El Atlas de Actividad Reguladora de UTR ( AURA ), [ 1 ] una base de datos biológica , ahora en su segunda versión, [ 2 ] es un catálogo exhaustivo y curado manualmente de secuencias no traducidas 5' y 3' humanas (UTR) y anotaciones reguladoras de UTR. Incluye anotaciones básicas, conservación filogenética, sitios de unión para proteínas de unión a ARN y miRNA, elementos cis, datos de metilación y edición de ARN, y más, para humanos y ratones. A través de su interfaz web intuitiva, proporciona acceso completo a una gran cantidad de información que integra datos de secuencia y estructura de ARN, sitios de variación, sintenia génica, expresión génica y proteica, y descripciones funcionales de genes de la literatura científica y bases de datos especializadas. Finalmente, proporciona varias herramientas para el análisis por lotes de listas de genes, lo que permite el seguimiento de redes reguladoras postranscripcionales.
Véase también
Referencias
- ^ Dassi, E; Malossini A; Re A; Mazza T; Tebaldi T; Caputi L; Quattrone A (enero de 2012). «AURA: Atlas de la Actividad Regulatoria de la UTR» . Bioinformática . 28 (1). Inglaterra: 142– 143. doi : 10.1093/bioinformatics/btr608 . PMID 22057158 .
- ^ Dassi, E; Re A; Leo S; Tebaldi T; Pasini L; Peroni D; Quattrone A (enero de 2014). "AURA 2: potenciar el descubrimiento de redes postranscripcionales" . Traducción . 2 (1) e27738. Inglaterra: Taylor y Francis. doi : 10.4161/trla.27738 . PMC 4705823 . PMID 26779400 .
Enlaces externos
- http://aura.science.unitn.it/ .
- Bases de datos biológicas
- proteínas de unión al ARN
- ARN
- Esbozos de bases de datos biológicas