CLIP4

La proteína CLIP4, miembro 4 de la familia de proteínas enlazadoras que contienen el dominio CAP-Gly, es una proteína codificada en humanos por el gen CLIP4. ^{[ 6 ]} En cuanto a los dominios conservados, el gen CLIP4 contiene principalmente repeticiones de anquirina y los dominios CAP-Gly que le dan nombre. ^{[ 6 ]} La estructura de la proteína CLIP4 está compuesta principalmente por hélices alfa, predominando las hélices alfa en el resto de la proteína. ^{[ 7 ]} La expresión del ARNm de CLIP4 se produce principalmente en la corteza suprarrenal y el nódulo auriculoventricular . ^{[ 8 ]} La literatura que abarca los dominios conservados y los parálogos de CLIP4 apunta a la regulación de los microtúbulos como una posible función de CLIP4.

El gen humano CLIP4, también conocido como proteína similar a la restina 2 (RSNL2), ^{[ 9 ]} se encuentra en la cadena positiva del brazo corto (p) del cromosoma 2 en la región 2, banda 3 ^{[ 9 ]} desde el par de bases 29.096.676 hasta el par de bases 29.189.643. CLIP4 tiene una longitud de 92.968 pares de bases y consta de 23 exones. ^{[ 9 ]}

La proteína humana CLIP4 tiene una longitud de 705 aminoácidos y está compuesta por dos tipos principales de dominios conservados: dos dominios CAP-Gly y numerosas repeticiones de anquirina. ^{[ 9 ]} La estructura secundaria de CLIP4 consiste principalmente en una estructura de ovillo aleatorio , siendo las hélices alfa la segunda estructura más abundante y las láminas beta la tercera. ^{[ 7 ]}

El punto isoelectrónico de la proteína CLIP4 no procesada es ligeramente básico (8,62 pI), lo que significa que hay un ligero exceso de aminoácidos básicos en comparación con los aminoácidos ácidos. ^{[ 13 ]} El peso molecular es de aproximadamente 65 kD. ^{[ 13 ]} El aminoácido más abundante en CLIP4 es la serina, que constituye el 10,7% de la proteína. ^{[ 14 ]} Se encuentran bloques coincidentes alineados de repeticiones separadas, en tándem y periódicas entre las posiciones 340-345 y 542-547, así como 447-547 y 564-568. ^{[ 14 ]} El inusual elemento periódico de 9 cifras de una lisina singular seguida de otros ocho aminoácidos aparece cinco veces dentro de la proteína cuando se compara con el conjunto de datos swp23s.q. ^{[ 14 ]} Otro fenómeno inusual es un elemento periódico de 7 figuras de un aminoácido con carga negativa seguido de otros seis aminoácidos hidrofóbicos, que aparece seis veces dentro de la proteína en comparación con el conjunto de datos swp23s.q. ^{[ 14 ]} Hay dos casos de espaciamiento de serina y dos casos de espaciamiento de fenilalanina que comprenden distancias inusualmente grandes en comparación con el conjunto de datos swp23s.q. ^{[ 14 ]}

La expresión de ARN de CLIP4 se mide consistentemente en un grado alto en la tiroides. ^{[ 6 ]} Además, se producen altos grados de transcripción en la corteza suprarrenal y el nódulo auriculoventricular. ^{[ 8 ]} El Atlas de Proteínas Humanas señala altos valores de expresión de ARN en los tejidos musculares, así como en la piel, los tejidos endocrinos y el tracto digestivo proximal. ^{[ 17 ]} Los mayores valores de expresión de proteínas también aparecieron en los tejidos musculares, además de en el pulmón, el tracto gastrointestinal, el hígado y la vesícula biliar, y la médula ósea y los tejidos linfoides. ^{[ 17 ]}

La expresión de la proteína CLIP4 parece ser muy elevada durante la deficiencia de Ada3. ^{[ 18 ]} También existe una mayor tendencia hacia una mayor expresión de CLIP4 en ausencia de U28. ^{[ 18 ]}

Los dominios CAP-Gly suelen estar asociados a la regulación de los microtúbulos. ^{[ 27 ]} Además, se sabe que las repeticiones de anquirina median las interacciones proteína-proteína. ^{[ 28 ]} Asimismo, se sabe que CLIP1, un parálogo de CLIP4 en humanos, se une a los microtúbulos y regula el citoesqueleto de microtúbulos. ^{[ 29 ]} También se predice que la proteína CLIP4 interactúa con diversas proteínas asociadas a los microtúbulos. ^{[ 30 ]} Por consiguiente, es probable que la proteína CLIP4, aunque no esté caracterizada, esté asociada a la regulación de los microtúbulos.

Se predice que la proteína CLIP4 interactúa con muchas proteínas asociadas a los microtúbulos; concretamente, MAPRE1, MAPRE2 y MAPRE3. También se predice que interactúa con CKAP5 y DCTN1, una proteína asociada al citoesqueleto y una proteína asociada a la dinactina, respectivamente. ^{[ 30 ]}