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La supresión de CG es un término para el fenómeno de que los dinucleótidos CG son muy poco comunes en la mayoría de las partes de los genomas de vertebrados .
En los tejidos somáticos adultos, los residuos de citosina pueden metilarse , y esto ocurre casi exclusivamente dentro de un contexto CpG simétrico. [1] Los residuos C metilados se desaminan espontáneamente para formar residuos T; por lo tanto, los dinucleótidos CpG mutan constantemente a dinucleótidos TpG, lo que da lugar a la subrepresentación de dinucleótidos CpG en el genoma humano (ocurren solo en el 21% de la frecuencia esperada). [2] (Por otro lado, la desaminación espontánea de residuos C no metilados da lugar a residuos U, una mutación que es rápidamente reconocida y reparada por la célula).
En humanos y ratones , los CG son los dinucleótidos menos frecuentes , y representan menos del 1 % de todos los dinucleótidos. Los GC son los segundos más infrecuentes, y representan más del 4 % de todos los dinucleótidos, por lo que los CG son más de cuatro veces menos frecuentes que todos los demás dinucleótidos.
Véase también
Referencias
- ^ Law J, Jacobsen SE (2010). "Establecimiento, mantenimiento y modificación de patrones de metilación del ADN en plantas y animales". Nat. Rev. Genet . 11 (3): 204–220. doi :10.1038/nrg2719. PMC 3034103 . PMID 20142834.
- ^ Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma Humano; et al. (febrero de 2001). "Secuenciación inicial y análisis del genoma humano" (PDF) . Nature . 409 (6822): 860–921. doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011.