Aaron Stone

Omega Defiance es un grupo malvado compuesto por las siete mentes más brillantes del planeta, a quienes Aaron Stone debe derrotar. El grupo fue reunido originalmente por T. Abner Hall para formar un grupo de expertos con el único propósito de mejorar a la humanidad. Los siete crearon un suero que altera genéticamente el ADN, permitiendo que el sujeto multiplique por diez su inteligencia. Impacientes y ansiosos por probarlo, se lo administraron. Sin embargo, el suero era defectuoso y, en lugar de hacerlos más inteligentes, les distorsionó la mente y los volvió más agresivos. Comenzaron a creer que la humanidad no merecía ser mejorada, así que traicionaron a Hall y ahora desean conquistar el mundo y hacer las cosas a su manera, tomando el control. Todos son supuestamente derrotados por Damaged, un mutante que escapó del laboratorio de investigación llamado Sector 21, en la segunda temporada, excepto el Dr. Necros, quien es hecho prisionero.

• Anthony J. Mifsud como el Dr. Necros: Un químico especializado en la creación de sueros y toxinas peligrosas. Su nombre deriva de un término griego que significa "muerte". Se desconoce qué le sucedió al Dr. Necros tras la captura de Damaged.
• Steven Yaffee como Xero: Un joven ejecutivo corporativo hábil en el manejo de computadoras, pero incapaz de establecer relaciones sociales adecuadas. Xero es el dueño de Xero Industries. Es conocido por luchar mediante el uso de máquinas y tecnología, en lugar de enfrentarse a Aaron cara a cara. Debido a su torpeza social, a menudo se comunica mediante lenguaje de mensajes de texto (por ejemplo, ¡LOL, Stone!). Parece ser el miembro más joven de Omega Defiance. Su nombre probablemente sea una referencia al código binario , siendo el cero uno de los dígitos binarios.
• Xhemi Agaj como Helix: Un genetista especializado en mutaciones genéticas, que combina especies animales y humanas. Tiene acento albanés. Su nombre proviene de la estructura del ADN , que es una doble hélice.
• Tom McCamus como Zefir: Un meteorólogo que en su día se dedicó a usar su genialidad para crear dispositivos que ayudaran a cambiar el mundo. Tras corromperse, su objetivo es crear armas devastadoras que utilizan el clima como parte de la destrucción (por ejemplo, el Láser Relámpago). Se sabe que emplea a un equipo de ninjas (liderado por el ninja jefe "Kwan") para llevar a cabo sus planes. Su nombre deriva del dios griego del viento del oeste, Céfiro .
• Sarain Boylan como Cerebella: Neuróloga especializada en control mental. Su nombre deriva de una región del cerebro llamada cerebelo , responsable de la percepción sensorial, la coordinación y el control motor.
• Michael Copeman como el General Cross: Un general especializado en armamento y asuntos militares. Tiene una gran cicatriz en la cara y suele vestir uniforme militar y boina. El nombre Cross probablemente hace referencia al latín crux, que figurativamente significa tortura. Se confirmó su destrucción en el episodio "Damage Control".
• Kent Staines como Kronis: Un científico especializado en viajes en el tiempo. Su nombre hace referencia a Cronos, el titán griego del tiempo.

Los fugitivos del Sector 21 son un grupo de personas capturadas por la Omega Defiance, quienes experimentaron con ellas, transformándolas en mutantes con poderes asombrosos. Son los principales antagonistas de la segunda temporada. Estuvieron recluidos en un laboratorio secreto llamado Sector 21. Buscan vengarse de la humanidad por los actos de crueldad infligidos por la Omega Defiance. Aaron los capturó uno por uno. Al final de la segunda temporada, todos los mutantes fueron capturados, excepto Ben Slivers, quien trabajó brevemente con Elias Powers y posteriormente encontró la redención.

