 2011. Recuperado el 22 de julio de 2011 .
- Ubicación del genoma humano ARL6IP4 y página de detalles del gen ARL6IP4 en el navegador genómico de UCSC .
- Genes en el cromosoma 12 humano
- Proteínas humanas