Articulo de referencia

C6orf62

El marco de lectura abierto 62 del cromosoma 6 (C6orf62), también conocido como proteína 12 transactivada del cromosoma X (XTP12), [ 5 ] es un gen que codifica una proteína del ...

El marco de lectura abierto 62 del cromosoma 6 (C6orf62), también conocido como proteína 12 transactivada del cromosoma X (XTP12), [ 5 ] es un gen que codifica una proteína del mismo nombre. Se predice que la proteína codificada tiene una localización subcelular dentro del citosol. [ 6 ]

Gen y transcripción

En el ADN, C6orf62 tiene una longitud de 12.529 pares de bases y se localiza en 6q22.3. [ 7 ] Se encuentra en el cromosoma 6 en la posición 22.3 (6q22.3). La secuencia de ARNm madura tiene una longitud de 2498 pares de bases con 5 exones y 4 regiones intrónicas que traducen una proteína de 229 aminoácidos y dos isoformas predichas de 160 y 200 aminoácidos. [ 8 ] [ 9 ]

Proteína

El transcrito principal tiene 229 aminoácidos de longitud y está codificado a partir de 5 regiones exónicas. Existen dos variantes de transcripción de 200 y 160 aminoácidos de longitud. Hay un dominio de función desconocida (DUF4566) presente en las tres variantes, que abarca las posiciones 1-226 del transcrito principal. [ 10 ] El peso molecular de C6orf62 es de 27,1 kDa y su punto isoeléctrico se encuentra a un pH de 9,24. [ 11 ] Se localiza subcelularmente en todo el citosol. [ 6 ]

Interacciones de proteínas

Expresión

C6orf62 se expresa ampliamente en el cuerpo humano, sin embargo, su abundancia de proteína no es alta. [ 14 ] Se expresa más en la vesícula biliar y los testículos , pero no se prevé que se exprese en el músculo liso , los ganglios linfáticos , el bazo , los ovarios , el tejido adiposo y los tejidos blandos .

Homología

El gen C6orf62 está altamente conservado entre los vertebrados y tiene ortólogos en los invertebrados.

Ortólogos en mamíferos selectos

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Ortólogos en peces selectos con aletas radiadas

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Ortólogos en anfibios selectos

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Ortólogos en reptiles seleccionados

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Ortólogos en aves seleccionadas

Ortólogos en invertebrados seleccionados [ 15 ]

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Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000112308 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000019132 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Base de datos, GeneCards Human Gene. "Gen C6orf62 - GeneCards | Proteína CF062 | Anticuerpo CF062" . www.genecards.org . Consultado el 21 de febrero de 2017 .
  6. 1 2 "Expresión tisular de C6orf62 - Resumen - El Atlas de Proteínas Humanas" . www.proteinatlas.org . Consultado el 8 de mayo de 2017 .
  7. ^ Kent, WJ; Sugnet, CW; Furey, TS; Roskin, KM; Pringle, TH; Zahler, AM; Haussler, D (2002). "Navegador del genoma UCSC" . Navegador del genoma UCSC . Consultado el 20 de febrero de 2017 .
  8. "PREDICTED: proteína no caracterizada C6orf62 isoforma X1 [ Homo sapiens ] - Proteína - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 8 de mayo de 2017 .
  9. "PREDICTED: proteína no caracterizada C6orf62 isoforma X2 [ Homo sapiens ] - Proteína - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 8 de mayo de 2017 .
  10. "C6orf62 chromosome 6 open reading frame 62 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2017-05-08.
  11. Volker, Brendel (2006). "SAPS - SDSC Bio Workbench". SDSC Biology Workbench. Retrieved 2017-05-01.
  12. 12Lab, Mike Tyers. "C6orf62 (RP1-30M3.4) Result Summary | BioGRID". thebiogrid.org. Retrieved 2017-05-08.
  13. "1 binary interaction found for search term C6orf62". IntAct Molecular Interaction Database. EMBL-EBI. Retrieved 2018-08-25.
  14. "C6orf62 protein abundance in PaxDb". pax-db.org. Retrieved 2017-05-08.
  15. 123456"NCBI - Basic Local Alignment Search Tool". NCBI.