Amidasa

En enzimología , una amidasa ( EC 3.5.1.4 , acilamidasa , acilasa (engañoso) , amidohidrolasa (ambiguo) , desaminasa (ambiguo) _, acilamidasa grasa , N-acetilaminohidrolasa (ambiguo) ) es una enzima que cataliza la hidrólisis de una amida. De esta manera, los dos sustratos de esta enzima son una amida y H₂O , mientras que sus dos productos son monocarboxilato y NH₃ _.

Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas . El nombre sistemático de esta clase de enzimas es acilamida amidohidrolasa . Otros nombres de uso común incluyen acilamidasa , acilasa , amidohidrolasa , desaminasa , acilamidasa grasa y N-acetilaminohidrolasa . Esta enzima participa en 6 vías metabólicas : ciclo de la urea y metabolismo de grupos amino , metabolismo de la fenilalanina , metabolismo del triptófano , metabolismo de los cianoaminoácidos , degradación del benzoato mediante ligación de la coadyuvancia y degradación del estireno .

Las amidasas contienen una secuencia conservada de aproximadamente 130 aminoácidos conocida como secuencia AS . Están ampliamente distribuidas, encontrándose tanto en procariotas como en eucariotas . Las enzimas AS catalizan la hidrólisis de enlaces amida (CO-NH₂ ₎ , aunque la familia ha divergido ampliamente en cuanto a la especificidad del sustrato y la función. No obstante, estas enzimas mantienen una estructura central alfa/beta/alfa, donde las topologías de las mitades N- y C-terminales son similares. Las enzimas AS se caracterizan por tener una región C-terminal altamente conservada , rica en residuos de serina y glicina, pero desprovista de residuos de ácido aspártico e histidina ; por lo tanto, difieren de las hidrolasas de serina clásicas . Estas enzimas poseen una tríada catalítica Ser-Ser-Lys única y altamente conservada que se utiliza para la hidrólisis de amida, aunque el mecanismo catalítico para la formación del intermedio acil-enzima puede diferir entre las enzimas. ^{[ 1 ]}

Algunos ejemplos de enzimas que contienen la firma de AS son:

• La amidasa peptídica (Pam), ^{[ 1 ]} que cataliza la hidrólisis del enlace amida C-terminal de los péptidos .
• Las amida hidrolasas de ácidos grasos , ^{[ 2 ]} que hidrolizan los sustratos de amida de ácidos grasos (por ejemplo, el cannabinoide anandamida y la oleamida inductora del sueño), controlan así el nivel y la duración de la señalización inducida por esta diversa clase de transmisores lipídicos .
• Malonamidasa E2, ^{[ 3 ]} que cataliza la hidrólisis del malonamato en malonato y amoníaco, y que participa en el transporte de nitrógeno fijado desde los bacteroides a las células vegetales en el metabolismo simbiótico del nitrógeno .
• Subunidad A de la Glu-tRNA(Gln) amidotransferasa, ^{[ 4 ]} una enzima heterotrimérica que cataliza la formación de Gln-tRNA(Gln) mediante la transamidación de Glu-tRNA(Gln) mal acilado a través de la amidolisis de glutamina .

A finales de 2018, se habían resuelto 162 estructuras para esta familia, a las que se puede acceder en el archivo Pfam (2021-09-18) en Wayback Machine .

• Bray HG, James SP, Raffan IM, Ryman BE, Thorpe WV (1949). "El destino de ciertos ácidos orgánicos y amidas en el conejo. 7. Una amidasa del hígado de conejo" . Biochem. J. 44 ( 5): 618– 625. doi : 10.1042/bj0440618 . PMC 1274617 . 
• Bray HG, James SP, Thorpe WV, Wasdell MR (1950). "El destino de ciertos ácidos orgánicos y amidas en el conejo. 11 Observaciones adicionales sobre la hidrólisis de amidas por extractos de tejido" . Biochem. J. 47 ( 3): 294–299 . doi : 10.1042/ bj0470294 . PMC 1275209. PMID 14800883 .