Articulo de referencia

COSMO-RS

COSMO-RS (acrónimo de "Modelo de Apantallamiento Tipo Conductor para Disolventes Reales") [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] es un método de termodinámica de equilibrio basado en química cuántic...

COSMO-RS (acrónimo de "Modelo de Apantallamiento Tipo Conductor para Disolventes Reales") [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] es un método de termodinámica de equilibrio basado en química cuántica cuyo objetivo es predecir potenciales químicos μ en líquidos. Procesa la densidad de carga de apantallamiento σ en la superficie de las moléculas para calcular el potencial químico μ de cada especie en solución. En soluciones diluidas, puede ser necesario considerar un potencial constante. Como paso inicial, se realiza un cálculo COSMO [ 4 ] de química cuántica para todas las moléculas y los resultados (por ejemplo, la densidad de carga de apantallamiento) se almacenan en una base de datos. En un paso posterior, COSMO-RS utiliza los resultados de COSMO almacenados para calcular el potencial químico de las moléculas en un disolvente líquido o mezcla. Los potenciales químicos resultantes constituyen la base para otras propiedades de equilibrio termodinámico, como los coeficientes de actividad , la solubilidad , los coeficientes de partición , la presión de vapor y la energía libre de solvatación. El método se desarrolló para proporcionar un método de predicción general sin necesidad de ajustes específicos del sistema.

Debido al uso de la densidad de carga de apantallamiento σ de los cálculos COSMO, COSMO-RS no requiere parámetros de grupos funcionales . Mediante este enfoque, también se incorporan a COSMO-RS efectos químico-cuánticos como las interacciones entre grupos, los efectos mesoméricos y los efectos inductivos.

El método COSMO-RS fue publicado por primera vez en 1995 por A. Klamt. [ 1 ] Una versión refinada de COSMO-RS fue publicada en 1998 [ 5 ] y es la base para desarrollos y reimplementaciones más recientes. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

Principios básicos

La siguiente descripción es un resumen simplificado de la versión COSMO-RS publicada en 1998.

Supuestos

Densidad de carga de apantallamiento del agua calculada mediante el método COSMO.
Perfil σ del agua; la entrada básica para COSMO-RS.
  1. El estado líquido es incompresible.
  2. Todas las partes de las superficies moleculares pueden estar en contacto entre sí.
  3. Solo se permiten interacciones por pares de parches de superficie molecular.

Siempre que se cumplan las suposiciones anteriores, el potencial químico μ en solución se puede calcular a partir de las energías de interacción de los contactos superficiales por pares.

ecuaciones COSMO-RS

Dentro de la formulación básica de COSMO-RS, los términos de interacción dependen de la densidad de carga de apantallamiento σ. Cada molécula y mezcla puede representarse mediante el histograma p(σ), denominado perfil σ. El perfil σ de una mezcla es la suma ponderada de los perfiles de todos sus componentes. Utilizando la energía de interacción E int (σ,σ') y el perfil σ del disolvente p(σ'), el potencial químico μ s (σ) de una pieza de superficie con carga de apantallamiento σ se determina como:

μs(σ)=kTlnpags(σ)mimiinortet(σ,σ)μs(σ)kTdσ{\displaystyle \mu _{s}(\sigma )=-kT\ln \int p_{s}(\sigma ')e^{-{\frac {E_{int}(\sigma ,\sigma ')-\mu _{s}(\sigma ')}{kT}}}d\sigma '}

Debido a que μ s (σ) está presente en ambos lados de la ecuación, es necesario resolverla iterativamente. Al combinar la ecuación anterior con p x (σ) para un soluto x, y agregar las contribuciones combinatorias y dispersivas independientes de σ, el potencial químico para un soluto X en un disolvente S resulta en:

μsincógnita=μdoometrobincógnita+midispag+pagincógnita(σ)μs(σ)dσ{\displaystyle \mu _{s}^{x}=\mu _{comb}^{x}+E_{disp}+\int p^{x}(\sigma )\mu _{s}(\sigma )d\sigma }

De forma análoga a los modelos de coeficientes de actividad utilizados en ingeniería química, como NRTL , UNIQUAC o UNIFAC , el potencial químico final se puede dividir en una contribución combinatoria y otra residual (no ideal). Las energías de interacción E int (σ,σ') de dos piezas de superficie son cruciales para el rendimiento final del método, y se utilizan diferentes formulaciones en las distintas implementaciones. Además de los términos de la fase líquida, se ha añadido a COSMO-RS una estimación del potencial químico para la fase de gas ideal μ gas , lo que permite predecir la presión de vapor, la energía libre de solvatación y otras magnitudes relacionadas.

