Hispanopedia WikiAnatomography es un sitio web interactivo que permite generar diagramas anatómicos y animaciones del cuerpo humano . El sitio web de Anatomography es mantenido por el instituto de investigación sin fines de lucro DBCLS (Database Center for Life Science) ubicado en la Universidad de Tokio . Los diagramas anatómicos generados por Anatomography y los datos de polígonos 3D utilizados en el sitio web (llamados BodyParts3D) están disponibles de forma gratuita bajo la licencia Creative Commons Attribution-ShareAlike . [2]
Descripción
Anatomography fue lanzado el 9 de febrero de 2009 [1] por el fundador y director principal Kousaku Okubo , profesor del Banco de Datos de ADN de Japón en el Instituto Nacional de Genética .
Los datos de polígonos del cuerpo humano utilizados en el sitio se denominan " BodyParts3D ". [3] Los datos de polígonos de BodyParts3D se extraen de imágenes de resonancia magnética de cuerpo completo . El conjunto de imágenes de resonancia magnética en el que se basa BodyParts3D se llama "TARO". Taro es un nombre común para los hombres en japonés, como John en inglés. TARO es un conjunto de datos de vóxeles de 2 mm * 2 mm * 2 mm del hombre humano creado por el Instituto Nacional de Tecnología de la Información y las Comunicaciones . [4] TARO se publicó de forma gratuita en noviembre de 2004. [5] [6]
El proceso de construcción de BodyParts3D es el siguiente. [3]
- Fase 1: Se introdujeron segmentaciones anatómicas adicionales en los datos originales de TARO.
- Fase 2: Luego, se complementaron los detalles faltantes y se aclararon los contornos borrosos utilizando un programa de edición 3D consultando libros de texto, atlas [7] y modelos de maquetas de ilustradores médicos.
- Fase 3: Se continuará con la segmentación y modificación de datos en colaboración con investigadores clínicos hasta que se logre una cobertura conceptual suficiente.
Los datos de polígonos de BodyParts3D se distribuyen en formato de archivo OBJ . El tamaño del archivo de datos completo es de 127 MB (polígono reducido) y 521 MB (alta calidad) a partir de la versión 3.0. [8] La cantidad de partes del cuerpo (órganos) registradas en BodyParts3D es de 1523 a partir de la versión 3.0. [7]
Licencia
Las imágenes generadas por Anatomography y los datos poligonales incluidos en BodyParts3D están licenciados bajo la licencia Creative Commons , [2] con la esperanza de ampliar su uso y democratizar el conocimiento médico. [9]
Fondos
El proyecto BodyParts3D/Anatomography fue financiado por el MEXT ( Ministerio de Educación, Cultura, Deportes, Ciencia y Tecnología de Japón ) desde el año fiscal 2007 hasta el año fiscal 2010. [10] [11] A partir del año fiscal 2011, el proyecto ha sido financiado por la JST ( Agencia de Ciencia y Tecnología de Japón ). [11]
Recepción
Los diagramas de Anatomography se utilizan, por ejemplo, en el programa de televisión canadiense de ciencia Le code Chastenay, [12] en la enciclopedia de Internet Wikipedia, como material de lectura en universidades y en otros lugares para compartir conocimientos. [9] Sobre el uso de Anatomography en sitios web como Wikipedia y Wikimedia Commons, los desarrolladores dicen que "la difusión de usos por parte de usuarios anónimos en sitios como Wikipedia y Wikimedia Commons es lo que esperábamos". [9]
Características técnicas
El proyecto BodyParts3D/Anatomography utiliza el Modelo Fundacional de Anatomía (FMA, por sus siglas en inglés). El FMA es una ontología anatómica de código abierto desarrollada y mantenida por el Grupo de Informática Estructural de la Universidad de Washington . En BodyParts3D, cada parte del cuerpo se gestiona mediante un identificador FMA (FMAID) definido por el FMA. Por ejemplo, la columna vertebral se registra como FMA13478 , el lóbulo temporal se registra como FMA61825 , y así sucesivamente.
Historial de versiones
- Versión 1.0 (9 de febrero de 2009) [1]
- Versión 2.0 (28 de abril de 2010) [13] El número total de partes del cuerpo es 1.324. [14]
- Versión 3.0 (20 de junio de 2011) El número total de partes del cuerpo es 1.523. [7]
- Versión 4.0 (16 de mayo de 2013) [15]
Servicios similares
- BioDigital Human: servicio web gratuito y producto comercial proporcionado por BioDigital , Inc., con sede en Nueva York, Nueva York, EE. UU. BioDigital Human se publicó en 2011. El sitio web ganó un premio interactivo SXSW en 2013.
Otros
Hay algunos videos tutoriales sobre el uso de la anatomografía disponibles en YouTube , [16] consulte los enlaces externos.
