Hispanopedia WikiCXorf49 es una proteína que, en los seres humanos , está codificada por el gen del marco de lectura abierto 49 del cromosoma X (CXorf49).
Gene
El gen CXorf49 tiene un alias, CXorf49B. [ 1 ] El nombre de referencia A8MYA2 también se refiere a la proteína codificada por CXorf49 o CXorf49B. [ 2 ]
CXorf49 se localiza en el cromosoma X en Xq13.1. Tiene una longitud de 3912 pares de bases y la secuencia genética tiene 6 exones . [ 3 ] CXorf49 tiene un transcrito codificante de proteínas. [ 4 ]
Proteína
La proteína tiene 514 aminoácidos y una masa molecular de 54,4 kDa. [ 5 ] El punto isoeléctrico es 9,3. En comparación con otras proteínas humanas, CXorf49 es rica en glicina y prolina , pero tiene niveles más bajos de asparagina , isoleucina , tirosina y treonina (Análisis estadístico de secuencias de proteínas, SAPS [ 6 ] ).
Dominios
El dominio de función desconocida , DUF4641, es casi la proteína completa. Tiene 433 aminoácidos de longitud, desde el aminoácido 80 hasta el aminoácido número 512. [ 7 ] DUF4641 es parte de pfam15483. [ 8 ] El dominio es rico en prolina y arginina, pero DUF4641 tiene niveles más bajos de isoleucina, tirosina y treonina en comparación con otras proteínas en humanos (Análisis de Secuencias de Proteínas, SAPS [ 6 ] ). DUF4641 tiene un espaciamiento inusual entre los residuos de lisina y los aminoácidos con carga positiva (Análisis de Secuencias de Proteínas, SAPS [ 6 ] ).
Modificaciones postraduccionales
Se predice que CXorf49 tiene varios sitios postraduccionales. Esto incluye sitios para N-acetiltransferasa (NetAcet 1- [ 9 ] ), glicación de grupos ε amino de lisinas (NetGlycate 1.0 [ 10 ] ), O-glicosilación de GalNAc tipo mucina (NetOglyc 4.0 [ 11 ] ), fosforilación (NetPhos 2.0 [ 12 ] ), sumoilación (SUMOplot Analysis Program [ 13 ] ) y unión de O-ß-GlcNAc (YinOYang WWW [ 14 ] ).
localización subcelular
Se ha predicho que la proteína CXorf49 se encuentra en el núcleo celular (PSORT II [ 15 ] ).
Expresión
Región promotora
La región promotora de CXorf49 se encuentra entre los pares de bases 71718051 y 71718785 en la cadena negativa del cromosoma X y tiene una longitud de 735 pb (programa ElDorado de Genomatix [ 16 ] ). Uno de los sitios de unión de factores de transcripción más frecuentes en la región promotora son los sitios para el factor de unión a la caja Y.
Expresión
Aunque la expresión de CXorf49 es muy baja en las células humanas, es algo mayor en los tejidos conectivos , los testículos y el útero (NCBI-Unigene [ 17 ] ).
Interacciones
Todavía no se ha demostrado que la proteína CXorf49 interactúe con otras proteínas (PSICQUIC [ 18 ] ).
Se ha descubierto que CXorf49 es uno de los componentes de un pequeño grupo del proteoma de la célula HL-60 que eran más propensos a formar aductos de 4-hidroxi-2-nonenal (HNE), al exponerse a concentraciones no tóxicas (10 μM) de HNE, junto con la proteína de choque térmico de 60 kDa 1. [ 19 ]
Homología
Mediante BLAST [ 20 ] no se encontraron ortólogos de CXorf49 en organismos unicelulares, hongos ni plantas cuyos genomas hayan sido secuenciados. En el caso de organismos multicelulares, se encontraron ortólogos en mamíferos. La tabla siguiente muestra una selección de ortólogos de mamíferos, ordenados según su tiempo de divergencia con respecto al ser humano.
Filogenia
La proteína CXorf49 ha evolucionado desde los cerdos hormigueros hasta los humanos a lo largo de 105 millones de años.
Referencias
- ↑ "CXorf49, ARNm - Nucleótido - NCBI" , cromosoma X del Homo sapiens. Ncbi.nlm.nih.gov. 28 de septiembre de 2015. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "RecName: Full=Uncharacterized protein CXorf49 - Protein - NCBI" . Ncbi.nlm.nih.gov. 2015-09-28 . Consultado el 2016-04-28 .
- ↑ "CXorf49 cromosoma X marco de lectura abierto 49 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . Ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Resumen de genes y proteínas: cxorf49" . Ebi.ac.uk. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Gen CXorf49 (codificación de proteínas) Cromosoma X Marco de lectura abierto 49" . GeneCards . Consultado el 28 de abril de 2016 .
- 1 2 3 4 "SDSC Biology Workbench" . seqtool.sdsc.edu . Archivado del original el 11 de agosto de 2003. Consultado el 6 de mayo de 2016 .
- ↑ "Proteína no caracterizada CXorf49 [ Homo sapiens ] - Proteína - NCBI" . Ncbi.nlm.nih.gov. 28-09-2015 . Consultado el 28-04-2016 .
- ↑ "NCBI CDD Dominio de proteína conservado DUF4641" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 6 de mayo de 2016 .
- ↑ "Servidor NetAcet 1.0" . Cbs.dtu.dk. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Servidor NetGlycate 1.0" . Cbs.dtu.dk. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Servidor NetOGlyc 4.0" . Cbs.dtu.dk. 15 de mayo de 2013. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Servidor NetPhos 2.0" . Cbs.dtu.dk. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Programa de análisis SUMOplot" . Abgent . Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "Servidor YinOYang 1.2" . Cbs.dtu.dk. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ http://psort.hgc.jp/cgi-bin/runpsort.pl
- ↑ "El Dorado de Genomatix" . Archivado del original el 3 de abril de 2021. Consultado el 6 de mayo de 2016 .
- ↑ "Perfil EST - Hs.632817" . Ncbi.nlm.nih.gov. Archivado del original el 17 de agosto de 2018. Consultado el 28 de abril de 2016 .
- ↑ "PSIQUIC" . Archivado del original el 17 de diciembre de 2014.
- ^ Arcaro, Alessia; Daga, Martina; Cetrangolo, Giovanni Paolo; Ciamporcero, Eric Stefano; Lepore, Alessio; Pizzimenti, Stefania; Petrella, Claudia; Graf, María; Uchida, Koji; Mamone, Gianfranco; Ferranti, Pasquale; Ames, Paul RJ; Palumbo, Giuseppe; Barrera, Giuseppina; Gentile, Fabrizio (2015). "Generación de aductos de 4-hidroxi-2-nonenal con proteína 1 de choque térmico de 60 kDa en líneas celulares promielocíticas humanas HL-60 y monocíticas THP-1" . Medicina Oxidativa y Longevidad Celular . 2015 296146.doi : 10.1155 / 2015/296146 . PMC 4452872 . PMID 26078803 .
- ↑ Protein BLAST
- Genes
- Proteínas