Base de datos Avibase

Avibase es una base de datos taxonómica en línea que organiza datos taxonómicos y de distribución de aves a nivel mundial. La base de datos se basa en la noción de conceptos taxonómicos ^{[1] [2]} en lugar de nombres taxonómicos. ^[3] Avibase incorpora y organiza datos taxonómicos de los principales editores taxonómicos de aves ( The Clements Checklist of Birds of the World , ^[4] Handbook of the Birds of the World , BirdLife International , ^[5] IOC Checklist ^[6] y Howard and Moore Complete Checklist of the Birds of the World ^[7] ) y otras fuentes regionales (por ejemplo, todas las ediciones de la American Ornithological Society Checklist of North American Birds desde 1886). Los conceptos taxonómicos en más de 230 fuentes taxonómicas diferentes se han mapeado y referenciado de forma cruzada con los conceptos de Avibase.

El sitio web también ofrece listas de verificación para más de 20.000 regiones geográficas del mundo, páginas de especies con información taxonómica y sinónimos, y herramientas para que los observadores mantengan sus propios avistamientos y obtengan informes, como un mapa que muestra países o puntos críticos de eBird con especies objetivo.

Avibase fue creado y es mantenido por Denis Lepage, actualmente director sénior de ciencia y tecnología de datos en Birds Canada . Los datos contenidos en Avibase se han recopilado a partir de 1991 aproximadamente. ^[8] El sitio web de Avibase se lanzó en junio de 2003 y ha sido alojado por Birds Canada (anteriormente Bird Studies Canada) desde su creación.

Conceptos taxonómicos . La base de datos está organizada principalmente en torno a una tabla de conceptos taxonómicos únicos. Un concepto taxonómico es una forma de agrupar taxones similares en una base de datos de una manera más flexible en comparación con los nombres de especies específicas. ^{[9] [10] [11]} Cada concepto representa una circunscripción biológica única y se le ha asignado un identificador alfanumérico único llamado Avibase ID. Los identificadores de Avibase permiten el seguimiento de conceptos taxonómicos congruentes entre las fuentes de publicación. Hay aproximadamente 58.000 conceptos taxonómicos únicos descritos en Avibase. Estos incluyen conceptos tradicionalmente reconocidos como especies y subespecies , pero también otras agrupaciones taxonómicas (grupos de subespecies), varios tratamientos taxonómicos alternativos reconocidos históricamente y otros conceptos que representan híbridos , morfos de color y formas inválidas o dudosas.

Datos de nomenclatura . Cada nombre científico se describe para incluir datos de citación y el nombre asociado con la descripción original. Se han registrado aproximadamente 87.000 nombres científicos en Avibase y también hay disponibles varios tipos de sinónimos .

Las listas de especies regionales están disponibles para más de 20.000 regiones del mundo. Esto incluye todos los países, territorios y dependencias, y la mayoría de las regiones definidas en las capas subnacionales del GADM , como provincias, estados, prefecturas, condados, departamentos, municipios y distritos (niveles 1 y 2 del GADM), así como más de 2.500 islas. Las listas de especies regionales están disponibles en varios formatos taxonómicos y pueden incorporar nombres comunes en una variedad de idiomas. Los datos para las listas de especies regionales provienen de múltiples fuentes, como el conjunto de datos EBD de eBird y foros como la Alerta Global de Aves Raras de Facebook.

Los nombres comunes y sinónimos están disponibles en 271 idiomas diferentes y variantes regionales, y hay 21 idiomas que tienen una cobertura superior al 85% de especies con un nombre común conocido.

MyAvibase , lanzado en 2013, proporciona herramientas gratuitas para que los usuarios mantengan sus listas de vida y generen informes centrados en encontrar especies objetivo que el observador aún no ha visto, o estadísticas regionales generales (por ejemplo, número total de especies por país).

• Mitch, Leslie (2004), "Donde las águilas y los gorriones se atreven", Science , 304 : 935, doi :10.1126/science.304.5673.935c, JSTOR  3836936, S2CID  220095931

• Lepage, Denis; Vaidya, Gaurav; Gulralnick, Robert (2014), "Avibase: un sistema de base de datos para gestionar y organizar conceptos taxonómicos", ZooKeys (420): 117– 135, Bibcode :2014ZooK..420..117L, doi : 10.3897/zookeys.420.7089 , PMC  4109484 , PMID  25061375

• ¿Qué hay detrás de un nombre? Cambios en el significado de los nombres biológicos, Pensoft Publishers, 2014

• Remsen, David (2016), "El uso y los límites de los nombres científicos en la informática biológica", ZooKeys (550): 207– 223, Bibcode :2016ZooK..550..207R, doi : 10.3897/zookeys.550.9546 , PMC  4741222 , PMID  26877660

• Dickinson, Edward C. (2016), "Reforzando los fundamentos de la nomenclatura ornitológica: llenando los vacíos en el legado histórico de exploración bibliográfica de Sherborn y Richmond", ZooKeys (550): 107– 134, Bibcode :2016ZooK..550..207R, doi : 10.3897/zookeys.550.9546 , PMC  4741222 , PMID  26877660

• Sterner, Beckett; Franz, Nico M. (2017), "¿Taxonomía para humanos o computadoras? Pragmática cognitiva para macrodatos", Biological Theory , 12 (2): 99– 111, doi :10.1007/s13752-017-0259-5, S2CID  90423947

• Christidis, Les; Garnett, Stephen T. (2017), "La anarquía taxonómica obstaculiza la conservación", Nature , 546 (7656): 25– 27, Bibcode :2017Natur.546...25G, doi : 10.1038/546025a , PMID  28569833

• Vaidya, Gaurav; Lepage, Denis; Gulralnick, Robert (2018), "El ritmo y el modo del proceso de corrección taxonómica: cómo los taxónomos han corregido y corregido las especies de aves de América del Norte durante los últimos 127 años", PLOS One , 13 (4): e0195736, Bibcode :2018PLoSO..1395736V, doi : 10.1371/journal.pone.0195736 , PMC  5909608 , PMID  29672539

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