Energía de interacción (residual)

La parte residual es la suma de tres contribuciones diferentes, donde E misfit y E hb son parte de E int y E disp se agrega directamente al potencial químico.

Interacción electrostática

mimetroisFit(σ)=α2(σ+σ)2{\displaystyle E_{misfit}(\sigma )={\frac {\alpha }{2}}(\sigma +\sigma ')^{2}}

En la expresión de desajuste E , α es un parámetro ajustable y σ y σ' se refieren a las densidades de carga de apantallamiento de los dos parches de superficie en contacto. Este término se ha denominado energía de "desajuste", ya que resulta del desajuste de las piezas de superficie cargadas en contacto. Representa la interacción de Coulomb relativa al estado en un conductor perfecto . Una molécula en un conductor perfecto (estado COSMO) está perfectamente apantallada electrónicamente; cada carga en la superficie molecular está apantallada por una carga del mismo tamaño pero de signo opuesto. Si el conductor se reemplaza por piezas de superficie de moléculas en contacto, el apantallamiento de la superficie ya no será perfecto. Por lo tanto, surgirá una energía de interacción debido a este desajuste de σ en los parches de superficie.

Energía de enlace de hidrógeno

mihb(σ)=dohb(T)máximo[0,σadodoσhb]min[0,σdonorte+σhb]{\displaystyle E_{hb}(\sigma )=c_{hb}(T)\max[0,\sigma _{acc}-\sigma _{hb}]\min[0,\sigma _{don}+\sigma _{hb}]}

En la expresión E hb, σ acc y σ don representan las densidades de carga de apantallamiento del aceptor y el donador del enlace de hidrógeno , respectivamente. El umbral de enlace de hidrógeno σ hb y el factor preexponencial c hb son parámetros ajustables. La construcción max[] y min[] garantiza que las densidades de carga de apantallamiento del aceptor y el donador superen el umbral para la formación del enlace de hidrógeno.

Dispersión (energía de van der Waals)

midispag=kγkAk{\displaystyle E_{disp}=\sum _{k}\gamma _{k}A_{k}}

La energía de dispersión COSMO-RS de un soluto depende de un factor preexponencial γ específico del elemento (k) y de la cantidad de superficie expuesta A de dicho elemento. No forma parte de la energía de interacción, sino que interviene directamente en el potencial químico.

Parámetros

Si bien el uso de la química cuántica reduce la necesidad de parámetros ajustables, es inevitable cierto ajuste a los datos experimentales. Los parámetros básicos son α, c hb y σ hb , utilizados en las energías de interacción, y un parámetro general para el área de contacto efectiva. Además, se requiere un parámetro de van der Waals ajustable γ por elemento. Todos los parámetros son generales o específicos de cada elemento, lo cual es una característica distintiva de COSMO-RS en comparación con métodos de contribución de grupos como UNIFAC.

Implementaciones

La versión original de COSMO-RS fue desarrollada y ampliada continuamente por A. Klamt en su empresa COSMOlogic (ahora parte de BIOVIA), y el software más avanzado para COSMO-RS es COSMOtherm, disponible actualmente en BIOVIA. También ofrecen una enorme base de datos (COSMObase) con más de 12 000 archivos COSMO. COSMOtherm demostró su precisión predictiva al ofrecer las predicciones de propiedades fisicoquímicas más exactas en los recientes desafíos SAMPL5 y SAMPL6 .

