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Articulo de referencia

CFAP298

La proteína 298 asociada a cilios y flagelos es una proteína codificada por el gen CFAP298 . Es de interés en parte por su asociación con varias enfermedades. Se ha encontrado e...

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La proteína 298 asociada a cilios y flagelos es una proteína codificada por el gen CFAP298 . Es de interés en parte por su asociación con varias enfermedades. Se ha encontrado en niveles altos en la médula ósea de pacientes con un pronóstico negativo de leucemia mieloide aguda y un cariotipo anormal . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Los pacientes varones con Alzheimer han mostrado una disminución en la expresión de CFAP298 en sus células sanguíneas. [ 7 ] [ 8 ] El gen CFAP298 se encuentra dentro de la región crítica del síndrome de Down . [ 9 ] No hay parálogos claros en humanos, pero el gen tiene homólogos ampliamente conservados entre animales , hongos y algas .

Un árbol filogenético que muestra la amplia conservación del gen c21orf59.

Gene

CFAP298 es un gen que se encuentra en el cromosoma 21 en 21q22.1. Se han encontrado un total de trece variantes de empalme , pero solo once codifican proteínas . [ 10 ] La forma más común del ARNm de CFAP298 tiene 1427 pares de bases divididos en siete exones . Sus vecinos más cercanos en el cromosoma son TCP10L , EVA1C , LOC100506185, OR7E23P y SYNJ1 .

Expresión genética

La secuencia primaria de CFAP298 se encuentra en alta cantidad en la mayoría de los tejidos. Algunos tejidos con una expresión notablemente menor son los ganglios , el corazón y el hígado . [ 11 ] Se sospecha que CFAP298 se encuentra en el cerebro en las primeras etapas del desarrollo debido a los dos sitios de unión del factor de transcripción homólogo del complejo achaete-scute que se encuentran en el promotor. [ 12 ]

Proteína

La secuencia primaria de CFAP298 consta de 290 aminoácidos con una masa de 33,093 kDa . El punto isoeléctrico es 7,283, pero se reduce a 5,86 si está completamente fosforilada . [ 13 ] Se han encontrado varias modificaciones postraduccionales mediante espectrometría de masas: cinco sitios de fosforilación, un sitio de metilación , un sitio de ubiquitinación y un sitio de acetilación . [ 13 ] La mayoría de estas modificaciones ocurren en la segunda mitad de la proteína.

Estructura

La mayor parte de la proteína está formada por el dominio DUF2870. Este dominio se encuentra principalmente en homólogos de CFAP298, pero también en otras proteínas no caracterizadas, [ 14 ] y contiene la mayoría de los sitios que se modifican después de la traducción. Se predice que la proteína está formada principalmente por hélices alfa y carece de láminas beta . [ 15 ]

Localización

Se ha demostrado que CFAP298 se localiza en el citosol y el núcleo , [ 16 ] pero se ha predicho, aunque con menos fuerza, que se localiza en el citoesqueleto , el peroxisoma y las mitocondrias . [ 17 ]

Interacciones

Mediante espectrometría de masas , se han identificado interacciones con SUMO2 , [ 18 ] una proteína de modificación postraduccional similar a la ubiquitina , y ubiquitina C [ 19 ] . Mediante experimentos de doble híbrido , se ha encontrado una interacción con MAPK6 , una proteína quinasa . [ 20 ]

