Articulo de referencia

Gran Cerebro

BigBrain [ 1 ] es un atlas digital 3D de alta resolución y acceso libre del cerebro humano , publicado en junio de 2013 por un equipo de investigadores del Instituto Neurológico...

BigBrain [ 1 ] es un atlas digital 3D de alta resolución y acceso libre del cerebro humano , publicado en junio de 2013 por un equipo de investigadores del Instituto Neurológico de Montreal y el Centro de Investigación Jülich de Alemania , y forma parte del Proyecto Europeo del Cerebro Humano . La resolución espacial 3D isotrópica del atlas BigBrain es de 20 μm , mucho más fina que la resolución típica de 1 mm de otros modelos 3D existentes del cerebro humano, como el Atlas Cerebral de Allen . En 2014, BigBrain fue citado entre los 10 mejores de MIT Technology Review . [ 2 ]  

Adquisición

El atlas se creó a partir del cerebro de un hombre no identificado de 65 años (era "mujer de 65 años", según "BigBrain: An Ultrahigh-Resolution3D Human Brain Model", página 1472, Amunts K et al., SCIENCE, 21 JUNE 2013 VOL 340) que murió sin patología cerebral conocida. Su cerebro, después de ser extraído del cráneo, primero fue escaneado usando una máquina de resonancia magnética , luego incluido en parafina y cortado en 7404 secciones de 20 μm de espesor usando un micrótomo  de gran escala . Después de extraer cada sección, el rostro sin cortar fue fotografiado para proporcionar una referencia adicional para eliminar la distorsión. Las secciones del cerebro se colocaron en grandes portaobjetos de vidrio y luego se tiñeron para cuerpos celulares usando el método Merker, [ 3 ] un proceso que hace que la materia gris en el cerebro se tiña oscura mientras que la materia blanca no se colorea. Las secciones teñidas se escanearon y digitalizaron utilizando un escáner plano a 2400 ppp, creando un registro sin procesar de un terabyte. [ 4 ] El proceso de adquisición requirió aproximadamente 1000 horas de trabajo. [ 5 ]

Procesamiento de imágenes

Las imágenes digitales resultantes fueron procesadas por operadores humanos para eliminar artefactos y por software para alinearlas con las imágenes de referencia y con las secciones vecinas, corrigiendo así las distorsiones que inevitablemente surgen durante el procesamiento histológico . Los datos corregidos se ensamblaron en un modelo informático tridimensional con una resolución espacial isotrópica 3D de 20  μm. [ 4 ] El atlas tardó cinco años en completarse. [ 6 ] Los planes anunciados incluyen el mapeo de cerebros adicionales y el suministro de herramientas para permitir que las tomografías cerebrales de pacientes médicos se alineen con la estructura de BigBrain.

Accesibilidad

El conjunto de datos está disponible para su descarga en bigbrain.loris.ca y puede explorarse en línea con el explorador siibra de EBRAINS . Encontrará más conjuntos de datos y herramientas en bigbrainproject.org .

Véase también

Notas y referencias

  1. Amunts K, Lepage C, Borgeat L, et  al. (2013). "BigBrain: un modelo 3D del cerebro humano de ultra alta resolución" . Science . 340 ( 6139): 1472– 1475. Bibcode : 2013Sci...340.1472A . doi : 10.1126/science.1235381 . PMID 23788795. S2CID 14122170 .  
  2. "www.technologyreview.com/featuredstory/526501/brain-mapping" . MIT Technology Review . 23 de abril de 2014.
  3. B. Merker (1983). "Tinción de plata de cuerpos celulares mediante desarrollo físico". J. Neurosci. Methods . 9 (3): 235– 241. doi : 10.1016/0165-0270(83)90086-9 . PMID 6198563. S2CID 28169096 .  
  4. 1 2 "Transcripción del podcast de ciencia" (PDF) . 21 de junio de 2013. Consultado el 21 de junio de 2013 .
  5. Tanya Lewis (20 de junio de 2013). "Mapa 3D revela el cerebro humano con el mayor detalle jamás visto" . LiveScience.com . Consultado el 19 de julio de 2013 .
  6. Healy, Melissa. (2013, 20 de junio) 'Científicos crean un modelo 3D detallado del cerebro humano', Los Angeles Times https://www.latimes.com/science/la-xpm-2013-jun-20-la-sci-big-brain-20130621-story.html Recuperado el 19 de octubre de 2013.
  • Los archivos de datos de BigBrain están disponibles en el MNI.
  • BigBrain en el explorador siibra de EBRAINS
  • Demostración en YouTube