LVPP mantiene una base de datos abierta de perfiles sigma con parametrizaciones COSMO-SAC ("Coeficiente de Actividad de Segmento"). [ 11 ] [ 12 ]

Gaussian (software) no puede calcular perfiles σ, pero puede producir .cosmoarchivos de entrada para COSMO-RS/Cosmotherm a través de la palabra clave scrf=COSMORS.

SCM licencia una implementación comercial de COSMO-RS en Amsterdam Modeling Suite, que también incluye los modelos COSMO-SAC, UNIFAC y QSPR. [ 13 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 "Modelo de apantallamiento tipo conductor para disolventes reales: un nuevo enfoque para el cálculo cuantitativo de fenómenos de solvatación", A. Klamt, J. Phys. Chem., 99, 2224-2235 (1995), DOI: 10.1021/j100007a062
  2. Klamt, Andreas. (2007). COSMO-RS  : de la química cuántica a la termodinámica de fases fluidas y el diseño de fármacos . Elsevier. ISBN 978-0-08-045553-2OCLC 1226672539 .​ 
  3. Klamt, Andreas; Eckert, Frank; Arlt, Wolfgang (2010-06-15). "COSMO-RS: Una alternativa a la simulación para calcular las propiedades termodinámicas de mezclas líquidas" . Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering . 1 (1): 101– 122. doi : 10.1146/annurev-chembioeng-073009-100903 . ISSN 1947-5438 . PMID 22432575 .  
  4. "COSMO: Un nuevo enfoque para el apantallamiento dieléctrico en disolventes con expresiones explícitas para la energía de apantallamiento y su gradiente", A. Klamt y G. Schüürmann, J. Chem. Soc. Perkin Trans. II 799-805 (1993) doi:10.1039/P29930000799
  5. "Refinamiento y parametrización de COSMO-RS", A. Klamt, V. Jonas, T. Bürger y JCW Lohrenz, J. Phys. Chem. A 102, 5074-5085 (1998), doi:10.1021/jp980017s
  6. "Predicción a priori del equilibrio de fases a partir de un modelo de solvatación por contribución de segmentos", S.-T. Lin y SI Sandler, Ind. Eng. Chem. Res., 41 (5), 899–913 (2002), doi:10.1021/ie001047w
  7. "Rendimiento de un modelo de cribado tipo conductor para disolventes reales en comparación con métodos clásicos de contribución de grupos", H. Grensemann y J. Gmehling, Ind. Eng. Chem. Res., 44 (5), 1610–1624 (2005), doi:10.1021/ie049139z
  8. "Coeficientes de actividad de dilución infinita para líquidos iónicos de trihexiltetradecilo fosfonio: mediciones y predicción COSMO-RS", T. Banerjee y A. Khanna, J. Chem. Eng. Data, 51 (6), 2170–2177 (2006), doi:10.1021/je0602925
  9. "Una implementación del modelo de apantallamiento tipo conductor de solvatación dentro del paquete funcional de densidad de Ámsterdam. Parte II. COSMO para disolventes reales", CC Pye, T. Ziegler, E. van Lenthe, JN Louwen, Can. J. Chem. 87, 790 (2009), doi:10.1139/V09-008
  10. "Sobre la influencia de los conjuntos de bases y los métodos de química cuántica en la precisión de predicción de COSMO-RS", R. Franke, B. Hannebauer, Phys. Chem. Chem. Phys., 13, 21344-21350 (2011), doi:10.1039/C1CP22317H
  11. "Base de datos de perfiles sigma de LVPP + parametrizaciones de COSMO-SAC: lvpp/sigma" . LVPP. 30 de octubre de 2019. Consultado el 6 de noviembre de 2019 .
  12. Ferrarini, F.; Flôres, GB; Muniz, AR; Soares, RP de (2018). "Una base de datos de perfil sigma abierta y extensible para modelos basados ​​en COSMO". AIChE Journal . 64 (9): 3443– 3455. doi : 10.1002/aic.16194 . ISSN 1547-5905 . S2CID 103011443 .  
  13. "COSMO-RS: predicción de coeficientes de actividad, logP y VLE a partir de datos DFT" . Software para Química y Materiales . Consultado el 6 de noviembre de 2019 .