En enzimología , una agmatinasa ( EC 3.5.3.11) es una enzima que cataliza la reacción química
- agmatina + H 2 O putrescina + urea
Así, los dos sustratos de esta enzima son la agmatina y el H2O , mientras que sus dos productos son la putrescina y la urea .
Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas , aquellas que actúan sobre enlaces carbono-nitrógeno distintos de los enlaces peptídicos, específicamente en amidinas lineales. El nombre sistemático de esta clase de enzimas es agmatina amidinohidrolasa . Otros nombres de uso común incluyen agmatina ureohidrolasa . Esta enzima participa en el ciclo de la urea y el metabolismo de los grupos amino .
Genética
En los humanos, la enzima está codificada por el gen AGMAT . [5] [6] [7] [8]
Estudios estructurales
A finales de 2007, se han resuelto cinco estructuras para esta clase de enzimas, con los códigos de acceso PDB 1GQ6, 1GQ7, 1WOG, 1WOH y 1WOI.
Inhibidores
- Piperazina-1-carboxamidina
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000116771 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000040706 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Mistry SK, Burwell TJ, Chambers RM, Rudolph-Owen L, Spaltmann F, Cook WJ, Morris SM Jr (enero de 2002). "Clonación de la agmatinasa humana. Una vía alternativa para la síntesis de poliaminas inducida en el hígado por el virus de la hepatitis B". Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol . 282 (2): G375–81. doi :10.1152/ajpgi.00386.2001. PMID 11804860.
- ^ Dallmann K, Junker H, Balabanov S, Zimmermann U, Giebel J, Walther R (diciembre de 2003). "La agmatinasa humana está disminuida en el tipo de células claras del carcinoma de células renales". Int J Cancer . 108 (3): 342–7. doi : 10.1002/ijc.11459 . PMID 14648699. S2CID 31927397.
- ^ Iyer RK, Kim HK, Tsoa RW, Grody WW, Cederbaum SD (marzo de 2002). "Clonación y caracterización de la agmatinasa humana". Mol Genet Metab . 75 (3): 209–18. doi :10.1006/mgme.2001.3277. PMID 11914032.
- ^ "Entrez Gene: AGMAT agmatina ureohidrolasa (agmatinasa)".
- Morris SM (2004). "Agmatinasas de vertebrados: ¿qué papel desempeñan en el catabolismo de la agmatina?". Ann. NY Acad. Sci . 1009 : 30–3. doi :10.1196/annals.1304.003. PMID 15028567. S2CID 24146429.
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Chen FW, Davies JP, Ioannou YA (1998). "Expresión génica diferencial en la apoptosis: identificación de la proteína ribosomal 23K, un inhibidor de la proliferación celular". Mol. Genet. Metab . 64 (4): 271–82. doi :10.1006/mgme.1998.2718. PMID 9758718.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID: 14702039.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
- Kim KH, Ahn HJ, Kim DJ, et al. (2006). "Expresión, cristalización y análisis cristalográfico preliminar de rayos X de la agmatinasa humana". Acta Crystallographica Sección F. 61 ( Pt 10): 889–91. doi :10.1107/S1744309105027193. PMC 1991308. PMID 16511187 .
- Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). "La secuencia de ADN y la anotación biológica del cromosoma humano 1". Nature . 441 (7091): 315–21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
- Hirshfield IN, Rosenfeld HJ, Leifer Z, Maas WK (1970). "Aislamiento y caracterización de un mutante de Escherichia coli bloqueado en la síntesis de putrescina". J. Bacteriol . 101 (3): 725–30. doi :10.1128/JB.101.3.725-730.1970. PMC 250384 . PMID 4908780.
- Vicente C, Legaz ME (1982). "Preparación y propiedades de la agmatina amidinohidrolasa de Evernia prunastri". Physiol. Plant . 55 : 335–339. doi :10.1111/j.1399-3054.1982.tb00301.x.
- agmatinasa en los encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
Enlaces externos
- Página de detalles del gen AGMAT y ubicación del genoma humano en el navegador de genomas de la UCSC .