Elemento de estabilidad rico en carbono

El elemento de estabilidad C-rich Not M, -ND es una parte corta de una secuencia genética importante para la síntesis adecuada de la globina y otras proteínas humanas.

Las diferencias en la estabilidad de los ARNm individuales pueden afectar drásticamente el nivel general de expresión de los genes . Los ARNm eucariotas pueden tener vidas medias que varían desde varios minutos hasta varios días. En las células eritroides humanas en diferenciación , la deposición de altos niveles de proteína alfa globina depende de una vida media inusualmente larga del ARNm de alfa globina (superior a 24 horas). El determinante de estabilidad del ARNm de alfa globina se ha localizado en un segmento rico en pirimidinas de su región 3' UTR . Esta región confiere estabilidad al dirigir el ensamblaje de un complejo de ribonucleoproteína alfa específico en este sitio. Posteriormente, Holcik y Liebhaber identificaron otros tres ARNm eucariotas altamente estables que ensamblan el complejo de proteína alfa globina en regiones homólogas ricas en pirimidinas dentro de sus regiones 3' UTR (lipoxigenasa de conejo, tirosina hidroxilasa de rata y alfa(I)-colágeno humano).

 Sitio de escisión V de ErEN -cccaacgggcccu—ccucccc—ucc/u alfa globina (HBA1 o HBA2, NM_000517.1) cccca-----cccu—cuuccccaa lipoxigenasa (ALOX15, NM_001140) -ccca----gcccacuuuuccccaa colágeno alfa(I) (COL1A1, NM_000088) cucca---uccccu----ucuccaa tiroilsmochia hidroxilasa (TH, NM_000360)

ycca1–5cccw1–4ucycc : consenso (Holcik y Liebhaber, 1997)

Existe cierto debate sobre el número y la identidad de los factores trans-activos reclutados al elemento rico en citosina. Sin embargo, se acepta que la proteína de unión a poli(C) de la globina alfa ( alfaCP ) es el componente central del complejo alfa. Se ha demostrado que la alfaCP , una proteína de 39 kDa, se une directamente a la señal de ARN rica en citosina. Existen dos alfaCP : alfaCP1 y alfaCP2. Los estudios sugieren que el complejo podría proteger un sitio cercano al elemento rico en citosina en el ARNm de la globina alfa de la endonucleasa eritroide (ErEN). Dado que muchos de los componentes proteicos necesarios para el complejo de estabilidad de la globina alfa parecen expresarse ampliamente en diversas especies y tipos celulares, es probable que este mecanismo de estabilización del ARNm sea general. Sin embargo, en el ratón, los determinantes cis y trans han divergido en cierta medida. Los requisitos de secuencia del ratón son igualmente ricos en citosina y uracilo, en comparación con el elemento humano, predominantemente rico en citosina. A pesar de este cambio, el ARNm de la alfa-globina murina sigue siendo igual de estable debido a un cambio complementario en la especificidad de la proteína de unión a poli(C).

• J Kong y SA Liebhaber (2007). "Una vía de vigilancia del ARNm restringida al tipo celular desencadenada por la extensión del ribosoma en la región 3' no traducida". Nature Structural & Molecular Biology . 14 (7): 670– 676. doi : 10.1038/nsmb1256 . PMID 17572684 . 

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