Armatimonadota

Armatimonadota es un filo de bacterias gramnegativas .

Historia

Armatimonadota se describió originalmente basándose únicamente en secuencias clonadas del gen 16S rRNA ambiental , y se denominó temporalmente filo candidato OP10. Sin embargo, en 2011 se aisló una cepa bacteriana perteneciente a este filo de una planta acuática en Japón. La especie se denominó Armatimonas rosea y fue el primer miembro de su filo, género y especie. ^{[ 2 ]}

Miembros

Armatimonas rosea , una bacteria quimioheterótrofa aerobia, cepa YO-36T, fue aislada de la rizoplana de una planta acuática (un carrizo, Phragmites australis ) que habita en un lago de agua dulce en Japón.^{[ 2 ]}

Chthonomonas calidirosea , una bacteria aerobia, sacarolítica , termófila obligada, móvil y no formadora de esporas, cepa T49(T), fue aislada de suelo calentado geotérmicamente en Hell's Gate, Tikitere, Nueva Zelanda.^{[ 3 ]}

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) ^{[ 10 ]} y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). ^{[ 11 ]}

Clase "Zipacnadia" Carlton et al. 2023
- Orden "Zipacnadales" Carlton et al. 2023
  - Familia "Zipacnadaceae" Carlton et al. 2023
    - Género " Candidatus Zipacnadum " Carlton et al. 2023
      - Especie " Ca. Z. vermilionense" Carlton et al. 2023
Clase "Heboniibacteriia" correg. Carlton et al. 2023
- Orden "Heboniibacterales" corrig. Carlton et al. 2023
  - Familia "Heboniibacteraceae" corrig. Carlton et al. 2023
    - Género " Candidatus Heboniibacterum " corrig. Carlton y cols. 2023
      - Especie " Ca. H. abditum" corrig. Carlton y cols. 2023
Clase UBA5829
- Pedido UBA5829
  - Familia UBA5829
    - Género " Candidatus Hippobium " Gilroy et al. 2022
      - Especie " Ca. H. faecium" Gilroy et al. 2022
Clase Fimbriimonadia Im et al. 2012
- Orden Fimbriimonadales Im et al. 2012
  - Familia Fimbriimonadaceae Im et al. 2012
    - Género Fimbriimonas Im et al. 2012
      - Especie F. ginsengisoli Im et al. 2012
    - Género " Candidatus Nitrosymbiomonas " Okubo et al. 2021
      - Especie " Ca. N. proteolyticus" Okubo et al. 2021
Clase Chthonomonadia corrig. Lee et al. 2011
- Orden Chthonomonadales Lee et al. 2011
  - Familia Chthonomonadaceae Lee et al. 2011
    - Género Chthonomonas Lee et al. 2011
      - Especies C. calidirosea Lee et al. 2011
Clase Armatimonadia Tamaki et al. 2011
- Orden Armatimonadales Tamaki et al. 2011
  - Familia Armatimonadaceae Tamaki et al. 2011
    - Género Armatimonas Tamaki et al. 2011
      - Especie A. rosea Tamaki et al. 2011
- Orden Capsulimonadales Li, Kudo & Tonouchi 2018
  - Familia Capsulimonadaceae Li, Kudo y Tonouchi 2018
    - Género Capsulimonas Li, Kudo y Tonouchi 2018
      - Especie C. corticalis Li, Kudo y Tonouchi 2018

Notas

Referencias

↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas" . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .
1 2 Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). " Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., una bacteria quimioheterotrófica, aeróbica y gramnegativa de un nuevo filo bacteriano, Armatimonadetes phyl. nov., formalmente llamado filo candidato OP10" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 61 (parte 6): 1442– 7. doi : 10.1099/ijs.0.025643-0 . PMID 20622056 .
↑ Lee, Kevin CY; Dunfield, Peter F.; Morgan, Xochitl C.; Crowe, Michelle A.; Houghton, Karen M.; Vyssotski, Mikhail; Ryan, Jason LJ; Lagutin, Kirill; et al. (2010). " Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., un microorganismo termófilo, pigmentado y aerobio de una nueva clase bacteriana, Chthonomonadetes classis. nov., del filo Armatimonadetes recientemente descrito , originalmente designado como división candidata OP10" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 61 (Pt 10): 2482–90 . doi : 10.1099/ijs.0.027235-0 . PMID 21097641 .
↑ "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
↑ "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
↑ "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
↑ Armatimonadota en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
↑ Schoch CL; et al. "Armatimonadota" . Base de datos taxonómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2025 .

[1] Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas" . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .

[pmid20622056-2] 1 2 Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). " Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., una bacteria quimioheterotrófica, aeróbica y gramnegativa de un nuevo filo bacteriano, Armatimonadetes phyl. nov., formalmente llamado filo candidato OP10" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 61 (parte 6): 1442– 7. doi : 10.1099/ijs.0.025643-0 . PMID 20622056 .

[pmid21097641-3] Lee, Kevin CY; Dunfield, Peter F.; Morgan, Xochitl C.; Crowe, Michelle A.; Houghton, Karen M.; Vyssotski, Mikhail; Ryan, Jason LJ; Lagutin, Kirill; et al. (2010). " Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., un microorganismo termófilo, pigmentado y aerobio de una nueva clase bacteriana, Chthonomonadetes classis. nov., del filo Armatimonadetes recientemente descrito , originalmente designado como división candidata OP10" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 61 (Pt 10): 2482–90 . doi : 10.1099/ijs.0.027235-0 . PMID 21097641 .

[4] "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .

[5] "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .

[6] "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .

[about-7] "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

[tree_bac-8] "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

[taxon_history-9] "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

[LPSN-10] Armatimonadota en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .

[NCBI-11] Schoch CL; et al. "Armatimonadota" . Base de datos taxonómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2025 .

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 10 ]

[ 11 ]