La selección de fondo describe la pérdida de diversidad genética en un locus debido a la selección negativa contra los alelos deletéreos con los que está en desequilibrio de ligamiento . [ 1 ] El nombre enfatiza el hecho de que el trasfondo genético, o entorno genómico, de una mutación tiene un impacto significativo en si se conservará o se perderá de una población. La selección de fondo contradice la suposición de la teoría neutral de la evolución molecular de que la fijación o pérdida de un alelo neutro puede describirse mediante modelos de deriva genética de un solo locus , independientemente de otros loci. Además de reducir la diversidad de nucleótidos neutros , la selección de fondo reduce la probabilidad de fijación de mutaciones beneficiosas y aumenta la probabilidad de fijación de mutaciones deletéreas.
Efecto sobre la diversidad neutral
El grado en que la diversidad de nucleótidos neutros , que se cuantifica como el " tamaño efectivo de la población ", se reduce debido a la selección de fondo, depende de si los sitios neutros están ligados a sitios deletéreos. [ 2 ] Para sitios no ligados, se reduce por exp(-8Ush), donde U es la tasa de mutación deletérea en todo el genoma , s es el coeficiente de selección de mutaciones deletéreas y h es el coeficiente de dominancia . [ 1 ] [ 3 ] Esto corresponde a la probabilidad de que un individuo no pueda contribuir apreciablemente a la siguiente generación porque su carga genética es demasiado alta. La reducción es menor para s grande porque las mutaciones deletéreas se eliminan más rápidamente de la población. Para sitios ligados, la diversidad se reduce por exp(-u/r), donde u/r es la relación de mutación deletérea a recombinación dentro de una ventana genómica que rodea el alelo neutro de interés. [ 4 ] [ 5 ] Esto corresponde a la probabilidad de que una copia de gen pueda escapar por recombinación de alelos deletéreos cercanos. La selección de fondo en sitios vinculados predomina cuando U<1, mientras que la selección de fondo en sitios no vinculados predomina cuando U>1. [ 2 ]
La selección de fondo contribuye a una explicación selectiva de la correlación positiva entre las tasas locales de recombinación y el polimorfismo en todo el genoma. En áreas de alta recombinación, es más probable que las nuevas mutaciones "escapan" a los efectos de la selección cercana y se conserven en la población. [ 6 ] La misma correlación también se produce por el arrastre genético . Las dos teorías son más fáciles de distinguir en regiones de baja recombinación. [ 7 ]
No tener en cuenta la selección de fondo puede llevar a errores en la inferencia de la historia demográfica de las poblaciones. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]
Implicaciones para las poblaciones asexuales
La selección de fondo en poblaciones asexuales produce el trinquete de Muller , la acumulación de mutaciones deletéreas irreversibles. La selección de fondo reduce el tamaño efectivo de la población para que represente solo a aquellos individuos con la menor cantidad de mutaciones, y a veces este tamaño cae estocásticamente a cero, produciendo un clic del trinquete. [ 4 ]
Referencias
- 1 2 Charlesworth, B., MT Morgan y D. Charlesworth. 1993. El efecto de las mutaciones deletéreas en la variación molecular neutra. Genetics. 134: 1289-1303.
- 1 2 Matheson, Joseph; Masel, Joanna (2 de marzo de 2024). "La selección de fondo de sitios no ligados causa evolución no independiente de mutaciones deletéreas" . Genome Biology and Evolution . 16 (3). doi : 10.1093/gbe/evae050 . PMC 10972689. PMID 38482769 .
- ↑ Charlesworth, D., B. Charlesworth y MT Morgan. 1995. El patrón de variación molecular neutra bajo el modelo de selección de fondo. Genetics. 141: 1619-1632.
- 1 2 Charlesworth, Brian. 2012. Los efectos de las mutaciones deletéreas en la evolución en sitios ligados. Genetics. 190: 5-22.
- ↑ Hudson, Richard R. y Norman L. Kaplan. 1995. Selección de fondo perjudicial con recombinación. Genetics. 141: 1605-1617.
- ↑ Lewontin, RC 1974. La base genética del cambio evolutivo. Columbia Univ. Press, Nueva York, NY.
- ↑ Innan, Hideki y Wolfgang Stephan. 2003. Distinción entre los modelos de selección por arrastre genético y de fondo. Genetics. 165: 2307-2312.
- ↑ Ewing, Gregory B.; Jensen, Jeffrey D. (enero de 2016). "Las consecuencias de no tener en cuenta la selección de fondo en la inferencia demográfica". Molecular Ecology . 25 (1): 135– 141. Bibcode : 2016MolEc..25..135E . doi : 10.1111/mec.13390 . PMID 26394805 .
- ↑ Pouyet, Fanny; Aeschbacher, Simon; Thiéry, Alexandre; Excoffier, Laurent (23 de agosto de 2018). "La selección de fondo y la conversión genética sesgada afectan a más del 95 % del genoma humano y sesgan las inferencias demográficas" . eLife . 7 e36317 . doi : 10.7554/eLife.36317 . PMC 6177262. PMID 30125248 .
- ↑ Johri, Parul; Riall, Kellen; Becher, Hannes; Excoffier, Laurent; Charlesworth, Brian; Jensen, Jeffrey D. (25 de junio de 2021). "El impacto de la selección purificadora y de fondo en la inferencia de la historia de la población: problemas y perspectivas" . Biología molecular y evolución . 38 (7): 2986–3003 . doi : 10.1093/molbev/msab050 . PMC 8233493. PMID 33591322 .
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