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Articulo de referencia

ARMCX6

La proteína Armadillo repeat containing X-linked 6 es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARMCX6 ubicado en el cromosoma X. [ 5 ] Es una de las seis repeticio...

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La proteína Armadillo repeat containing X-linked 6 es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARMCX6 ubicado en el cromosoma X. [ 5 ]

Es una de las seis repeticiones de armadillo que contienen proteínas ligadas al cromosoma X ( ARMCX1 , ARMCX2 , ARMCX3 , ARMCX4 , ARMCX5 y ARMCX6 (esta proteína)).

Por el momento, se desconoce la función de esta proteína.

Secuencia de proteínas

 1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 301 FMSLFIRNGN REILLETPAP

Homología

El gen ARMCX6 se conserva en muchos organismos eucariotas.

Ortólogos

Estructura secundaria

Se predice que la estructura secundaria de ARMCX6 es similar a la de la cianasa. A continuación se muestra una comparación de las dos secuencias. [ 6 ] [ 7 ]

 10 20 30 40 ....*....|....*....|....*....|....*....|....*.. ARMCX6 231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 277 1DW9_A 19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65 + + ++ + + + + + + + + + + ++++
Segmento de cianasa con identidad con ARMCX6.

Expresión

Los datos de microarrays muestran que ARMCX6 se expresa en gran medida durante las primeras etapas de la espermatogénesis en ratones. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000198960 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000050394 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ "Gen Entrez: contiene repeticiones de armadillo" .
  6. ↑ SDSC Biology Workbench 2.0
  7. ↑ "El servicio CBlast se retira" .
  8. ↑ Visor de perfiles EST - Humano
  9. ↑ Visor de perfiles EST - Ratón
  10. ↑ Su AI, Wiltshire T, Batalov S, Lapp H, et al. (abril de 2004). "Un atlas genético de los transcriptomas codificadores de proteínas del ratón y del ser humano" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (16): 6062– 7. Bibcode : 2004PNAS..101.6062S . doi : 10.1073/pnas.0400782101 . PMC 395923. PMID 15075390 .   

Lecturas adicionales

  • Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ, et  al. (2005). "La secuencia de ADN del cromosoma X humano" . Nature . 434 ( 7031): 325–37 . Bibcode : 2005Natur.434..325R . doi : 10.1038/nature03440 . PMC 2665286. PMID 15772651 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et  al. (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et  al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .