Hispanopedia WikiEl Proyecto Genoma del Cáncer es parte de la investigación sobre cáncer, envejecimiento y mutaciones somáticas con sede en el Instituto Wellcome Trust Sanger en el Reino Unido. Su objetivo es identificar variantes de secuencia / mutaciones críticas en el desarrollo de cánceres humanos . Al igual que el proyecto Atlas del Genoma del Cáncer en los Estados Unidos, el Proyecto Genoma del Cáncer representa un esfuerzo en la Guerra contra el Cáncer para mejorar el diagnóstico, el tratamiento y la prevención del cáncer a través de una mejor comprensión de la base molecular de la enfermedad. El Proyecto Genoma del Cáncer fue lanzado por Michael Stratton en 2000, y Peter Campbell es ahora el líder del grupo del proyecto. El proyecto trabaja para combinar el conocimiento de la secuencia del genoma humano con técnicas de detección de mutaciones de alto rendimiento . [1]
El proyecto opera dentro del ámbito del Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer , trabajando con las otras organizaciones y países participantes para construir una base de datos de cambios genómicos presentes en diferentes tipos de cáncer. [2] La información sobre mutaciones somáticas recopilada por el proyecto se puede encontrar en la base de datos COSMIC . El proyecto del Wellcome Trust Sanger Institute actualmente tiene varios socios internos que se centran cada uno en diferentes tipos de cáncer y mutagénesis utilizando diferentes métodos. [1] [3] La investigación va más allá de la secuenciación para incluir descubrimientos de biomarcadores terapéuticos realizados utilizando programas de bioinformática . Entre estos descubrimientos se encuentran biomarcadores de sensibilidad a fármacos y biomarcadores inhibidores. Estos descubrimientos, junto con la evolución de las tecnologías de secuenciación de ADN a técnicas de secuenciación de próxima generación, son importantes en el posible tratamiento de enfermedades e incluso pueden ayudar a conducir a una medicina más personalizada para pacientes con cáncer. [4] [5]
Objetivos
Los objetivos del proyecto son ayudar a secuenciar y catalogar diferentes genomas de cáncer. Más allá de la secuenciación, cada uno de los socios internos del proyecto tiene diferentes áreas de enfoque que ayudarán a lograr el objetivo general del proyecto de determinar formas únicas de detección temprana del cáncer, una mejor prevención y un mejor tratamiento para los pacientes. [1]
Fogonadura
Los siguientes grupos son socios internos del Wellcome Trust Sanger Institute con laboratorios involucrados en el Proyecto Genoma del Cáncer, cada uno de los cuales lleva a cabo diferentes áreas de investigación que involucran la genómica del cáncer, otras enfermedades y mejoras en la terapia para ambas enfermedades mencionadas anteriormente. [ cita requerida ]
Grupo Garnett
El grupo Garnett está dirigido por Mathew Garnett. Su objetivo es mejorar las terapias actuales contra el cáncer determinando cómo las alteraciones en el ADN de las células dan lugar al cáncer y las implicaciones que esto tiene en las respuestas de los pacientes a la terapia y su posible mejora. Las investigaciones actuales que lleva a cabo el grupo incluyen la genómica de la sensibilidad a los fármacos, el mapeo de las dependencias sintéticas-letales en las células cancerosas, una nueva generación de modelos de cáncer organoides y modelos organoides de precisión para estudiar la función de los genes del cáncer. [1] [6]
Grupo Jackson
El grupo Jackson está dirigido por Steve Jackson y su investigación se centra en cómo las células utilizan la respuesta al daño del ADN (DDR) para descubrir y reparar el ADN celular dañado. La investigación que están llevando a cabo tiene grandes implicaciones en las enfermedades que resultan de la pérdida de la función del sistema DDR, como el cáncer, las enfermedades neurodegenerativas, la infertilidad, la inmunodeficiencia y el envejecimiento prematuro. [1] [7]
Grupo Liu
Pentao Liu dirige el grupo Liu, que utiliza la genética, la genómica y la biología celular en ratones para estudiar el papel de las funciones genéticas en el desarrollo de células y tejidos normales, así como en el desarrollo de diversas células y tejidos enfermos, incluido el cáncer. El grupo invierte un gran interés en la elección del linaje, la autorrenovación y la diferenciación de las células madre, lo que tendría implicaciones en la detección temprana, la prevención y las opciones de terapia para el cáncer y otras enfermedades genéticas. [1] [8]
Grupo McDermott
Ultan McDermott dirige el Grupo McDermott. El grupo utiliza tecnologías de secuenciación de última generación, análisis genéticos y bioinformática para aumentar el conocimiento del efecto que tienen los genomas del cáncer en la sensibilidad y la resistencia a los fármacos en relación con los pacientes. Los diferentes tipos de análisis genéticos que se utilizan incluyen CRISPR , mutagénesis química y ARNi . Las principales áreas de enfoque del grupo incluyen la farmacogenómica del cáncer y los análisis genéticos para crear una reserva de resistencias a los fármacos en el cáncer. [1] [9]
Grupo Nik-Zainal
La líder del grupo Nik-Zainal es Serena Nik-Zainal . El grupo utiliza métodos computacionales para identificar la firma única de mutagénesis en células somáticas para ayudar a aumentar la comprensión de cómo las mutaciones en el ADN contribuyen al envejecimiento y al cáncer. A medida que se secuencian más genomas de cáncer, la información que genera el grupo abarcará una colección más sólida, lo que permitirá comprender cómo las mutaciones conducen a diferentes tipos e incluso subtipos de cáncer. [1] [10]
Grupo Vassiliou
El grupo Vassiliou está dirigido por George Vassiliou y se centra en el cáncer hematológico . El grupo estudia cómo los diferentes genes y sus vías contribuyen a la evolución de los cánceres de la sangre, con el objetivo final de desarrollar un tratamiento que aumente la calidad y la duración de la vida de los pacientes. [1] [11]
Grupo Voet
Thierry Voet dirige el grupo Voet. El grupo utiliza variantes del genoma de células individuales y su ARN transcrito para estudiar la tasa de mutación, la inestabilidad genómica en la gametogénesis y la embriogénesis, y los efectos de la heterogeneidad celular en la salud y la enfermedad. [1] [12]
Investigación
En un intento por comprender mejor la mecánica de las mutaciones que conducen al desarrollo del cáncer, el grupo Nik-Zainal llevó a cabo un estudio que implicó la catalogación de las mutaciones somáticas de 21 cánceres de mama diferentes. Luego, el grupo utilizó métodos matemáticos para ayudar a determinar las firmas mutacionales únicas de los procesos subyacentes que conducen a la evolución de tejido sano a enfermo para cada uno de los cánceres muestreados. Los resultados mostraron que las mutaciones incluían varias sustituciones de nucleótidos simples y dobles que se pudieron diferenciar. Las mutaciones únicas para cada cáncer permitieron categorizar las 21 muestras según el tipo y subtipo de cáncer, mostrando una relación entre las mutaciones y el tipo de cáncer resultante. Si bien el grupo pudo identificar estas mutaciones, no pudo determinar los mecanismos subyacentes que las provocaron. [10]
El grupo McDermott, en colaboración con otros laboratorios, trabajó para encontrar nuevas posibilidades de tratamiento para la leucemia mieloide aguda (LMA), un cáncer agresivo con un mal pronóstico. Lo lograron mediante el diseño de una herramienta de detección genómica CRISPR para localizar áreas del genoma que serían más susceptibles al tratamiento en las células de LMA. La investigación identificó 492 genes esenciales para la función de las células de LMA que serían accesibles para ser objetivos terapéuticos. El grupo validó los resultados obtenidos mediante inhibición genética y farmacológica en genes seleccionados. La inhibición de uno de los genes seleccionados, KAT2A, fue capaz de suprimir el crecimiento de las células de LMA en varios genotipos, dejando intactas las células no cancerosas. Los resultados de este estudio proponen varias opciones terapéuticas prometedoras para la LMA que necesitarán más investigación. [9]
Véase también
- Secuenciación del genoma del cáncer
- Atlas del genoma del cáncer
- Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer
- Base de datos sobre cáncer COSMIC
Referencias
- ^ abcdefghij http://www.sanger.ac.uk/research/faculty/pcampbell/ Peter Campbell
- ^ Covell, David (2015). "Enfoques de minería de datos para el desarrollo de biomarcadores genómicos: aplicaciones que utilizan datos de detección de fármacos del Cancer Genome Project y la Cancer Cell Line Encyclopedia". PLOS ONE . 10 (7): e0127433. Bibcode :2015PLoSO..1027433C. doi : 10.1371/journal.pone.0127433 . PMC 4489368 . PMID 26132924.
- ^ "El Instituto Nacional del Cáncer, Cancer Research UK, el Wellcome Trust Sanger Institute y la fundación Hubrecht Organoid Technology colaborarán en la Iniciativa de modelos de cáncer humano". Química e industria . 80 (7).
- ^ Garnett, Mathew J.; Edelman, Elena J.; Heidorn, Sonja J.; Greenman, Chris D.; Dastur, Anahita; Lau, King Wai; Greninger, Patricia; Thompson, I. Richard; Luo, Xi (29 de marzo de 2012). "Identificación sistemática de marcadores genómicos de sensibilidad a fármacos en células cancerosas". Nature . 483 (7391): 570–575. Bibcode :2012Natur.483..570G. doi :10.1038/nature11005. ISSN 0028-0836. PMC 3349233 . PMID 22460902.
- ^ Garnett, Mathew J.; McDermott, Ultan (1 de marzo de 2012). "Explotación de la complejidad genética en el cáncer para mejorar las estrategias terapéuticas". Drug Discovery Today . Número especial sobre el desarrollo del cáncer. 17 (5–6): 188–193. doi :10.1016/j.drudis.2012.01.025. PMC 3672976 . PMID 22342219.
- ^ Yang, Wanjuan; Soares, Jorge; Greninger, Patricia; Edelman, Elena J.; Lightfoot, Howard; Forbes, Simon; Bindal, Nidhi; Beare, Dave; Smith, James A. (1 de enero de 2013). "Genómica de la sensibilidad a fármacos en el cáncer (GDSC): un recurso para el descubrimiento de biomarcadores terapéuticos en células cancerosas". Investigación de ácidos nucleicos . 41 (D1): D955–D961. doi :10.1093/nar/gks1111. ISSN 0305-1048. PMC 3531057 . PMID 23180760.
- ^ Jackson, Stephen P.; Durocher, Daniel (7 de marzo de 2013). "Regulación de las respuestas al daño del ADN por ubiquitina y SUMO". Molecular Cell . 49 (5): 795–807. doi : 10.1016/j.molcel.2013.01.017 . ISSN 1097-2765. PMID 23416108.
- ^ Qin, Le; Lai, Yunxin; Zhao, Ruocong; Wei, Xinru; Weng, Jianyu; Lai, Peilong; Li, Baiheng; Lin, Simiao; Wang, Suna (1 de enero de 2017). "La incorporación de un dominio bisagra mejora la expansión de las células T con receptor de antígeno quimérico". Journal of Hematology & Oncology . 10 (1): 68. doi : 10.1186/s13045-017-0437-8 . ISSN 1756-8722. PMC 5347831 . PMID 28288656.
- ^ ab Tzelepis, Konstantinos; Koike-Yusa, Hiroko; Braekeleer, Etienne De; Li, Yilong; Metzakopian, Emmanouil; Dovey, Oliver M.; Mupo, Annalisa; Grinkevich, Vera; Li, Meng (2016). "Un cribado de deserción de CRISPR identifica vulnerabilidades genéticas y objetivos terapéuticos en la leucemia mieloide aguda". Cell Reports . 17 (4): 1193–1205. doi :10.1016/j.celrep.2016.09.079. PMC 5081405 . PMID 27760321.
- ^ ab Nik-Zainal, Serena; Alexandrov, Ludmil B.; Wedge, David C.; Van Loo, Peter; Greenman, Christopher D.; Raine, Keiran; Jones, David; Hinton, Jonathan; Marshall, John (25 de mayo de 2012). "Procesos mutacionales que moldean los genomas de 21 cánceres de mama". Cell . 149 (5): 979–993. doi :10.1016/j.cell.2012.04.024. PMC 3414841 . PMID 22608084.
- ^ Weber, Julia; Öllinger, Rupert; Friedrich, Mathias; Ehmer, Ursula; Barenboim, Maxim; Steiger, Katja; Heid, Irina; Mueller, Sebastian; Maresch, Roman (10 de noviembre de 2015). "Mutagénesis múltiple somática CRISPR/Cas9 para genómica funcional de alto rendimiento del cáncer en ratones". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 112 (45): 13982–13987. Bibcode :2015PNAS..11213982W. doi : 10.1073/pnas.1512392112 . ISSN 0027-8424. PMC 4653208 . PMID 26508638.
- ^ Bruin, Elza C. de; McGranahan, Nicholas; Mitter, Richard; Salm, Max; Wedge, David C.; Yates, Lucy; Jamal-Hanjani, Mariam; Shafi, Seema; Murugaesu, Nirupa (10 de octubre de 2014). "La diversidad espacial y temporal en los procesos de inestabilidad genómica define la evolución del cáncer de pulmón". Science . 346 (6206): 251–256. Bibcode :2014Sci...346..251D. doi :10.1126/science.1253462. ISSN 0036-8075. PMC 4636050 . PMID 25301630.
Enlaces externos
- Sitio web de COSMIC
- Francis S. Collins y Anna D. Barker. "Mapping the Cancer Genome" (Mapeo del genoma del cáncer). Scientific American, febrero de 2007
- Sitio web del Proyecto Genoma del Cáncer
- Sitio web del Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer
