Archaeopteryx (software)

Archaeopteryx es un programa informático interactivo , escrito en Java , para visualizar , editar y analizar árboles filogenéticos . Este tipo de programa puede utilizarse para diversos análisis de conjuntos de datos moleculares , pero está especialmente diseñado para la filogenómica . Además de formatos de descripción de árboles con expresividad limitada (como Newick/New Hampshire y Nexus), también implementa el formato phyloXML ^{[ 1 ]} . Archaeopteryx es el sucesor del programa Java A Tree Viewer (ATV) ^{[ 2 ] .}

Referencias

↑ Han, Mira V.; Zmasek, Christian M. (2009). " phyloXML: XML para biología evolutiva y genómica comparativa" . BMC Bioinformatics . 10 : 356. doi : 10.1186/1471-2105-10-356 . PMC 2774328. PMID 19860910 .
↑ Zmasek, Christian M.; Eddy, Sean R. (2001). "ATV: visualización y manipulación de árboles filogenéticos anotados" . Bioinformatics . 17 (4): 383– 384. doi : 10.1093/bioinformatics/17.4.383 . PMID 11301314 .

Enlaces externos

phyloXML
Lista de software de filogenia alojado en la Universidad de Washington.
Arqueoptérix

[1] Han, Mira V.; Zmasek, Christian M. (2009). " phyloXML: XML para biología evolutiva y genómica comparativa" . BMC Bioinformatics . 10 : 356. doi : 10.1186/1471-2105-10-356 . PMC 2774328. PMID 19860910 .

[2] Zmasek, Christian M.; Eddy, Sean R. (2001). "ATV: visualización y manipulación de árboles filogenéticos anotados" . Bioinformatics . 17 (4): 383– 384. doi : 10.1093/bioinformatics/17.4.383 . PMID 11301314 .

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