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En biología molecular, el pliegue β trefoil es un plegamiento proteico que consta de seis horquillas β , cada una formada por dos hebras β . Juntas, forman un barril β con una "tapa" triangular, cada una compuesta por tres horquillas. En general, esta estructura tiene una simetría ternaria aproximada. [ 1 ] [ 2 ]
Detalles
Las horquillas están dispuestas en tres secuencias β - β - β - bucle - β , cada una con una estructura en forma de "Y" o trébol . La primera y la cuarta hebra β forman una horquilla, mientras que la segunda y la tercera forman la otra; cada horquilla forma otro brazo de la "Y" y el bucle largo forma su tronco. [ 1 ] [ 2 ]
El barril beta tiene un diámetro de 16 Å y está lleno de cadenas laterales de aminoácidos . [ 1 ]
Aparición
Entre otras proteínas, el pliegue β trefoil se encuentra en los inhibidores de Kunitz de varias plantas como la soja , Erythrina afra y el trigo ; en miembros de la familia de citocinas interleucina 1 ( interleucina - 1 alfa , interleucina-1 beta y antagonista del receptor de interleucina-1 ); y en los factores de crecimiento de fibroblastos 1 y 2. [ 1 ] [ 2 ]
Enlaces externos
- Arquitectura CATH "Trébol Beta"
Referencias
- 1 2 3 4 Murzin AG, Lesk AM, Chothia C (enero de 1992). "Pliegue β-trefoil: patrones de estructura y secuencia en los inhibidores de Kunitz interleucinas-1β y 1α y factores de crecimiento de fibroblastos". Journal of Molecular Biology . 223 (2): 531– 43. doi : 10.1016/0022-2836(92)90668-A . PMID 1738162 .
- 1 2 3 Gosavi S, Whitford PC, Jennings PA, Onuchic JN (julio de 2008). "Extracción de la función de un motivo de plegamiento de β-trébol" . PNAS . 105 ( 30): 10384–9 . Bibcode : 2008PNAS..10510384G . doi : 10.1073/pnas.0801343105 . PMC 2492465. PMID 18650393 .
- Pliegues de proteínas