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Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos

El Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos es un instituto de investigación en genómica computacional ubicado en Oxfordshire. Historia El Centro para la Vigilancia Genómica d...

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El Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos es un instituto de investigación en genómica computacional ubicado en Oxfordshire.

Historia

El Centro para la Vigilancia Genómica de Patógenos abrió sus puertas en 2015 como un proyecto conjunto entre el Imperial College de Londres y el Instituto Wellcome Sanger. En 2017 se anunció que el centro albergaría una nueva Unidad de Investigación en Salud Global financiada por el Instituto Nacional de Investigación en Salud (NIHR) para estudiar la resistencia a los antibióticos . [ 1 ] [ 2 ] Esto ha llevado al centro a participar en la vigilancia de la resistencia a los antibióticos en varios países, por ejemplo, Filipinas. [ 3 ]

Entre 2018 y 2021, el Wellcome Sanger Institute y la Universidad de Oxford organizaron conjuntamente el CGPS. Desde septiembre de 2021, el CGPS ​​tiene su sede en la Universidad de Oxford.

Durante la pandemia de COVID-19 , el centro recibió financiación como parte del consorcio COG-UK . [ 4 ]

El 22 de septiembre de 2022 se anunció que el Centro para la Vigilancia Genómica de Patógenos, perteneciente al Instituto de Big Data de la Universidad de Oxford, recibió una financiación de 7 millones de libras esterlinas para su labor como Unidad de Investigación en Salud Global (GHRU) del NIHR durante los próximos cinco años. La investigación y el desarrollo de capacidades del Centro se centran en la aplicación de la genómica y la generación de datos para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos (RAM). [ 5 ]

Estructura

El director del centro es David Aanensen. [ 6 ] [ 7 ]

En 2019, se acordó que habría colaboración entre el Centro de Vigilancia de Patógenos Genómicos, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades y el Instituto Wellcome Sanger , con el fin de mejorar la vigilancia y el seguimiento de las enfermedades infecciosas en toda Europa. [ 8 ]

Aplicaciones creadas en el centro

Bajo los auspicios del centro, se han generado y compartido las aplicaciones Epicollect5 (utilizada para la entrada de datos de observadores distribuidos, por ejemplo, por programas de "ciencia ciudadana"), Microreact [ 9 ] [ 10 ] y Pathogenwatch. [ 6 ] Microreact [ 11 ] ha tenido un uso extensivo durante la pandemia de COVID-19 y es un componente de la herramienta de software Asignación filogenética de linajes de brotes globales con nombre (pangolin). [ 7 ] [ 12 ] [ 13 ]

Ubicación

El centro está ubicado en el Instituto de Big Data , Departamento de Medicina Nuffield, Universidad de Oxford .

Véase también

Referencias

  1. ↑ "Financiación y premios" . fundingawards.nihr.ac.uk . Consultado el 2 de marzo de 2021 .
  2. ↑ "El Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos albergará la Unidad de Investigación en Salud Global para monitorear las bacterias resistentes a los antibióticos en todo el mundo" . www.sanger.ac.uk . 21 de julio de 2017. Consultado el 7 de marzo de 2021 .
  3. ↑ Argimón, Silvia; Masim, Melissa AL; Gayeta, junio M.; Lagrada, Marietta L.; MacAranas, Polle KV; Cohen, Victoria; Limas, Marilyn T.; Espíritu, Holly O.; Palarca, Janziel C.; Chilam, Jeremías; Jamoralín, Manuel C.; Villamín, Alfred S.; Borlasa, Janice B.; Olorosa, Agnettah M.; Hernández, Lara FT; Boehme, Karis D.; Jeffrey, Benjamín; Abudahab, Khalil; Hufano, Charmian M.; Sia, Sonia B.; Stelling, John; Holden, Mateo TG; Aanensen, David M.; Carlos, Celia C. (1 de junio de 2020). "Integración de la secuenciación del genoma completo en el Programa Nacional de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos en Filipinas" . Comunicaciones de la naturaleza . 11 (1): 2719. Bibcode : 2020NatCo..11.2719A . doi : 10.1038/s41467-020-16322-5 . PMC 7264328 . PMID 32483195 . S2CID 219156667 .   
  4. ↑ Paul Brackley (20 de noviembre de 2020). "Una financiación de 12,2 millones de libras ayudará al COG-UK, liderado por Cambridge, a ampliar la vigilancia genómica de la COVID-19" . www.cambridgeindependent.co.uk . Consultado el 8 de marzo de 2021 .
  5. ↑ "Nueva e importante unidad de investigación en salud global del NIHR se centrará en la ciencia de datos y la vigilancia genómica de la resistencia a los antimicrobianos — Oxford Big Data Institute" . www.bdi.ox.ac.uk. Consultado el 4 de noviembre de 2022 .
  6. 1 2 Profesor David Aanensen, Director del Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos y Jefe de Grupo www.sanger.ac.uk , consultado el 7 de marzo de 2021
  7. 1 2 David Aanensen Director del Centro de Vigilancia Genómica de Patógenos 2021 www.ndm.ox.ac.uk , consultado el 7 de marzo de 2021
  8. ↑ Compromiso de colaborar en el uso de la genómica para la vigilancia de patógenos en toda Europa , 14 de marzo de 2019 , www.sanger.ac.uk , consultado el 7 de marzo de 2021
  9. ↑ Los hospitales en Europa están contribuyendo a la propagación de bacterias extremadamente resistentes a los medicamentos. 30 de julio de 2019, www.zmescience.com , consultado el 8 de marzo de 2021.
  10. ↑ Seguimiento de infecciones por superbacterias en Europa , 5 de mayo de 2016 , www.sciencedaily.com , consultado el 8 de marzo de 2021
  11. ↑ "Microreact ha sido desarrollado por el Centro de Vigilancia de Patógenos Genómicos del Imperial College de Londres y el Wellcome Genome Campus" microreact.org , consultado el 8 de marzo de 2021.
  12. ↑ "Lanzamiento de la aplicación web Pangolin" . virological.org . Mayo de 2020. Consultado el 18 de febrero de 2021 .
  13. ↑ Cómo el Consorcio de Genómica del Covid-19 del Reino Unido secuenció el SARS-CoV-2 12 de abril de 2021 www.computerweekly.com , consultado el 26 de mayo de 2021
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