Imágenes adicionales
-
Huesos y músculos. -
Corazón y sus vasos sanguíneos . -
Cráneo y globos oculares. -
Cerebro y lóbulo frontal . -
Impresión 3D de datos de los huesos del pie de BodyParts3D. -
Pintura de colores sobre datos poligonales de vértebras cervicales , incluidos en los datos de BodyParts3D, utilizando MeshLab . -
Datos poligonales de BodyParts3D descargados, editados con Blender . -
![El director jefe Kousaku Okubo en la conferencia de la Universidad de Tokio.[17]](https://images.hispanopedia.wiki/wikipedia/commons/thumb/d/d3/Dr_ohkubo.png/500px-Dr_ohkubo.png)
El director jefe Kousaku Okubo en la conferencia de la Universidad de Tokio. [17]
![El director jefe Kousaku Okubo en la conferencia de la Universidad de Tokio.[17]](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d3/Dr_ohkubo.png/1280px-Dr_ohkubo.png)
Véase también
Referencias
- ^ Notas de la versión de abc (en japonés). DBCLS. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ Preguntas frecuentes de abc - crédito. (en japonés) DBCLS. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ ab Mitsuhashi, N; Fujieda, K; Tamura, T; Kawamoto, S; Takagi, T; Okubo, K (2009). "BodyParts3D: base de datos de estructura 3D para conceptos anatómicos". Nucleic Acids Research . 37 (número de base de datos): D782–5. doi :10.1093/nar/gkn613. PMC 2686534 . PMID 18835852.
- ^ Nagaoka, T; Watanabe, S; Sakurai, K; Kunieda, E; Watanabe, S; Taki, M; Yamanaka, Y (2004). "Desarrollo de modelos de vóxeles de cuerpo entero realistas de alta resolución de hombres y mujeres adultos japoneses de altura y peso promedio, y aplicación de modelos a la dosimetría de campos electromagnéticos de radiofrecuencia". Física en Medicina y Biología . 49 (1): 1–15. Bibcode :2004PMB....49....1N. doi :10.1088/0031-9155/49/1/001. PMID 14971769.
- ^ 日本人の数値人体モデルDB「TARO」と「HANAKO」公開 10/11/2004 (en japonés). Medios de TI. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ 報道発表:日本人平均成人男女の数値人体モデルデータベース公開のお知らせ 2004-11-10 (en japonés). Instituto Nacional de Tecnologías de la Información y las Comunicaciones. Consultado el 12 de octubre de 2012.
- ^ Nota de la versión de abc BodyParts3D (versión 3.0, 20/6/2011) [ enlace muerto permanente ] DBCLS. Consultado el 15/10/2012.
- ^ Descargar - BodyParts3D DBCLS. Consultado el 15 de octubre de 2012.
- ^ abc 三橋 信孝、藤枝 香、今井 紫緒、武藤 勇、田村 卓郎、川本 祥子、高木 利久、大久保 公策「BodyParts3DとAnatomografía: 医学での情報共有を「動機付ける」素材」(en japonés) [ enlace muerto permanente ]シンポジウム「ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～」/ Nobutaka Mitsuhashi, Kaori Fujieda, Shio Imai, Isamu Muto, Takuro Tamura, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi y Kousaku Okubo "BodyParts3D y Anatomografía: Materiales que motivan el intercambio de información en medicina" Presentación de póster en el "Simposio: Hacia el futuro de las ciencias de la vida - Thinking Databases of 10 años después" celebrada en la Universidad de Tokio el 5 de octubre de 2010. Recuperado el 12 de octubre de 2012.
- ^ Descripción de la base de datos de BodyParts3D Archivo de base de datos de ciencias biológicas. Consultado el 19 de octubre de 2012.
- ^ Preguntas frecuentes sobre el Centro de bases de datos para las ciencias de la vida (DBCLS) Archivado el 30 de enero de 2013 en Wayback Machine . Consultado el 19 de octubre de 2012.
- ^ 「LE CODE CHASTENAY」Emisión 48 Archivado el 4 de marzo de 2016 en Wayback Machine , emitido el 19 de enero de 2010
- ^ "BodyParts3D/Anatomography" Actualizaciones Archivado el 5 de junio de 2010 en Wayback Machine . Publicado el 28 de abril de 2010. DBCLS. Consultado el 16 de octubre de 2012.
- ^ Nota de la versión de BodyParts3D (versión 2.0, 28/4/2010) DBCLS. Consultado el 15/10/2012.
- ^ "Notas de la versión de BodyParts3D, v4.0". Consultado el 18 de noviembre de 2015.
- ^ Kawano, S; Ono, H; Takagi, T; Bono, H (2012). "Vídeos tutoriales de recursos bioinformáticos: ensayo de distribución en línea en Japón denominado TogoTV". Briefings in Bioinformatics . 13 (2): 258–68. doi :10.1093/bib/bbr039. PMC 3294242 . PMID 21803786.
- ^ Conferencia "Equilibrio entre la protección de la propiedad intelectual y el uso compartido de datos en la ciencia", celebrada en la Universidad de Tokio, 5 de octubre de 2009. Presentación de Okubo en japonés Archivado el 10 de junio de 2013 en Wayback Machine , justo antes de la conferencia de Lawrence Lessig . Vídeos completos de cada conferencia están disponibles en la página del programa del sitio web de la conferencia (en parte en japonés, en parte en inglés) Archivado el 4 de febrero de 2013 en Wayback Machine .
Enlaces externos
