Articulo de referencia

C7orf31

El marco de lectura abierto 31 del cromosoma siete ( C7orf31 ) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen C7orf31 en el cromosoma siete . [ 5 ] Gen/Locus En h...

El marco de lectura abierto 31 del cromosoma siete ( C7orf31 ) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen C7orf31 en el cromosoma siete . [ 5 ]

Gen/Locus

En humanos, el gen C7orf31 se encuentra en el locus 7p15.3 [ 5 ] y se extiende entre las posiciones 25174316 y 25219817 (abarcan 45502 pb). [ 6 ] Codifica al menos 4 isoformas humanas únicas: la isoforma primaria (590 aa; también denominada X1, X2 y CRA_c), [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] la isoforma X4 (346 aa), [ 10 ] la isoforma CRA_a (580 aa), [ 11 ] y la isoforma CRA_b (380 aa). [ 12 ]

Transcripción

En los humanos, C7orf31 codifica una cadena de ARNm de 3609 pares de bases de longitud. El ARNm humano está compuesto por una región no traducida 5' de 561 bases y una región no traducida 3' de 1275 bases de longitud. [ 13 ]

Proteína

La proteína principal codificada por C7orf31 en humanos tiene 590 aminoácidos de longitud y un peso molecular de 38334 Da. [ 5 ] Esta proteína forma parte de una familia de proteínas funcionalmente no caracterizada (pfam15093) con un dominio de función desconocida (DUF4555). [ 14 ]

Ortología de proteínas

La proteína C7orf31 está bien conservada en mamíferos y aves , pero está menos conservada en organismos más distantes. [ 15 ]

El gen C7orf31 no tiene parálogos en humanos.

Expresión

En humanos, se predice que C7orf31 se localiza en el citosol , el núcleo , la mitocondria y el peroxisoma , y ​​se expresa en casi todos los tejidos. [ 16 ] Se expresa en gran medida, especialmente en los testículos. [ 17 ]

Interacción

Los estudios de doble híbrido han encontrado interacciones entre las proteínas codificadas por A8K5H9 y C7orf31, [ 18 ] y otro estudio ha encontrado que la proteína interactúa con KBTBD5. [ 19 ]

Un estudio de 2014 encontró que C7orf31 era una proteína candidata asociada al centrosoma , utilizando espectrometría de masas en los centriolos de células espermáticas de mamíferos. La proteína aparece en el estudio junto con otras siete proteínas candidatas asociadas al centrosoma. [ 20 ] Junto con otras 2241 proteínas, C7orf31 también mostró una unión significativa en un experimento de microarrays a los β-amiloides, un grupo de proteínas asociadas con la enfermedad de Alzheimer . [ 21 ] Finalmente, en un estudio de red de interacción proteína-proteína, [ 22 ] se encontró que C7orf31 se asocia con KLHL40 , cuya función exacta tampoco se conoce. [ 23 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000153790 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000029828 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 3 "Proteína NCBI" .
  6. "Resultados de UCSC Blat" .
  7. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  8. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  9. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  10. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  11. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  12. "Proteína NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  13. "NCBI Nucleotide (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" . 11 de noviembre de 2018.
  14. "Dominios conservados del NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  15. "NCBI Blast (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  16. "Tarjetas genéticas C7orf31" .
  17. "NCBI GEO (Centro Nacional de Información Biotecnológica)" .
  18. "Se encontraron 21 interacciones binarias para el término de búsqueda C7orf31" . Base de datos de interacciones moleculares IntAct . EMBL-EBI . Consultado el 25 de agosto de 2018 .
  19. "Base de datos STRING" .
  20. Firat-Karalar EN, Sante J, Elliott S, Stearns T (octubre de 2014). "Análisis proteómico de células espermáticas de mamíferos identifica nuevos componentes del centrosoma" . Journal of Cell Science . 127 (Pt 19): 4128–33 . doi : 10.1242/jcs.157008 . PMC 4179487. PMID 25074808 .  
  21. ^ Oláh J, Vincze O, Virók D, Simon D, Bozsó Z, Tõkési N, Horváth I, Hlavanda E, Kovács J, Magyar A, Szũcs M, Orosz F, Penke B, Ovádi J (septiembre de 2011). "Interacciones de proteínas distintivas patológicas: polimerización de tubulina que promueve la proteína / p25, beta-amiloide y alfa-sinucleína" . La Revista de Química Biológica . 286 (39): 34088– 100. doi : 10.1074/jbc.m111.243907 . PMC 3190826 . PMID 21832049 .  
  22. Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (noviembre de 2014). " Un mapa a escala de proteoma de la red del interactoma humano" . Cell . 159 (5): 1212– 1226. doi : 10.1016/j.cell.2014.10.050 . PMC 4266588. PMID 25416956 .   
  23. "NCBI Gene" .