Articulo de referencia

Proteína C7

La proteína C7 es una proteína con dedos de zinc diseñada a partir de la ZFP murina, Zif268 , descubierta por Wu et al. en 1994 (publicada en 1995). Comparte los mismos dedos de...

La proteína C7 es una proteína con dedos de zinc diseñada a partir de la ZFP murina, Zif268 , descubierta por Wu et al. en 1994 (publicada en 1995). Comparte los mismos dedos de zinc 2 y 3 de Zif268, pero difiere en la secuencia del dedo 1. También comparte el mismo objetivo de ADN, 5'-GCGTGGGCG-3'.

Las secuencias compartidas en los códigos de aminoácidos de una sola letra de los dedos 2 y 3 son RSD-H-LTT y RAD-E-RKR (posiciones -1 a 6 en la hélice alfa).

El dedo de zinc 1 tiene la secuencia KSA-D-LKR que proporciona un aumento de 13 veces en la afinidad a la secuencia objetivo de todo el ZFP sobre la de Zif268.

Se utiliza en investigaciones con dedos de zinc en las que se cambia la secuencia de aminoácidos del dedo 2 para determinar la secuencia adecuada para apuntar a un sitio diana de tres nucleótidos determinado. Se prefiere una variación de C7, C7.GAT , ya que carece del residuo de ácido aspártico presente en el dedo 3 de C7 y se sabe que causa un fenómeno llamado "superposición del sitio diana". En este caso, la superposición del sitio diana es el resultado de que el residuo de ácido aspártico forma un enlace de hidrógeno con el N4 de la citosina (en la cadena opuesta) emparejada con la guanina en el subsitio del dedo 2. También puede formar el mismo enlace de hidrógeno con una base de adenina emparejada con una timina. Esta superposición del sitio diana dictaría que un residuo de citosina o adenina estuviera presente como el nucleótido 3' en el subsitio del dedo 2, lo que es inaceptable cuando se buscan secuencias diana que contengan otro nucleótido en esta posición.

Referencias

  • Wu H, Yang WP, Barbas CF (enero de 1995). "Construcción de dedos de zinc por selección: hacia una aplicación terapéutica". Proc. Natl. Sci. USA . 92 (2): 344– 8. doi : 10.1073/pnas.92.2.344 . PMC  42736 . PMID  7831288.
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Proteína_C7&oldid=1040083558"