Articulo de referencia

Canonical correlation

In statistics , canonical-correlation analysis ( CCA ), also called canonical variates analysis , is a way of inferring information from cross-covariance matrices . If we have t...

In statistics, canonical-correlation analysis (CCA), also called canonical variates analysis, is a way of inferring information from cross-covariance matrices. If we have two vectors X = (X1, ..., Xn) and Y = (Y1, ..., Ym) of random variables, and there are correlations among the variables, then canonical-correlation analysis will find linear combinations of X and Y that have a maximum correlation with each other.[1] T. R. Knapp notes that "virtually all of the commonly encountered parametric tests of significance can be treated as special cases of canonical-correlation analysis, which is the general procedure for investigating the relationships between two sets of variables."[2] The method was first introduced by Harold Hotelling in 1936,[3] although in the context of angles between flats the mathematical concept was published by Camille Jordan in 1875.[4]

CCA is now a cornerstone of multivariate statistics and multi-view learning, and a great number of interpretations and extensions have been proposed, such as probabilistic CCA, sparse CCA, multi-view CCA, deep CCA,[5] and DeepGeoCCA.[6] Unfortunately, perhaps because of its popularity, the literature can be inconsistent with notation. We attempt to highlight such inconsistencies in this article to help the reader make best use of the existing literature and techniques available.

Like its sister method PCA, CCA can be viewed in population form (corresponding to random vectors and their covariance matrices) or in sample form (corresponding to datasets and their sample covariance matrices). These two forms are almost exact analogues of each other, which is why their distinction is often overlooked, but they can behave very differently in high dimensional settings.[7] We next give explicit mathematical definitions for the population problem and highlight the different objects in the so-called canonical decomposition - understanding the differences between these objects is crucial for interpretation of the technique.

Population CCA definition via correlations

Given two column vectorsX=(x1,,xn)T{\displaystyle X=(x_{1},\dots ,x_{n})^{T}} and Y=(y1,,ym)T{\displaystyle Y=(y_{1},\dots,y_{m})^{T}} of random variables with finitesecond moments, one may define the cross-covarianceΣXY=cov(X,Y){\displaystyle \Sigma _{XY}=\operatorname {cov} (X,Y)} to be the n×m{\displaystyle n\times m}matrix whose (i,j){\displaystyle (i,j)} entry is the covariancecov(xi,yj){\displaystyle \operatorname {cov} (x_ {i}, y_ {j})}. In practice, we would estimate the covariance matrix based on sampled data from X{\displaystyle X} and Y{\displaystyle Y} (i.e. from a pair of data matrices).

Canonical-correlation analysis seeks a sequence of vectors ak{\displaystyle a_{k}} (akRn{\displaystyle a_{k}\in \mathbb {R} ^{n}}) and bk{\displaystyle b_{k}} (bkRm{\displaystyle b_{k}\in \mathbb {R} ^{m}}) such that the random variables akTX{\displaystyle a_{k}^{T}X} and bkTY{\displaystyle b_{k}^{T}Y} maximize the correlationρ=corr(akTX,bkTY){\displaystyle \rho =\operatorname {corr} (a_{k}^{T}X,b_{k}^{T}Y)}. The (scalar) random variables U=a1TX{\displaystyle U=a_{1}^{T}X} and V=b1TY{\displaystyle V=b_{1}^{T}Y} are the first pair of canonical variables. Then one seeks vectors maximizing the same correlation subject to the constraint that they are to be uncorrelated with the first pair of canonical variables; this gives the second pair of canonical variables. This procedure may be continued up to min{m,n}{\displaystyle \min\{m,n\}} times.