Estudios recientes

Un estudio en pez cebra ha demostrado que CFAP298 se encuentra en altas concentraciones en las vesículas de Kupffer y se localiza intracelularmente en el cuerpo basal de los cilios. [ 21 ] Los mutantes de pez cebra en el homólogo de CFAP298 presentan defectos en la motilidad ciliar. [ 21 ] Además, los cilios móviles en los mutantes de CFAP298 de pez cebra y xenopus son inmóviles y están mal polarizados, lo que sugiere que CFAP298 desempeña funciones tanto en la polaridad celular planar como en la motilidad ciliar. [ 22 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000022972 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  3. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  4. ↑ Bullinger L, Döhner K, Bair E, Fröhling S, Schlenk RF, Tibshirani R, et al. (abril de 2004). " Uso del perfil de expresión génica para identificar subclases pronósticas en la leucemia mieloide aguda en adultos" . The New England Journal of Medicine . 350 (16): 1605–16 . doi : 10.1056/NEJMoa031046 . PMID 15084693. S2CID 13205096 .   
  5. ↑ Greiner J, Schmitt M, Li L, Giannopoulos K, Bosch K, Schmitt A, et al. (diciembre de 2006). " Expresión de antígenos asociados a tumores en la leucemia mieloide aguda: implicaciones para enfoques inmunoterapéuticos específicos" . Blood . 108 (13): 4109–17 . doi : 10.1182/blood-2006-01-023127 . PMID 16931630. S2CID 15937337 .   
  6. ↑ Bullinger L, Ehrich M, Döhner K, Schlenk RF, Döhner H, Nelson MR, van den Boom D (enero de 2010). " La metilación cuantitativa del ADN predice la supervivencia en la leucemia mieloide aguda en adultos" . Blood . 115 (3): 636– 42. doi : 10.1182/blood-2009-03-211003 . PMID 19903898. S2CID 13349367 .  
  7. ↑ Maes OC, Xu S, Yu B, Chertkow HM, Wang E, Schipper HM (diciembre de 2007). "Perfil transcripcional de células mononucleares sanguíneas de Alzheimer mediante microarrays". Neurobiology of Aging . 28 (12): 1795– 809. doi : 10.1016/j.neurobiolaging.2006.08.004 . PMID 16979800. S2CID 8185187 .  
  8. ↑ Maes OC, Schipper HM, Chertkow HM, Wang E (junio de 2009). "Metodología para el descubrimiento de biomarcadores sanguíneos de la enfermedad de Alzheimer". The Journals of Gerontology. Serie A, Ciencias Biológicas y Ciencias Médicas . 64 (6): 636– 45. doi : 10.1093/gerona/glp045 . PMID 19366883 . 
  9. ↑ Moncaster JA, Pineda R, Moir RD, Lu S, Burton MA, Ghosh JG, et al. (mayo de 2010). " La proteína beta amiloide de la enfermedad de Alzheimer vincula la patología del cristalino y del cerebro en el síndrome de Down" . PLOS ONE . 5 (5) e10659. Bibcode : 2010PLoSO...510659M . doi : 10.1371/journal.pone.0010659 . PMC 2873949. PMID 20502642 .   
  10. ^ Conjunto http://ensembl.org
  11. ↑ C21orf59 GDS596 GEOperfil
  12. ↑ "Genomatix" . Archivado del original el 2 de diciembre de 2021. Consultado el 20 de abril de 2012 .
  13. 1 2 "Proteína 298 asociada a cilios y flagelos" . Sitio de fosforilación .
  14. ↑ Dominios conservados
  15. ↑ SDSC PELE
  16. ↑ Hu YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, Wagner F, Fiebitz A, Thamm S, et al. (junio de 2006). " El análisis de localización intracelular basado en matrices celulares revela nuevas características funcionales de las proteínas del cromosoma 21 humano" . BMC Genomics . 7 : 155. doi : 10.1186/1471-2164-7-155 . PMC 1526728. PMID 16780588 .   
  17. ↑ "PsortII" . Archivado del original el 25/07/2021 . Consultado el 26/04/2012 .
  18. ↑ Golebiowski F, Matic I, Tatham MH, Cole C, Yin Y, Nakamura A, et al. (mayo de 2009). "Cambios en todo el sistema en las modificaciones de SUMO en respuesta al choque térmico". Science Signaling . 2 (72): ra24. doi : 10.1126/scisignal.2000282 . PMID 19471022. S2CID 33450256 .   
  19. ^ Kim W, Bennett EJ, Huttlin EL, Guo A, Li J, Possemato A, et al. (octubre de 2011). "Evaluación sistemática y cuantitativa del proteoma modificado con ubiquitina" . Célula molecular . 44 (2): 325– 40. doi : 10.1016/j.molcel.2011.08.025 . PMC 3200427 . PMID 21906983 .   
  20. ↑ Vinayagam A, Stelzl U, Foulle R, Plassmann S, Zenkner M, Timm J, et al. (septiembre de 2011). "Una red de interacción de proteínas dirigida para investigar la transducción de señales intracelulares". Science Signaling . 4 (189): rs8. doi : 10.1126/scisignal.2001699 . PMID 21900206 . S2CID 7418133 .   
  21. 1 2 Schottenfeld, Jodi (2008). El papel de PKD2 y C21ORF59 en la formación del eje izquierda-derecha del embrión de pez cebra (Tesis). OCLC 236339661 . Gale A195982386 .  
  22. ↑ Jaffe KM, Grimes DT, Schottenfeld-Roames J, Werner ME, Ku TS, Kim SK, et al. (marzo de 2016). "c21orf59/kurly controla tanto la motilidad como la polarización de los cilios" . Cell Reports . 14 (8): 1841–9 . doi : 10.1016/j.celrep.2016.01.069 . PMC 4775428. PMID 26904945 .   

Lecturas adicionales

  • Denoeud F, Kapranov P, Ucla C, Frankish A, Castelo R, Drenkow J, et  al. (junio de 2007). " Uso prominente de sitios de inicio de transcripción distales 5' y descubrimiento de un gran número de exones adicionales en regiones ENCODE" . Genome Research . 17 (6): 746– 59. doi : 10.1101/gr.5660607 . PMC 1891335. PMID 17567994 .  
  • Hu YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, Wagner F, Fiebitz A, Thamm S, et  al. (junio de 2006). " El análisis de localización intracelular basado en matrices celulares revela nuevas características funcionales de las proteínas del cromosoma 21 humano" . BMC Genomics . 7 : 155. doi : 10.1186/1471-2164-7-155 . PMC 1526728. PMID 16780588 .  
  • Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, et  al. (enero de 2005). "Perfil de inmunoafinidad de la fosforilación de tirosina en células cancerosas". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455. S2CID 7200157 .  
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .