Hispanopedia WikiEl motivo de ARN ARRPOF es una estructura de ARN conservada que fue descubierta mediante bioinformática . [1]
La mayoría de los ejemplos de motivos ARRPOF se encuentran en muestras de ADN ambiental y se desconoce el organismo huésped. El único organismo clasificado con un motivo ARRPOF es Fusobacterium nucleatum , y la instancia del motivo ARRPOF se encuentra en el plásmido pKH9.
Se ha planteado la hipótesis de que el motivo ARRPOF está asociado con la replicación del plásmido . [1] El plásmido pKH9 tiene un gen rep . Aunque se sabe que estos genes son necesarios para la replicación de algunos plásmidos, cuando se eliminó este gen rep del plásmido pKH9, el plásmido aún pudo replicarse. [2] Se encontró otra región del plásmido pKH9 que era necesaria para la replicación, [2] y un motivo ARRPOF se encuentra en parte de esta región. [1]
Debido a que la replicación de plásmidos involucra moléculas de ADN que son transitoriamente monocatenarias, también se sugirió [1] que es posible que el motivo ARRPOF funcione como ADN monocatenario y no como ARN. En términos de estructura secundaria , el ARN y el ADN son difíciles de distinguir cuando solo se dispone de información de secuencia.
Referencias
- ^ abcd Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (octubre de 2017). "Detección de 224 ARN estructurados candidatos mediante análisis comparativo de subconjuntos específicos de regiones intergénicas". Nucleic Acids Res . 45 (18): 10811–10823. doi :10.1093/nar/gkx699. PMC 5737381 . PMID 28977401.
- ^ ab Bachrach G, Haake SK, Glick A, Hazan R, Naor R, Andersen RN, Kolenbrander PE (diciembre de 2004). "Caracterización del nuevo plásmido pKH9 de Fusobacterium nucleatum y evidencia de un sistema de adicción". Appl. Environ. Microbiol . 70 (12): 6957–6962. doi :10.1128/AEM.70.12.6957-6962.2004. PMC 535169. PMID 15574887 .