(ak,bk)=argmaxa,bcorr(aTX,bTY) subject to cov(aTX,ajTX)=cov(bTY,bjTY)=0 for j=1,,k1{\displaystyle (a_{k},b_{k})={\underset {a,b}{\operatorname {argmax} }}\operatorname {corr} (a^{T}X,b^{T}Y)\quad {\text{ sujeto a }}\operatorname {cov} (a^{T}X,a_{j}^{T}X)=\operatorname {cov} (b^{T}Y,b_{j}^{T}Y)=0{\text{ para }}j=1,\dots ,k-1}

The sets of vectors ak,bk{\displaystyle a_{k},b_{k}} are called canonical directions or weight vectors or simply weights. The 'dual' sets of vectors ΣXXak,ΣYYbk{\displaystyle \Sigma _{XX}a_{k},\Sigma _{YY}b_{k}} are called canonical loading vectors or simply loadings; these are often more straightforward to interpret than the weights.[8]

Computation

Derivation

Let ΣXY{\displaystyle \Sigma _{XY}} be the cross-covariance matrix for any pair of (vector-shaped) random variables X{\displaystyle X} and Y{\displaystyle Y}. The target function to maximize is

ρ=aTΣXYbaTΣXXabTΣYYb.{\displaystyle \rho ={\frac {a^{T}\Sigma _{XY}b}{{\sqrt {a^{T}\Sigma _{XX}a}}{\sqrt {b^{T}\Sigma _{YY}b}}}}.}

The first step is to define a change of basis and define

c=ΣXX1/2a,{\displaystyle c=\Sigma _{XX}^{1/2}a,}
d=ΣYY1/2b,{\displaystyle d=\Sigma _{YY}^{1/2}b,}

where ΣXX1/2{\displaystyle \Sigma _{XX}^{1/2}} and ΣYY1/2{\displaystyle \Sigma _{YY}^{1/2}} can be obtained from the eigen-decomposition (or by diagonalization):

ΣXX1/2=VXDX1/2VX,VXDXVX=ΣXX,{\displaystyle \Sigma _{XX}^{1/2}=V_{X}D_{X}^{1/2}V_{X}^{\top },\qquad V_{X}D_{X}V_{X}^{\top }=\Sigma _{XX},}

and

ΣYY1/2=VYDY1/2VY,VYDYVY=ΣYY.{\displaystyle \Sigma _{YY}^{1/2}=V_{Y}D_{Y}^{1/2}V_{Y}^{\top },\qquad V_{Y}D_{Y}V_{Y}^{\top }=\Sigma _{YY}.}

Thus

ρ=cTΣXX1/2ΣXYΣYY1/2dcTcdTd.{\displaystyle \rho ={\frac {c^{T}\Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1/2}d}{{\sqrt {c^{T}c}}{\sqrt {d^{T}d}}}}.}

By the Cauchy–Schwarz inequality,

(cTΣXX1/2ΣXYΣYY1/2)(d)(cTΣXX1/2ΣXYΣYY1/2ΣYY1/2ΣYXΣXX1/2c)1/2(dTd)1/2,{\displaystyle \left(c^{T}\Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1/2}\right)(d)\leq \left(c^{T}\Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1/2}\Sigma _{YY}^{-1/2}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}c\right)^{1/2}\left(d^{T}d\right)^{1/2},}
ρ(cTΣXX1/2ΣXYΣYY1ΣYXΣXX1/2c)1/2(cTc)1/2.{\displaystyle \rho \leq {\frac {\left(c^{T}\Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}c\right)^{1/2}}{\left(c^{T}c\right)^{1/2}}}.}

There is equality if the vectors d{\displaystyle d} and ΣYY1/2ΣYXΣXX1/2c{\displaystyle \Sigma _{YY}^{-1/2}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}c} are collinear. In addition, the maximum of correlation is attained if c{\displaystyle c} is the eigenvector with the maximum eigenvalue for the matrix ΣXX1/2ΣXYΣYY1ΣYXΣXX1/2{\displaystyle \Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}}(Véase el cociente de Rayleigh ). Los pares subsiguientes se obtienen utilizando valores propios de magnitud decreciente. La ortogonalidad está garantizada por la simetría de las matrices de correlación.

Otra forma de ver este cálculo es quedo{\displaystyle c}yd{\displaystyle d}son los vectores singulares izquierdo y derecho de la matriz de correlación de X e Y correspondientes al valor singular más alto.

Solución

Por lo tanto, la solución es:

  • do{\displaystyle c}es un vector propio deΣincógnitaincógnita1/2ΣincógnitaYΣYY1ΣYincógnitaΣincógnitaincógnita1/2{\displaystyle \Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}}
  • d{\displaystyle d}es proporcional aΣYY1/2ΣYincógnitaΣincógnitaincógnita1/2do{\displaystyle \Sigma _{YY}^{-1/2}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1/2}c}

Recíprocamente, también existe:

  • d{\displaystyle d}es un vector propio deΣYY1/2ΣYincógnitaΣincógnitaincógnita1ΣincógnitaYΣYY1/2{\displaystyle \Sigma _{YY}^{-1/2}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1/2}}
  • do{\displaystyle c}es proporcional aΣincógnitaincógnita1/2ΣincógnitaYΣYY1/2d{\displaystyle \Sigma _{XX}^{-1/2}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1/2}d}

Invirtiendo el cambio de coordenadas, tenemos que

  • a{\displaystyle a}es un vector propio deΣincógnitaincógnita1ΣincógnitaYΣYY1ΣYincógnita{\displaystyle \Sigma _{XX}^{-1}\Sigma _{XY}\Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}},
  • b{\displaystyle b}es proporcional aΣYY1ΣYincógnitaa;{\displaystyle \Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}a;}
  • b{\displaystyle b}es un vector propio deΣYY1ΣYincógnitaΣincógnitaincógnita1ΣincógnitaY,{\displaystyle \Sigma _{YY}^{-1}\Sigma _{YX}\Sigma _{XX}^{-1}\Sigma _{XY},}
  • a{\displaystyle a}es proporcional aΣincógnitaincógnita1ΣincógnitaYb{\displaystyle \Sigma _{XX}^{-1}\Sigma _{XY}b}.

Las variables canónicas se definen mediante:

U=doTΣincógnitaincógnita1/2incógnita=aTincógnita{\displaystyle U=c^{T}\Sigma _{XX}^{-1/2}X=a^{T}X}
V=dTΣYY1/2Y=bTY{\displaystyle V=d^{T}\Sigma _{YY}^{-1/2}Y=b^{T}Y}

Implementación

El CCA se puede calcular utilizando la descomposición en valores singulares de una matriz de correlación. [ 9 ] Está disponible como una función en [ 10 ]

  • MATLAB como canoncorr ( también en Octave )
  • R como la función estándar cancor y varios otros paquetes, incluidos candisc , CCA y vegan . CCP para pruebas de hipótesis estadísticas en análisis de correlación canónica.
  • SAS como procedimiento cancorr
  • Python en la biblioteca scikit-learn , como descomposición cruzada y en statsmodels, como CanCorr . La biblioteca CCA-Zoo [ 11 ] implementa extensiones de CCA, como CCA probabilística, CCA dispersa, CCA multivista y CCA profunda.
  • SPSS como macro CanCorr incluido con el software principal
  • Julia (lenguaje de programación) en el paquete MultivariateStats.jl .

El cálculo de CCA mediante descomposición en valores singulares en una matriz de correlación está relacionado con el coseno de los ángulos entre planos . La función coseno está mal condicionada para ángulos pequeños, lo que lleva a un cálculo muy impreciso de vectores principales altamente correlacionados en aritmética computacional de precisión finita . Para solucionar este problema , existen algoritmos alternativos [ 12 ] disponibles en

  • SciPy como función de álgebra lineal subspace_angles
  • MATLAB como subespacio de función de FileExchange

Prueba de hipótesis

Cada fila puede ser probada para determinar su significancia con el siguiente método. Dado que las correlaciones están ordenadas, decir que la filai{\displaystyle i}es cero implica que todas las correlaciones posteriores también son cero. Si tenemospag{\displaystyle p}observaciones independientes en una muestra yρ^i{\displaystyle {\widehat {\rho }}_{i}}es la correlación estimada parai=1,,min{metro,norte}{\displaystyle i=1,\dots ,\min\{m,n\}}. Para eli{\displaystyle i}En la fila n, el estadístico de prueba es:

