Articulo de referencia

CIMIP6

La proteína interna del microtúbulo ciliar 6 (CMIP6) es una proteína que en humanos está codificada por el gen CIMIP6 (anteriormente C2or73 ). [ 5 ] Se predice que la proteína C...

La proteína interna del microtúbulo ciliar 6 (CMIP6) es una proteína que en humanos está codificada por el gen CIMIP6 (anteriormente C2or73 ). [ 5 ] Se predice que la proteína CMIP6 se ​​localiza en el cilio . [ 5 ]

Gene

El gen completo abarca un total de 53.712 pares de bases y contiene nueve exones . Su ubicación en el genoma humano es en el cromosoma 2, en la posición 2p16.2, y está flanqueado por los genes ACYP2 y SPTBN1 . [ 6 ]

ARNm

El ARNm primario producido por el gen C2or73 tiene 1921 nucleótidos de longitud. Existen otras seis isoformas de ARNm producidas por empalme alternativo y variación en la longitud de los exones. [ 7 ]

Proteína

La proteína tiene una masa molecular de 32.142 daltons . [ 8 ] Hay cuatro isoformas de la proteína . La isoforma primaria (X1) tiene 287 aminoácidos de longitud. [ 9 ]

C2orf73 contiene un motivo de secuencia corto , GDWWSH (este motivo aún no tiene ninguna función conocida). La proteína es rica en lisina y pobre en leucina en comparación con el contenido del gen humano promedio y tiene un punto isoeléctrico predicho de 9,305. [ 10 ]

Estructura

Aún no se ha determinado experimentalmente la estructura 3D de C2orf73. En la Figura 1 se presenta una predicción computacional realizada por I-TASSER. [ 11 ]

Figura 1. Estructura 3D predicha de la proteína C2orf73 humana generada por I-TASSER [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]

La herramienta PELE en Biology Workbench predice tres hélices α probables y una hebra β en la proteína. [ 15 ]

Modificaciones postraduccionales

Las herramientas GPS, NetPhos, MyHits y SUMOsp en ExPASy [ 16 ] predicen posibles modificaciones postraduccionales para la proteína. Se predicen seis posibles sitios de fosforilación y un sitio de sumoilación .

localización subcelular

PSORT II predice que C2orf73 se localiza en el núcleo. [ 17 ] Esto se ve respaldado por la presencia predicha de un sitio de sumoilación, que participa en el transporte citoplasmático nuclear . [ 18 ]

Expresión

Los perfiles GEO del NCBI muestran que C2orf73 se expresa débilmente en los siguientes tejidos en humanos: médula ósea , hígado, corazón, pulmón, cerebro, médula espinal , músculo esquelético , timo y epitelio . [ 19 ]

Regulación de la expresión

La herramienta Genomatix El Dorado predice que muchos factores de transcripción tienen una alta afinidad de unión en los 1100 pares de bases río arriba de C2orf73 . Muchos de estos factores de transcripción normalmente regulan procesos como el desarrollo y la diferenciación celular , la muerte celular y el ciclo celular . [ 20 ]

Proteínas que interactúan

Se ha determinado experimentalmente que tres proteínas interactúan con C2orf73 mediante experimentos de doble híbrido en levadura . [ 21 ]

  • FCH y dominios SH3 dobles 2 ( FCHSD2 ): su función aún no ha sido definida.
  • Proteína de choque térmico de la familia B, miembro 1 ( HSPB1 ): ayuda a la resistencia celular al estrés.
  • Proteína de unión al dominio SH3 4 ( SH3BP4 ): implicada en la endocitosis de receptores específicos de la superficie celular.

Función

Actualmente, la función de C2orf73 no es bien comprendida ni por la comunidad científica ni por nadie más.

Homología

No existen parálogos de C2orf73 en el genoma humano. Se encuentran ortólogos en todo el filo Chordata , pero se limitan a él (con algunas excepciones en otros filos del reino Animalia , como el pulpo bimaculoides ). [ 22 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000177994 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000040919 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 "Q8N5S3 · CMIP6_HUMAN" . uniprot.org . Consorcio UniProt . Consultado el 28 de julio de 2026 .
  6. "C2orf73, ARNm - Nucleótido - NCBI", cromosoma 2 del Homo sapiens . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  7. "C2orf73 cromosoma 2 marco de lectura abierto 73 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  8. "Gen C2orf73 - GeneCards | Proteína CB073 | Anticuerpo CB073" . www.genecards.org . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  9. "C2orf73 cromosoma 2 marco de lectura abierto 73 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  10. "SDSC Biology Workbench" . workbench.sdsc.edu . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  11. "Servidor I-TASSER para la predicción de la estructura y función de las proteínas" . zhanglab.ccmb.med.umich.edu . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  12. Zhang Y (enero de 2008). "Servidor I-TASSER para la predicción de la estructura 3D de proteínas" . BMC Bioinformatics . 9 (1): 40. doi : 10.1186/1471-2105-9-40 . PMC 2245901. PMID 18215316 .  
  13. Yang J, Yan R, Roy A, Xu D, Poisson J, Zhang Y (enero de 2015). "The I-TASSER Suite: protein structure and function prediction" . Nature Methods . 12 (1): 7–8 . doi : 10.1038/nmeth.3213 . PMC 4428668. PMID 25549265 .  
  14. Roy A, Kucukural A, Zhang Y (abril de 2010). "I-TASSER: una plataforma unificada para la predicción automatizada de la estructura y función de las proteínas" . Nature Protocols . 5 (4): 725–38 . doi : 10.1038/nprot.2010.5 . PMC 2849174. PMID 20360767 .  
  15. "SDSC Biology Workbench" . workbench.sdsc.edu . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  16. "ExPASy: Portal de recursos bioinformáticos SIB - Categorías" . www.expasy.org . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  17. "Predicción PSORT II" . psort.hgc.jp . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  18. Hay RT (abril de 2005). "SUMO: una historia de modificación" . Molecular Cell . 18 (1): 1– 12. doi : 10.1016/j.molcel.2005.03.012 . PMID 15808504 . 
  19. "Inicio - GEO - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 28 de abril de 2017 .
  20. "Genomatix - Análisis de datos NGS y medicina personalizada" . www.genomatix.de . Archivado del original el 6 de agosto de 2018. Consultado el 28 de abril de 2017 .
  21. "PSICQUIC View" . www.ebi.ac.uk. Consultado el 28 de abril de 2017 .
  22. Altschul SF, Madden TL, Schäffer AA, Zhang J, Zhang Z, Miller W, Lipman DJ (septiembre de 1997). "Gapped BLAST y PSI-BLAST: una nueva generación de programas de búsqueda en bases de datos de proteínas" . Nucleic Acids Research . 25 (17): 3389– 402. doi : 10.1093/nar/25.17.3389 . PMC 146917. PMID 9254694 .  
  23. "TimeTree :: La escala temporal de la vida" . www.timetree.org . Consultado el 28 de abril de 2017 .