Adaptador (genética)

Un adaptador o adaptador en ingeniería genética es un oligonucleótido corto, sintetizado químicamente, de doble cadena que puede ligarse a los extremos de otras moléculas de ADN o ARN. Los adaptadores de doble cadena se diferencian de los enlazadores en que contienen un extremo romo y un extremo cohesivo. ^{[ 1 ]} Por ejemplo, un adaptador de ADN de doble cadena puede usarse para unir los extremos de otras dos moléculas de ADN (es decir, extremos que no tienen "extremos cohesivos", es decir, cadenas simples complementarias que sobresalen por sí mismas). Puede usarse para agregar extremos cohesivos al ADNc, lo que permite que se ligue al plásmido de manera mucho más eficiente. ^{[ 2 ]} Dos adaptadores podrían aparearse entre sí para formar dímeros .

Un adaptador de conversión se utiliza para unir un fragmento de ADN cortado con una enzima de restricción , por ejemplo EcoRL , con un vector abierto con otra enzima, BamHL . Este adaptador puede utilizarse para convertir el extremo cohesivo producido por BamHL en uno producido por EcoRL, o viceversa. Una de sus aplicaciones es la ligación de ADNc en un plásmido ^{[ 3 ]} u otros vectores, en lugar de utilizar la enzima desoxinucleótido transferasa terminal para añadir poli(A) al fragmento de ADNc. ^{[ 4 ]}

Los adaptadores NGS son fragmentos cortos de aproximadamente 80 pares de bases que se unen al ADN para facilitar la amplificación durante la preparación de la biblioteca y también son útiles para unir el ADN a la celda de flujo durante la secuenciación. ^{[ 5 ]} Estos adaptadores están compuestos por tres partes que flanquean la secuencia de ADN de interés. Hay una secuencia de unión a la celda de flujo, un sitio de unión del cebador y también regiones con códigos de barras para permitir la secuenciación en grupos.