Articulo de referencia

Negativicutes

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Los Negativicutes son una clase de bacterias del filo Bacillota , cuyos miembros poseen una pared celular peculiar con una membrana externa de lipopolisacárido que se tiñe de gramnegativo , a diferencia de la mayoría de los demás miembros de Bacillota . [ 1 ] Aunque varias especies vecinas de Clostridia (bacterias firmes) también se tiñen de gramnegativo, las proteínas responsables de la inusual estructura didérmica de los Negativicutes podrían haber sido adquiridas lateralmente de Pseudomonadota (anteriormente Proteobacteria). [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Se requiere investigación adicional para confirmar el origen de la envoltura celular didérmica en los Negativicutes.

La mayoría de los miembros de esta clase son anaerobios obligados y se encuentran en hábitats como ríos, lagos y el intestino de los vertebrados. Su morfología varía desde formas esféricas, como Megasphaera y Veillonella , hasta bacilos curvos, como los selenomónadas . Selenomonas tiene una característica forma de media luna, con flagelos insertados en el lado cóncavo, mientras que Sporomusa es similar, pero inmóvil. Sus nombres hacen referencia a esta morfología distintiva: selene significa luna y musa significa plátano . [ 5 ]

Taxonomía

Actualmente, la clase consta de 32 géneros válidamente nombrados distribuidos en tres órdenes y cuatro familias. [ 6 ] [ 7 ] Los órdenes Veillonellales y Acidaminococcales contienen cada uno una sola familia, Veillonellaceae y Acidaminococcaceae , respectivamente, mientras que el orden Selenomonadales contiene dos familias, Selenomonadaceae y Sporomusaceae. [ 7 ]

Firmas moleculares

Históricamente, los Negativicutes consistían en un solo orden, los Selenomonadales, y dos familias, Veillonellaceae y Acidaminococcaceae, según la similitud de la secuencia del gen ARNr 16S. [ 8 ] [ 5 ] Sin embargo, estas agrupaciones no incluían a varios miembros dentro de los Negativicutes que se ramificaban fuera de las dos familias. La visión taxonómica actual incluye a estos miembros que han sido asignados válidamente a las familias Selenomonadaceae y Sporomusaceae dentro del orden Selenomonadales enmendado. [ 7 ] Los marcadores moleculares en forma de inserciones/deleciones de firma conservadas (CSI) y proteínas (CSP) justifican las divisiones taxonómicas actuales. Estos marcadores moleculares se encuentran en cada rango taxonómico, y su distribución concuerda con la ramificación filogenética observada. [ 9 ] [ 10 ]

Numerosos trabajos han sugerido que los Negativicutes deberían reclasificarse como un orden dentro de la clase Clostridia , basándose en la ramificación filogenética cercana y en la observación de que los miembros formadores de esporas de los Negativicutes comparten genes de esporulación similares a los de los Clostridia, y que ambos se tiñen de gramnegativo. [ 9 ] [ 10 ] Sin embargo, la heterogeneidad de los miembros dentro de los Negativicutes, así como la distribución de firmas moleculares, apoya la visión de que los Negativicutes son, de hecho, una clase independiente dentro de los Bacillota, con los Clostridia como sus vecinos filogenéticos más cercanos. [ 5 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Además, se ha encontrado que varios CSI y CSP son compartidos exclusivamente entre todos los Negativicutes, mientras que no se ha encontrado ningún CSI compartido tanto por Negativicutes como por Clostridia . [ 7 ]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 13 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 14 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Sutcliffe IC (2010). "Una perspectiva a nivel de filo sobre la arquitectura de la envoltura celular bacteriana" . Trends Microbiol . 18 (10): 464– 470. doi : 10.1016/j.tim.2010.06.005 . PMID 20637628 . 
  2. Gupta RS (2011). "Origen de las bacterias didérmicas (gramnegativas): la presión selectiva de los antibióticos, más que la endosimbiosis, probablemente condujo a la evolución de células bacterianas con dos membranas" . Antonie van Leeuwenhoek . 100 (2): 171– 182. doi : 10.1007/s10482-011-9616-8 . PMC 3133647. PMID 21717204 .  
  3. Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). "Análisis comparativo del proteoma de Acidaminococcus intestini respalda una relación entre la biogénesis de la membrana externa en Negativicutes y Proteobacteria" ( PDF) . Arch Microbiol . 196 (4): 307–310 . doi : 10.1007/s00203-014-0964-4 . PMID 24535491. S2CID 253722630 .  
  4. Tocheva EI, Matson EG, Morris DM, Moussavi F, Leadbetter JR, Jensen GJ (2011). "Remodelación del peptidoglicano y conversión de una membrana interna en una membrana externa durante la esporulación" . Cell . 146 ( 5): 799–812 . doi : 10.1016/j.cell.2011.07.029 . PMC 3176627. PMID 21884938 .  
  5. 1 2 3 Marchandin, H.; Teyssier, C.; Campos, J.; Jean-Pierre, H.; Roger, F.; Gay, B.; Carlier, J. -P.; Jumas-Bilak, E. (2009). " Negativicoccus succinicivorans gen. nov., sp. nov., aislado de muestras clínicas humanas, descripción enmendada de la familia Veillonellaceae y descripción de Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. nov. y Acidaminococcaceae fam. nov. en el filo bacteriano Firmicutes " . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 60 (6): 1271– 1279. doi : 10.1099/ijs.0.013102-0 . PMID 19667386 . 
  6. Sayers; et al. "Negativicutes" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de marzo de 2013 . 
  7. 1 2 3 4 Campbell C, Adeolu M, Gupta RS (2015). "Marco taxonómico basado en el genoma para la clase Negativicutes: división de la clase Negativicutes en los órdenes Selenomonadales emend., Acidaminococcales ord. nov. y Veillonellales ord. nov." . Int J Syst Evol Microbiol . 65 (9): 3203– 3215. doi : 10.1099/ijs.0.000347 . PMID 25999592 . 
  8. Ludwig W, Schleifer KH, Whitman, WB (2009) Mapa de ruta revisado del filo Firmicutes. En: Manual de Bacteriología Sistemática de Bergey, vol. 3, 2.ª ed., pp. 1–13. Eds. P. De Vos, GM Garrity, D. Jones, NR Krieg, W. Ludwig, FA Rainey, KH Schleifer y WB Whitman Springer-: Nueva York.
  9. 1 2 Yutin N, Galperin MY (2013). "Una actualización genómica sobre la filogenia de los clostridios: formadores de esporas gramnegativos y otros clostridios mal ubicados" . Environ Microbiol . 15 (10): 2631– 2641. doi : 10.1111/1462-2920.12173 . PMC 4056668. PMID 23834245 .  
  10. 1 2 3 Vesth T, Ozen A, Andersen SC, Kaas RS, Lukjancenko O, Bohlin J, Nookaew I, Wassenaar TM, Ussery DW (2013). "Veillonella, Firmicutes: Microbios disfrazados de Gram negativos" . Stand Genomic Sci . 9 (2): 431– 448. doi : 10.4056/sigs.2981345 . PMC 4062629. PMID 24976898 .  
  11. Merchandin H, Jumas-Bilak E (2014) La familia Veillonellaceae. En: The Prokaryotes, vol. 7, 4.ª ed., pp. 433–453. Eds. E. Rosenberg, E. DeLong, S. Lory, E. Stackebrandt y F. Thompson Springer-: Berlín, Heidelberg.
  12. Yilmaz P, Parfrey LW, Yarza P, Gerken J, Pruesse E, Quast C, Schweer T, Peplies J, Ludwig W, Glöckner FO (2014). "Los marcos taxonómicos SILVA y "All-species Living Tree Project (LTP)"" . Nucleic Acids Res . 42 (número especial de bases de datos): D643–8. doi : 10.1093 / nar/gkt1209 . PMC 3965112. PMID 24293649 .  
  13. Negativicutes en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
  14. Schoch CL; et al. "Negativicutes" . Base de datos taxonómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2025 . 
  15. "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  16. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  17. "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  18. "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  19. "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  20. "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
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