Articulo de referencia

Curva de Carlson

Coste total de la secuenciación de un genoma humano a lo largo del tiempo, según los cálculos del NHGRI . La curva de Carlson es un término que describe la tasa de secuenciación...

Coste total de la secuenciación de un genoma humano a lo largo del tiempo, según los cálculos del NHGRI .

La curva de Carlson es un término que describe la tasa de secuenciación de ADN o el costo por base secuenciada en función del tiempo. [ 1 ] Es el equivalente biotecnológico de la ley de Moore . Carlson predijo que el tiempo de duplicación de las tecnologías de secuenciación de ADN (medido por el costo y el rendimiento) sería al menos tan rápido como la ley de Moore. [ 2 ]

Historia

El término fue acuñado por The Economist [ 3 ] y lleva el nombre del autor Rob Carlson . [ 1 ]

Las curvas de Carlson ilustran la rápida disminución (en algunos casos superior al crecimiento exponencial ) del coste y el aumento del rendimiento de diversas tecnologías, como la secuenciación de ADN, la síntesis de ADN y una gama de herramientas físicas y computacionales utilizadas en la producción de proteínas y en la determinación de las estructuras proteicas .

secuenciación de próxima generación

Área de secuenciación en BGI Hong Kong, donde se muestran los secuenciadores Illumina HiSeq 2000.

La Ley de Moore comenzó a ser superada profundamente en enero de 2008 cuando los centros pasaron de la secuenciación de Sanger a tecnologías de secuenciación de ADN más nuevas: [ 4 ] secuenciación 454 con una longitud de lectura promedio de 300-400 bases (10 veces) secuenciación Illumina y SOLiD con una longitud de lectura promedio de 50-100 bases (30 veces).

Referencias

  1. 1 2 Robert H. Carlson (abril de 2011). La biología es tecnología  : la promesa, el peligro y el nuevo negocio de la ingeniería de la vida . Cambridge, MA: Harvard University Press .
  2. Robert Carlson (septiembre de 2003). "El ritmo y la proliferación de las tecnologías biológicas" . Bioseguridad y bioterrorismo: estrategia, práctica y ciencia de la biodefensa . 1 (3: 203–214): 203–214 . doi : 10.1089/153871303769201851 . PMID 15040198 . 
  3. "Vida 2.0" . The Economist. 31 de agosto de 2006.
  4. "Costos de secuenciación de ADN" . Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano .