En biología , un autoinductor es una molécula de señalización que permite la detección y respuesta a cambios en la densidad poblacional de células bacterianas . Sintetizados durante la reproducción bacteriana, los autoinductores salen de la bacteria y se dispersan en el medio circundante. [ 1 ] Son un componente clave del fenómeno de detección de quórum : a medida que aumenta la densidad de células bacterianas que detectan el quórum, también aumenta la concentración del autoinductor. La detección por parte de una bacteria de un autoinductor por encima de un umbral mínimo desencadena una alteración en la expresión génica . [ 2 ] [ 3 ]
Realizada tanto por bacterias Gram negativas como Gram positivas , la detección de autoinductores les permite detectarse entre sí y regular una amplia variedad de actividades fisiológicas, incluyendo la simbiosis , la virulencia , la motilidad , la producción de antibióticos y la formación de biopelículas . [ 4 ]
Los autoinductores adoptan diversas formas según la especie bacteriana, pero su efecto suele ser similar. Permiten a las bacterias comunicarse tanto dentro como entre especies, y así generar respuestas coordinadas a su entorno de una manera comparable al comportamiento y la señalización de organismos superiores . No es de extrañar que se haya sugerido que la detección de quórum pudo haber sido un hito evolutivo importante que, en última instancia, dio origen a las formas de vida multicelulares .
Descubrimiento
El término autoinducción se acuñó por primera vez en 1970, cuando se observó que la bacteria marina bioluminiscente Vibrio fischeri producía una enzima luminiscente ( luciferasa ) solo cuando los cultivos alcanzaban una densidad poblacional umbral. [ 5 ] A bajas concentraciones celulares, V. fischeri no expresaba el gen de la luciferasa. Sin embargo, durante la fase de crecimiento exponencial de los cultivos, el gen de la luciferasa se activaba rápidamente. Este fenómeno se denominó autoinducción porque implicaba una molécula (el autoinductor) producida por las propias bacterias que se acumulaba en el medio de cultivo e inducía la síntesis de componentes del sistema de luminiscencia. [ 6 ] Investigaciones posteriores revelaron que el autoinductor real utilizado por V. fischeri es una molécula de señalización de homoserina lactona acilada (AHL).
Mecanismo
En los sistemas de detección de quórum más simplificados, las bacterias solo necesitan dos componentes para utilizar autoinductores: un mecanismo para producir una señal y otro para responder a ella. Estos procesos celulares suelen estar estrechamente coordinados e implican cambios en la expresión génica. La producción de autoinductores generalmente aumenta con la densidad celular bacteriana. La mayoría de las señales se producen intracelularmente y posteriormente se secretan al medio extracelular. La detección de autoinductores suele implicar su difusión hacia el interior de las células y su unión a receptores específicos . Normalmente, la unión de los autoinductores a los receptores no se produce hasta que se alcanza una concentración umbral. Una vez alcanzada esta concentración, los receptores unidos alteran la expresión génica, ya sea directa o indirectamente. Algunos receptores son factores de transcripción , mientras que otros transmiten señales a factores de transcripción posteriores. En muchos casos, los autoinductores participan en bucles de retroalimentación positiva, donde una pequeña concentración inicial de un autoinductor amplifica la producción de esa misma señal química a niveles mucho más altos.
Clases
lactonas de homoserina aciladas
Las lactonas de homoserina aciladas (AHL) , producidas principalmente por bacterias Gram negativas, son una clase de pequeñas moléculas lipídicas neutras compuestas por un anillo de homoserina lactona con una cadena acilo. [ 7 ] Las AHL producidas por diferentes especies de bacterias Gram negativas varían en la longitud y composición de la cadena lateral acilo , que a menudo contiene de 4 a 18 átomos de carbono. [ 8 ] Las AHL se sintetizan mediante AHL-sintetasas. Se difunden dentro y fuera de las células mediante mecanismos de transporte pasivo y activo . [ 9 ] Los receptores de las AHL incluyen varios reguladores transcripcionales llamados "proteínas R", que funcionan como factores de transcripción de unión al ADN o quinasas sensoras . [ 10 ] [ 11 ]
Péptidos
Las bacterias Gram positivas que participan en la detección de quórum suelen utilizar oligopéptidos secretados como autoinductores. Los autoinductores peptídicos generalmente resultan de la modificación postraduccional de una molécula precursora más grande. [ 12 ] En muchas bacterias Gram positivas, la secreción de péptidos requiere mecanismos de exportación especializados. Por ejemplo, algunos autoinductores peptídicos son secretados por transportadores de casete de unión a ATP que acoplan el procesamiento proteolítico y la exportación celular. [ 13 ] Tras la secreción, los autoinductores peptídicos se acumulan en entornos extracelulares. Una vez que se alcanza un nivel umbral de señal, una proteína quinasa sensora de histidina de un sistema regulador de dos componentes la detecta y se transmite una señal al interior de la célula. [ 4 ] Al igual que con las AHL, la señal termina alterando la expresión génica. Sin embargo, a diferencia de algunas AHL, la mayoría de los oligopéptidos no actúan como factores de transcripción por sí mismos.
diéster de borato de furanosilo
La bacteria marina bioluminiscente de vida libre, Vibrio harveyi , utiliza otra molécula de señalización además de una lactona de homoserina acilada. Esta molécula, denominada Autoinductor-2 (o AI-2), es un diéster de borato de furanosilo. [ 14 ] Se cree que el AI-2, que también es producido y utilizado por varias bacterias Gram negativas y Gram positivas, es un vínculo evolutivo entre los dos tipos principales de circuitos de detección de quórum. [ 4 ]
En bacterias gramnegativas
Como se mencionó, las bacterias Gram negativas utilizan principalmente lactonas de homoserina aciladas (AHL) como moléculas autoinductoras. El circuito mínimo de detección de quórum en bacterias Gram negativas consta de una proteína que sintetiza una AHL y una segunda proteína diferente que la detecta y provoca un cambio en la expresión génica. [ 4 ] Identificadas por primera vez en V. fischeri , estas dos proteínas son LuxI y LuxR, respectivamente. [ 15 ] [ 16 ] Otras bacterias Gram negativas utilizan proteínas similares a LuxI y LuxR ( homólogas ), lo que sugiere un alto grado de conservación evolutiva . Sin embargo, entre las Gram negativas, el circuito tipo LuxI/LuxI se ha modificado en diferentes especies. Estas modificaciones, descritas con más detalle a continuación, reflejan adaptaciones bacterianas para crecer y responder a nichos ambientales particulares . [ 4 ]
Vibrio fischeri : bioluminiscencia
Ecológicamente, se sabe que V. fischeri tiene asociaciones simbióticas con varios huéspedes eucariotas, incluido el calamar hawaiano de cola corta ( Euprymna scolopes ). [ 17 ] En esta relación, el huésped, el calamar, mantiene las bacterias en órganos luminosos especializados. El huésped proporciona un entorno seguro y rico en nutrientes para las bacterias y, a su vez, las bacterias proporcionan luz. Aunque la bioluminiscencia puede utilizarse para el apareamiento y otros fines, en E. scolopes se utiliza para la contrailuminación y así evitar la depredación. [ 18 ]
La molécula autoinductora utilizada por V. fischeri es la N-(3-oxohexanoil)-homoserina lactona. [ 19 ] Esta molécula se produce en el citoplasma por la enzima LuxI sintasa y se secreta a través de la membrana celular hacia el medio extracelular. [ 16 ] Como ocurre con la mayoría de los autoinductores, la concentración ambiental de N-(3-oxohexanoil)-homoserina lactona es la misma que la concentración intracelular dentro de cada célula. [ 20 ] La N-(3-oxohexanoil)-homoserina lactona finalmente se difunde de nuevo hacia las células, donde es reconocida por LuxR una vez que se ha alcanzado una concentración umbral (~10 μg/ml). [ 19 ] LuxR se une al autoinductor y activa directamente la transcripción del operón luxICDABE . [ 21 ] Esto da como resultado un aumento exponencial tanto en la producción de autoinductor como en la bioluminiscencia. LuxR unido al autoinductor también inhibe la expresión de luxR , lo que se cree que proporciona un mecanismo compensatorio de retroalimentación negativa para controlar estrictamente los niveles de los genes de bioluminiscencia. [ 16 ]
Pseudomonas aeruginosa : virulencia y producción de antibióticos
P. aeruginosa es un patógeno humano oportunista asociado con la fibrosis quística . En las infecciones por P. aeruginosa , la detección de quórum es crítica para la formación de biopelículas y la patogenicidad. [ 22 ] P. aeruginosa contiene dos pares de homólogos de LuxI/LuxR, LasI/LasR y RhlI, RhlR. [ 23 ] [ 24 ] LasI y RhlI son enzimas sintasas que catalizan la síntesis de N-(3-oxododecanoil)-homoserina lactona y N-(butiril)-homoserina lactona, respectivamente. [ 25 ] [ 26 ] Los circuitos LasI/LasR y RhlI/RhlR funcionan en tándem para regular la expresión de una serie de genes de virulencia. A una concentración umbral, LasR se une a N-(3-oxododecanoil)-homoserina lactona. En conjunto, este complejo unido promueve la expresión de factores de virulencia que son responsables de las etapas tempranas del proceso de infección. [ 23 ]
LasR, unido a su autoinductor, también activa la expresión del sistema RhlI/RhlR en P. aeruginosa . [ 27 ] Esto provoca la expresión de RhlR, que luego se une a su autoinductor, la N-(butril)-homoserina lactona. A su vez, RhlR unido al autoinductor activa una segunda clase de genes involucrados en etapas posteriores de la infección, incluyendo genes necesarios para la producción de antibióticos. [ 24 ] Presumiblemente, la producción de antibióticos por P. aeruginosa se utiliza para prevenir infecciones oportunistas por otras especies bacterianas. La N-(3-oxododecanoil)-homoserina lactona impide la unión entre la N-(butril)-homoserina lactona y su regulador correspondiente, RhlR. [ 28 ] Se cree que este mecanismo de control permite a P. aeruginosa iniciar las cascadas de detección de quórum de forma secuencial y en el orden apropiado para que pueda producirse un ciclo de infección adecuado. [ 4 ]
Otros autoinductores gramnegativos
- P. aeruginosa también utiliza 2-heptil-3-hidroxi-4-quinolona (PQS) para la detección de quórum. [ 29 ] Esta molécula es notable porque no pertenece a la clase de autoinductores de homoserina lactona. Se cree que la PQS proporciona un vínculo regulador adicional entre los circuitos Las y Rhl involucrados en la virulencia y la infección.
- Agrobacterium tumefaciens es un patógeno vegetal que induce tumores en huéspedes susceptibles. La infección por A. tumefaciens implica la transferencia de un plásmido oncogénico de la bacteria al núcleo de la célula huésped, mientras que la detección de quórum controla la transferencia conjugativa de plásmidos entre bacterias. [ 30 ] La conjugación , por otro lado, requiere el autoinductor HSL, N-(3-oxooctanoil)-homoserina lactona. [ 31 ]
- Erwinia carotovora es otro patógeno vegetal que causa la enfermedad de la pudrición blanda. Estas bacterias secretan celulasas y pectinasas, enzimas que degradan las paredes celulares de las plantas. [ 32 ] ExpI/ExpR son homólogos de LuxI/LuxR en E. carotovora y se cree que controlan la secreción de estas enzimas solo cuando se alcanza una densidad celular local suficientemente alta. El autoinductor involucrado en la detección de quórum en E. carotovora es la N-(3-oxohexanoil)-L-homoserina lactona. [ 33 ]
En bacterias grampositivas
Mientras que las bacterias Gram negativas utilizan principalmente lactonas de homoserina aciladas, las bacterias Gram positivas generalmente utilizan oligopéptidos como autoinductores para la detección de quórum. Estas moléculas a menudo se sintetizan como polipéptidos más grandes que se escinden postraduccionalmente para producir péptidos "procesados". A diferencia de las AHL que pueden difundir libremente a través de las membranas celulares, los autoinductores peptídicos generalmente requieren mecanismos de transporte especializados (a menudo transportadores ABC). Además, no difunden libremente de vuelta a las células, por lo que las bacterias que los utilizan deben tener mecanismos para detectarlos en sus entornos extracelulares. La mayoría de las bacterias Gram positivas utilizan un mecanismo de señalización de dos componentes en la detección de quórum. Los autoinductores peptídicos secretados se acumulan en función de la densidad celular. Una vez que se alcanza un nivel de quórum de autoinductor, su interacción con una quinasa sensora en la membrana celular inicia una serie de eventos de fosforilación que culminan en la fosforilación de una proteína reguladora intracelular. [ 4 ] Esta proteína reguladora funciona posteriormente como un factor de transcripción y altera la expresión génica. Al igual que en las bacterias Gram negativas, el sistema de autoinducción y detección de quórum en las bacterias Gram positivas se conserva, pero, de nuevo, cada especie ha adaptado aspectos específicos para sobrevivir y comunicarse en entornos de nicho únicos.
Streptococcus pneumoniae : competencia
S. pneumoniae es una bacteria patógena humana en la que el proceso de transformación genética se describió por primera vez en la década de 1930. [ 34 ] Para que una bacteria pueda incorporar ADN exógeno de su entorno, debe volverse competente . En S. pneumoniae , deben ocurrir varios eventos complejos para alcanzar un estado competente, pero se cree que la detección de quórum juega un papel. [ 35 ] El péptido estimulante de la competencia (CSP) es un autoinductor peptídico de 17 aminoácidos necesario para la competencia y la posterior transformación genética. [ 36 ] El CSP se produce por la escisión proteolítica de un péptido precursor de 41 aminoácidos (ComC); es secretado por un transportador ABC (ComAB); y es detectado por una proteína quinasa sensora (ComD) una vez que ha alcanzado una concentración umbral. [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ] La detección es seguida por la autofosforilación de ComD, que a su vez, fosforila ComE. ComE es un regulador de respuesta responsable de activar la transcripción de comX , cuyo producto es necesario para activar la transcripción de varios otros genes involucrados en el desarrollo de la competencia. [ 40 ]
Bacillus subtilis : competencia y esporulación
B. subtilis es un microbio que habita en el suelo y utiliza la detección de quórum para regular dos procesos biológicos diferentes: la competencia y la esporulación . Durante la fase de crecimiento estacionario, cuando B. subtilis se encuentra a alta densidad celular, aproximadamente el 10% de las células de una población se inducen a volverse competentes. Se cree que esta subpoblación se vuelve competente para captar ADN que podría utilizarse para la reparación de cromosomas dañados (mutados) . [ 41 ] ComX (también conocido como factor de competencia) es un péptido de 10 aminoácidos que se procesa a partir de un precursor peptídico de 55 aminoácidos. [ 42 ] Al igual que la mayoría de los autoinductores, ComX se secreta y se acumula en función de la densidad celular. Una vez que se alcanza un nivel extracelular umbral, ComX es detectado por un par de quinasa sensora/regulador de respuesta de dos componentes ComP/ComA. [ 43 ] La fosforilación de ComA activa la expresión del gen comS , ComS inhibe la degradación de ComK y, finalmente, ComK activa la expresión de varios genes necesarios para la competencia. [ 44 ]
La esporulación, por otro lado, es una respuesta fisiológica de B. subtilis al agotamiento de nutrientes dentro de un entorno particular. También está regulada por señalización extracelular. Cuando las poblaciones de B. subtilis detectan condiciones desfavorables, responden experimentando una división celular asimétrica. [ 45 ] Esto finalmente produce esporas que están adaptadas para la dispersión y la supervivencia en condiciones desfavorables. La esporulación en B. subtilis está mediada por CSF (factor de esporulación), un pentapéptido escindido del péptido precursor PhrC. [ 46 ] El CSF se secreta al medio extracelular y es recaptado por las células a través del transportador ABC Opp donde actúa intracelularmente. [ 47 ] Si bien las bajas concentraciones internas de CSF contribuyen a la competencia, las altas concentraciones inducen la esporulación. El CSF inhibe una fosfatasa, RabB, lo que aumenta la actividad de Spo0A, favoreciendo un cambio en el compromiso de la competencia a la vía de esporulación. [ 41 ]
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- transducción de señales