χ2=(pag112(metro+norte+1))lnj=imin{metro,norte}(1ρ^j2),{\displaystyle \chi ^{2}=-\left(p-1-{\frac {1}{2}}(m+n+1)\right)\ln \prod _{j=i}^{\min\{m,n\}}(1-{\widehat {\rho }}_{j}^{2}),}

que se distribuye asintóticamente como una chi-cuadrado con(metroi+1)(nortei+1){\displaystyle (m-i+1)(n-i+1)}grados de libertad para grandespag{\displaystyle p}. [ 13 ] Dado que todas las correlaciones demin{metro,norte}{\displaystyle \min\{m,n\}}apag{\displaystyle p}son lógicamente cero (y se estiman de esa manera también) el producto para los términos después de este punto es irrelevante.

Tenga en cuenta que en el límite de tamaño de muestra pequeño conpag<norte+metro{\displaystyle p<n+m}entonces tenemos la garantía de que lo mejormetro+nortepag{\displaystyle m+n-p}Las correlaciones serán idénticamente 1 y, por lo tanto, la prueba carece de sentido. [ 14 ]

Usos prácticos

Un uso típico de la correlación canónica en el contexto experimental es tomar dos conjuntos de variables y ver qué tienen en común. [ 15 ] Por ejemplo, en las pruebas psicológicas, se podrían tomar dos pruebas de personalidad multidimensionales bien establecidas , como el Inventario Multifásico de Personalidad de Minnesota (MMPI-2) y el NEO . Al ver cómo se relacionan los factores del MMPI-2 con los factores del NEO, se podría obtener información sobre qué dimensiones eran comunes entre las pruebas y cuánta varianza se compartía. Por ejemplo, se podría encontrar que una dimensión de extraversión o neuroticismo explicaba una cantidad sustancial de varianza compartida entre las dos pruebas.

También se puede utilizar el análisis de correlación canónica para generar una ecuación modelo que relacione dos conjuntos de variables, por ejemplo, un conjunto de medidas de rendimiento y un conjunto de variables explicativas, o un conjunto de salidas y un conjunto de entradas. Se pueden imponer restricciones a dicho modelo para asegurar que refleje los requisitos teóricos o condiciones intuitivamente obvias. Este tipo de modelo se conoce como modelo de correlación máxima. [ 16 ]

La visualización de los resultados de la correlación canónica se realiza generalmente mediante gráficos de barras de los coeficientes de los dos conjuntos de variables para los pares de variables canónicas que muestran una correlación significativa. Algunos autores sugieren que la mejor manera de visualizarlos es representándolos como heliógrafos, un formato circular con barras en forma de rayos, donde cada mitad representa los dos conjuntos de variables. [ 17 ]

Ejemplos

Dejarincógnita=incógnita1{\displaystyle X=x_{1}}con valor esperado cero , es decir,mi(incógnita)=0{\displaystyle \operatorname {E} (X)=0}.

  1. SiY=incógnita{\displaystyle Y=X}, es decir,incógnita{\displaystyle X}yY{\displaystyle Y}están perfectamente correlacionados, entonces, por ejemplo,a=1{\displaystyle a=1}yb=1{\displaystyle b=1}, de modo que el primer (y único en este ejemplo) par de variables canónicas esU=incógnita{\displaystyle U=X}yV=Y=incógnita{\displaystyle V=Y=X}.
  2. SiY=incógnita{\displaystyle Y=-X}, es decir,incógnita{\displaystyle X}yY{\displaystyle Y}están perfectamente anticorrelacionados, entonces, por ejemplo,a=1{\displaystyle a=1}yb=1{\displaystyle b=-1}, de modo que el primer (y único en este ejemplo) par de variables canónicas esU=incógnita{\displaystyle U=X}yV=Y=incógnita{\displaystyle V=-Y=X}.

Observamos que en ambos casosU=V{\displaystyle U=V}, lo que demuestra que el análisis de correlación canónica trata las variables correlacionadas y anticorrelacionadas de manera similar.

