Articulo de referencia

Bacillati

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Bacillati , [ 3 ] anteriormente conocido como "Terrabacteria" , es un reino que contiene aproximadamente dos tercios de las especies procariotas , incluidas las de los filos grampositivos ( Actinomycetota y Bacillota ), así como los filos Cyanobacteriota y Chloroflexota . [ 4 ] [ 5 ]

Su nombre deriva de ( terra = "tierra") de las presiones evolutivas de la vida en la tierra. Los bacilos poseen adaptaciones importantes como la resistencia a los peligros ambientales (por ejemplo, la desecación, la radiación ultravioleta y la alta salinidad) y la fotosíntesis oxigénica. Además, las propiedades únicas de la pared celular en los taxones grampositivos , que probablemente evolucionaron en respuesta a las condiciones terrestres, han contribuido a la patogenicidad en muchas especies. [ 5 ] Estos resultados dejan abierta la posibilidad de que las adaptaciones terrestres hayan desempeñado un papel más importante en la evolución de los procariotas de lo que se entiende actualmente. [ 4 ] [ 5 ]

"Terrabacteria" ( sin. Bacillati) fue propuesto en 2004 para Actinomycetota, Cyanobacteria y Deinococcota [ 4 ] y posteriormente se amplió para incluir Bacillota y Chloroflexota . [ 5 ] Otros análisis filogenéticos [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] han respaldado las estrechas relaciones de estos filos. La mayoría de las especies de procariotas no ubicadas en "Terrabacteria" fueron asignadas al taxón " Hydrobacteria ", [ 5 ] (que también es conocido como reino Pseudomonadati ) [ 9 ] en referencia al ambiente húmedo inferido para el ancestro común de esas especies. Algunos análisis filogenéticos moleculares [ 10 ] [ 11 ] no han respaldado esta dicotomía de Bacillati y Pseudomonadati, pero los análisis genómicos más recientes, [ 7 ] [ 8 ] incluyendo aquellos que se han centrado en enraizar el árbol, [ 7 ] han encontrado que estos dos grupos son monofiléticos. [ 7 ]

Se infirió que Bacillati y Pseudomonadati divergieron hace aproximadamente 3 mil millones de años, lo que sugiere que la tierra (continentes) había sido colonizada por procariotas en ese momento. [ 5 ] Juntos, Bacillati y Pseudomonadati forman un gran clado que contiene el 97% de los procariotas y el 99% de todas las especies de Bacteria conocidas hasta 2009, y se ubican en el taxón "Selabacteria", en alusión a sus capacidades fototróficas ( σέλας "luz" en griego). [ 12 ] Actualmente, los filos bacterianos que están fuera de Bacillati + Pseudomonadati, y que por lo tanto justifican el taxón "Selabacteria", son objeto de debate y pueden o no incluir Fusobacteria. [ 5 ] [ 7 ]

El nombre “Glidobacteria” [ 13 ] incluía algunos miembros de Bacillati pero excluía los grandes grupos gram positivos, Bacillota y Actinomycetota , y no está respaldado por datos filogenéticos moleculares. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 7 ] [ 8 ] Además, el artículo que nombraba a Glidobacteria [ 13 ] no incluía una filogenia molecular ni análisis estadísticos y no seguía el sistema de tres dominios ampliamente utilizado . Por ejemplo, afirmaba que los eucariotas se separaron de las arqueas muy recientemente (~900 millones de años), lo cual es contradicho por el registro fósil, [ 14 ] y que el linaje de eucariotas + arqueas estaba anidado dentro de Bacteria como un pariente cercano de Actinomycetota .

En 2022, se introdujeron nuevas reglas para los taxones de nivel de reino de procariotas, y los mismos dos autores que propusieron esas nuevas reglas, propusieron nuevos nombres en 2024. [ 3 ] Concluyeron que “la solución taxonómicamente preferible para los reinos bacterianos parece ser aceptar la subdivisión aparente en el estudio de Battistuzzi y Hedges”, con refinamiento. [ 5 ] El nuevo (y único válido ) nombre es reino Bacillati. [ 3 ]

Filogenia

El árbol filogenético según los análisis filogenéticos de Battistuzzi y Hedges (2009) es el siguiente y con una calibración de reloj molecular . [ 4 ] [ 5 ]

Análisis moleculares recientes han encontrado aproximadamente las siguientes relaciones, incluyendo otros filos cuyas relaciones eran inciertas. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]

Por otro lado, Coleman et al. [ 7 ] denominaron al clado compuesto por Thermotogota , Deinococcota , Synergistota y relacionados como DST y, además, el análisis sugiere que las bacterias ultrapequeñas (grupo CPR) pueden pertenecer a Bacillati estando más estrechamente relacionadas con Chloroflexota . Según este estudio, el filo Aquificota a veces incluido pertenece a Pseudomonadati y que el filo Fusobacteriota puede pertenecer tanto a Bacillati como a Pseudomonadati. El resultado fue el siguiente: [ 7 ]

Referencias

  1. Bacillati en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  2. Parte, AC, Sardà Carbasse, J., Meier-Kolthoff, JP, Reimer, LC y Göker, M. (2020). La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology , 70 , 5607-5612; DOI: 10.1099/ijsem.0.004332
  3. 1 2 3 Göker, Markus; Oren, Aharon (22 de enero de 2024). "Publicación válida de nombres de dos dominios y siete reinos de procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 74 (1). doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN 1466-5026 . PMID 38252124 .  
  4. 1 2 3 4 5 Battistuzzi FU, Feijao A, Hedges SB (noviembre de 2004). "Una escala de tiempo genómica de la evolución de los procariotas: perspectivas sobre el origen de la metanogénesis, la fototrofia y la colonización de la tierra" . BMC Evolutionary Biology . 4 44. doi : 10.1186/1471-2148-4-44 . PMC 533871. PMID 15535883 .  
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Battistuzzi FU, Hedges SB (febrero de 2009). "Un clado importante de procariotas con adaptaciones antiguas a la vida en la tierra". Biología molecular y evolución . 26 (2): 335– 343. doi : 10.1093/molbev/msn247 . PMID 18988685 . 
  6. 1 2 Bern M, Goldberg D (mayo de 2005). " Selección automática de proteínas representativas para la filogenia bacteriana" . BMC Evolutionary Biology . 5 (1) 34. doi : 10.1186/1471-2148-5-34 . PMC 1175084. PMID 15927057 .  
  7. 1 2 3 4 5 6 7 8 Coleman GA, Davín AA, Mahendrarajah TA, Szánthó LL, Spang A, Hugenholtz P, et al. (mayo de 2021). "Una filogenia enraizada resuelve la evolución bacteriana temprana" . Science . 372 ( 6542) eabe0511. doi : 10.1126/science.abe0511 . hdl : 1983/51e9e402-36b7-47a6-91de-32b8cf7320d2 . PMID 33958449. S2CID 233872903 .   
  8. ^ Léonard RR, Sauvage E, Lupo V, Perrin A, Sirjacobs D, Charlier P, et al . (febrero de 2022). "¿Después de todo, el último ancestro común bacteriano fue un monodermo?" . Genes . 13 (2): 376. doi : 10.3390/genes13020376 . PMC 8871954 . PMID 35205421 .   
  9. "Reino: Pseudomonadati" .
  10. 1 2 Hug LA, Baker BJ, Anantharaman K, Brown CT, Probst AJ, Castelle CJ, et al. (abril de 2016). "Una nueva visión del árbol de la vida" . Nature Microbiology . 1 (5) 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID 27572647. S2CID 3833474 .   
  11. 1 2 Zhu Q, Mai U, Pfeiffer W, Janssen S, Asnicar F, Sanders JG, et al. (diciembre de 2019). " Filogenómica de 10.575 genomas revela proximidad evolutiva entre los dominios Bacteria y Archaea" . Nature Communications . 10 (1) 5477. Bibcode : 2019NatCo..10.5477Z . doi : 10.1038/s41467-019-13443-4 . PMC 6889312. PMID 31792218 .   
  12. Battistuzzi FU, Hedges SB (2009). "Eubacterias". En Hedges SB, Kumar S (eds.). El árbol del tiempo de la vida . Nueva York: Oxford University Press. pp. 106–115 . 
  13. 1 2 Cavalier-Smith T (julio de 2006). "Enraizando el árbol de la vida mediante análisis de transición" . Biology Direct . 1 (1): 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193. PMID 16834776 .  
  14. Knoll AH (2003). La vida en un planeta joven : Los primeros tres mil millones de años de evolución en la Tierra - Edición actualizada . Princeton University Press. ISBN  0-691-00978-3OCLC 1303471348 .​ 
  15. Anantharaman K, Brown CT, Hug LA, Sharon I, Castelle CJ, Probst AJ, et al. (octubre de 2016). " Miles de genomas microbianos arrojan luz sobre los procesos biogeoquímicos interconectados en un sistema acuífero" . Nature Communications . 7 13219. Bibcode : 2016NatCo...713219A . doi : 10.1038/ncomms13219 . PMC 5079060. PMID 27774985 .   
  16. Matheus Carnevali PB, Schulz F, Castelle CJ, Kantor RS, Shih PM, Sharon I, et al. (enero de 2019). " Metabolismo basado en hidrógeno como rasgo ancestral en linajes hermanos de las cianobacterias" . Nature Communications . 10 (1) 463. Bibcode : 2019NatCo..10..463M . doi : 10.1038/s41467-018-08246-y . PMC 6349859. PMID 30692531 .   
  17. Ji M, Greening C, Vanwonterghem I, Carere CR, Bay SK, Steen JA, et al. (diciembre de 2017). " Los gases traza atmosféricos sustentan la producción primaria en el suelo superficial del desierto antártico" . Nature . 552 (7685): 400–403 . Bibcode : 2017Natur.552..400J . doi : 10.1038/nature25014 . hdl : 2440/124244 . PMID 29211716. S2CID 4394421 .   
  18. ^ Tahon G, Tytgat B, Lebbe L, Carlier A, Willems A (julio de 2018). "Abditibacterium utsteinense sp. nov., el primer miembro cultivado del filo candidato FBP, aislado de muestras de suelo antártico sin hielo". Microbiología Sistemática y Aplicada . 41 (4): 279– 290. Bibcode : 2018SyApM..41..279T . doi : 10.1016/j.syapm.2018.01.009 . PMID 29475572 . S2CID 3515091 .  
  19. Rinke C, Schwientek P, Sczyrba A, Ivanova NN, Anderson IJ, Cheng JF, et al. (julio de 2013). " Perspectivas sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana" . Nature . 499 (7459): 431– 437. Bibcode : 2013Natur.499..431R . doi : 10.1038/nature12352 . hdl : 10453/27467 . PMID 23851394. S2CID 4394530 .   
  20. Eloe-Fadrosh EA, Paez-Espino D, Jarett J, Dunfield PF, Hedlund BP, Dekas AE, et al. (enero de 2016). " Estudio metagenómico global revela un nuevo filo bacteriano candidato en manantiales geotérmicos" . Nature Communications . 7 10476. Bibcode : 2016NatCo...710476E . doi : 10.1038/ncomms10476 . PMC 4737851. PMID 26814032 .   
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