• Greg Bryk como Damaged: Un mutante rechazado de los experimentos de la Omega Defiance del Sector 21. Escapa y lidera a sus compañeros mutantes contra la Defiance por su crueldad, convirtiéndose en antagonista de Charlie/Aaron Stone. Lleva una máscara de duende andrajosa para cubrir su rostro desfigurado y posee poderes telequinéticos, pero no puede mover lo que no ve. Es responsable de la presunta destrucción de la Omega Defiance y de la captura del Dr. Necros. Es capturado en el final de la serie por Aaron y Jason.
• Scott Yaphe como Ben Slivers: Un mutante tímido que formó parte de un experimento con ratas. Se asusta con facilidad y puede contorsionarse para pasar por espacios reducidos. Charlie le preguntó sobre la conexión de su padre con la Omega Defiance. También le tiene mucho miedo a Damaged, ya que salió corriendo y gritando después de que STAN lo mencionara. Hace una breve aparición en "Mutant Rain (Parte 1)" ayudando a Aaron a capturar a Shackles, pero se revela que trabaja para Elias Powers.
• Matthew G. Taylor como Shackles: Un mutante ruso sometido a experimentos de fuerza por la organización Defiance. Mediante el implante de músculos animales en su cuerpo, se convierte en un monstruo incontrolable con una fuerza descomunal. Además, utiliza las esposas y cadenas de sus muñecas, hechas de titanio irrompible y originalmente usadas para mantenerlo bajo control, como armas. Shackles es capturado por Aaron en "Mutant Rain (Parte 1)".
• Jordan Prentice como Mr. Galapagos: Un pequeño mutante que puede controlar la electricidad. El cuerpo de Galapagos genera energía electromagnética pura, que puede aprovechar para diversos propósitos, siendo el más común las descargas eléctricas. Debe permanecer en una unidad de contención especializada para neutralizar sus poderes. Cuando está fuera de la unidad de contención, proyecta electricidad incontrolablemente, destruyendo todo con lo que entra en contacto. Logró adquirir un prototipo de traje resistente a iones, que le permite salir de su unidad de contención y usar sus poderes solo cuando se quita el traje. A diferencia de los otros mutantes del Sector 21, no sigue a Damaged, y en lugar de destruir el planeta, aspira a gobernarlo. Intentó usar sus poderes para establecerse como gobernante de la Tierra, pero Aaron lo detuvo y dañó su traje, confinándolo a su unidad de contención una vez más. Galapagos entonces aceptó unirse a Damaged a cambio de vengarse de Aaron Stone. En "Sparks" se revela que una vez fue un científico que trabajaba en la batería de fusión forzada, pero fue secuestrado por Omega Defiance y convertido en mutante. Damaged lo traicionó en "Sparks", por lo que Galapagos juró vengarse de Damaged.
• Brittany Gray como Hive: Una mutante (y la única mujer que se muestra) que controla a los insectos. Fue el resultado de un experimento de Helix, quien la fusionó con ADN de insecto. También posee las habilidades de varios insectos, como una increíble capacidad de salto, saliva ácida y la capacidad de lanzar sus uñas como aguijones con púas. Su cuerpo está lleno de un poderoso veneno que puede transformar a las personas en criaturas insectoides como ella, a las que luego puede controlar mediante una señal ultrasónica. En etapas tempranas, sus víctimas actúan como zombis sin mente. Es la segunda mutante capturada por Aaron. Es capturada en "Resident Weevil".
• Marqus Bobesich como Steeltrap: Un criminal mutante que se colocó una cremallera en la boca para mantenerla cerrada y así controlar su poder. Fue sometido a experimentos por el General Cross para ser un prototipo de soldado capaz de generar su propio campo de fuerza. Le inyectaron iones de plasma por la boca, lo que le permitió crear un campo de fuerza de plasma alrededor de su cuerpo, haciéndolo inmune a cualquier daño, pero el experimento también le causó graves trastornos mentales. Cuando tiene la boca cerrada, también puede proyectar los iones de su cuerpo como una onda de calor de plasma. Su única debilidad es que, al abrir la boca, los iones de plasma escapan de su cuerpo y lo dejan sin poderes. Otra debilidad es que, tras disparar tres ondas de calor, su escudo se desactiva y necesita diez segundos para recargarse, lo que lo hace temporalmente vulnerable a los ataques físicos, pero los disparos láser hacen que su escudo se reactive mucho más rápido. Es el primer mutante capturado por Aaron. Es capturado en "My Own Private Superhero".
• Paul Amos como U: Un mutante australiano desfigurado que posee el poder de cambiar de forma. Solo necesita mirar a alguien a la cara, y sus moléculas pueden recrear la imagen, la voz y la ropa de la persona. Su cuerpo también puede imitar objetos inanimados (por ejemplo, cuando hizo que sus manos imitaran un hierro candente; después de ser alcanzado por un láser, pudo imitar el calor del láser). No se sabe mucho sobre su pasado, ha declarado que tenía una vida antes de que Defiance experimentara con él y que era un atleta olímpico, lo cual se demuestra cuando es capaz de luchar de igual a igual contra Aaron. Suplantó a Aaron y secuestró a T. Abner Hall, pero Aaron logró rescatarlo. U es el tercer mutante capturado por Aaron. Es capturado en el episodio "Pack-Man". Escapa en el final de la serie y ayuda a Damaged y Elias Powers con sus planes. U es capturado en el final de la serie, pero disfrazado de Elias Powers, mientras que el verdadero Elias Powers entra en la "Cámara Uriah".