Conexión con los ángulos principales

Suponiendo queincógnita=(incógnita1,,incógnitanorte)T{\displaystyle X=(x_{1},\dots ,x_{n})^{T}}yY=(y1,,ymetro)T{\displaystyle Y=(y_{1},\dots ,y_{m})^{T}}tienen valores esperados cero , es decir,mi(incógnita)=mi(Y)=0{\displaystyle \operatorname {E} (X)=\operatorname {E} (Y)=0}, sus matrices de covarianzaΣincógnitaincógnita=Cov(incógnita,incógnita)=mi[incógnitaincógnitaT]{\displaystyle \Sigma _{XX}=\operatorname {Cov} (X,X)=\operatorname {E} [XX^{T}]}yΣYY=Cov(Y,Y)=mi[YYT]{\displaystyle \Sigma _{YY}=\operatorname {Cov} (Y,Y)=\operatorname {E} [YY^{T}]}pueden verse como matrices de Gram en un producto interno para las entradas de incógnita{\displaystyle X}yY{\displaystyle Y}, correspondientemente. En esta interpretación, las variables aleatorias, entradasincógnitai{\displaystyle x_{i}}de incógnita{\displaystyle X}yyj{\displaystyle y_{j}}deY{\displaystyle Y}se tratan como elementos de un espacio vectorial con un producto interno dado por la covarianzacobertura(incógnitai,yj){\displaystyle \operatorname {cov} (x_{i},y_{j})}; véase Covarianza#Relación con productos internos .

La definición de las variables canónicasU{\displaystyle U}yV{\displaystyle V}es entonces equivalente a la definición de vectores principales para el par de subespacios generados por las entradas de incógnita{\displaystyle X}yY{\displaystyle Y}con respecto a este producto interno . Las correlaciones canónicascorr(U,V){\displaystyle \operatorname {corr} (U,V)}es igual al coseno de los ángulos principales .

Blanqueamiento y análisis de correlación canónica probabilística

CCA también puede considerarse una transformación de blanqueamiento especial donde los vectores aleatoriosincógnita{\displaystyle X}yY{\displaystyle Y}se transforman simultáneamente de tal manera que la correlación cruzada entre los vectores blanqueadosincógnitadodoA{\displaystyle X^{CCA}}yYdodoA{\displaystyle Y^{CCA}}es diagonal. [ 18 ] Las correlaciones canónicas se interpretan entonces como coeficientes de regresión que vinculanincógnitadodoA{\displaystyle X^{CCA}}yYdodoA{\displaystyle Y^{CCA}}y también puede ser negativo. La perspectiva de regresión del CCA también proporciona una forma de construir un modelo generativo probabilístico de variables latentes para el CCA, con variables ocultas no correlacionadas que representan la variabilidad compartida y no compartida. [ 19 ]

Véase también

  • Análisis de correlación discriminante (DCA) [ 20 ] ( MATLAB )
  • Hardoon, DR; Szedmak, S.; Shawe-Taylor, J. (2004). "Análisis de correlación canónica: una visión general con aplicación a métodos de aprendizaje". Neural Computation . 16 (12): 2639– 2664. CiteSeerX 10.1.1.14.6452 . doi : 10.1162/0899766042321814 . PMID 15516276 . S2CID 202473 .   
  • Una nota sobre el análisis de correlación canónica ordinal de dos conjuntos de puntuaciones de clasificación (también proporciona un programa FORTRAN ) - en Journal of Quantitative Economics 7(2), 2009, pp.  173–199
  • Análisis de correlación canónica con restricciones de representación: una hibridación de la correlación canónica y el análisis de componentes principales (también incluye un programa en FORTRAN ) - en Journal of Applied Economic Sciences 4(1), 2009, pp.  115–124

Referencias

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  2. Knapp, TR (1978). "Análisis de correlación canónica: un sistema general de prueba de significancia paramétrica". Psychological Bulletin . 85 (2): 410– 416. doi : 10.1037/0033-2909.85.2.410 .
  3. Hotelling, H. (1936). "Relaciones entre dos conjuntos de variables". Biometrika . 28 ( 3–4 ): 321–377 . doi : 10.1093/biomet/28.3-4.321 . JSTOR 2333955 . 
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