Carlos Ofria

Charles A. Ofria es profesor en el Departamento de Ciencias Informáticas e Ingeniería de la Universidad Estatal de Michigan , director del Laboratorio de Evolución Digital (DEvo) de la misma y director del Centro BEACON para el Estudio de la Evolución en Acción. Es hijo del difunto Charles Ofria, ^[3] quien desarrolló el primer programa de gestión de talleres totalmente integrado para la industria de reparación de automóviles. Ofria asistió a la escuela secundaria Stuyvesant y se graduó de la escuela secundaria Ward Melville en 1991. Obtuvo una licenciatura en Ciencias Informáticas, Matemáticas Puras y Matemáticas Aplicadas de la Universidad Stony Brook en 1994, y un doctorado en Computación y Sistemas Neuronales del Instituto de Tecnología de California en 1999. La investigación de Ofria se centra en la interacción entre la informática y la evolución darwiniana. ^[4]

Ofria es uno de los diseñadores de Avida , una plataforma de software de vida artificial para estudiar la biología evolutiva de programas informáticos autorreplicantes y evolutivos ( organismos digitales , véase también Simuladores de organismos digitales ). Avida se ha utilizado ampliamente para estudiar los procesos básicos que subyacen a la evolución darwiniana. ^[5] Avida se encuentra en desarrollo activo en el Laboratorio de Evolución Digital de Ofria en la Universidad Estatal de Michigan y fue diseñado originalmente por Ofria, Chris Adami y C. Titus Brown en Caltech en 1993.

Honores

Ofria recibió el Premio a la Carrera de la NSF en 2007 ^[6] y el Premio a la Excelencia Withrow por la Excelencia en la Enseñanza en 2010 ^[7] y por la Excelencia en la Investigación en 2006 y 2016. ^[8] También fue ganador en 2017 del Premio a la Facultad Destacada William J. Beal ^[9] y en 2022 fue incluido como miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia ^[10].

Publicaciones de revistas representativas

Clune J, Pennock RT, Ofria C, Lenski RE (2012) La ontogenia tiende a recapitular la filogenia en los organismos digitales" The American Naturalist 180: E54–E63. (pdf)
Clune J, Goldsby HJ, Ofria C y Pennock RT (2011) Presiones selectivas para una selección precisa del altruismo: evidencia de la evolución digital para aspectos difíciles de probar de la teoría de la aptitud inclusiva. Actas de la Royal Society. 278: 666-674. (PDF)
Clune J, Stanley KO, Pennock RT, Ofria C (2011) Sobre el rendimiento de la codificación indirecta en el continuo de regularidad. IEEE Transactions on Evolutionary Computation. 15(3): 346-367. (PDF)
Clune J, Misevic D, Ofria C, Lenski RE, Elena SF y Sanjuán R. La selección natural no logra optimizar las tasas de mutación para la adaptación a largo plazo en paisajes de aptitud física accidentados ^[11]
Ofria C, Huang W y Torng E. Sobre la evolución gradual de la complejidad y la aparición repentina de características complejas ^[12]
Elena SF, Wilke CO, Ofria C y Lenski RE. Efectos del tamaño de la población y la tasa de mutación en la evolución de la robustez mutacional ^[13]
Ostrowski E, Ofria C y Lenski RE, Especialización ecológica y decadencia adaptativa en organismos digitales ^[14]
Lenski RE, Barrick JE, Ofria C. Equilibrio entre robustez y capacidad de evolución ^[15]
Misevic D, Ofria C y Lenski RE. La reproducción sexual reconfigura la arquitectura genética de los organismos digitales ^[16]

Publicaciones científicas seleccionadas que incluyen a Avida

RE Lenski , C. Ofria, TC Collier, C. Adami (1999). Complejidad genómica, robustez e interacciones genéticas en organismos digitales. Nature 400: 661-664. Resumen
C. Adami , C. Ofria y TC Collier (2000). Evolución de la complejidad biológica. "Proceedings of the National Academy of Sciences" 97 :4463-4468. Resumen
CO Wilke, JL Wang, C. Ofria, RE Lenski y C. Adami (2001). La evolución de los organismos digitales a una tasa de mutación elevada conduce a la supervivencia de los más planos. Nature 412: 331-333. Resumen.
RE Lenski , C. Ofria, RT Pennock y C. Adami (2003). El origen evolutivo de las características complejas. Nature 423: 139-145. Resumen
SS Chow, CO Wilke, C. Ofria, RE Lenski y C. Adami (2004). Radiación adaptativa a partir de la competencia por recursos en organismos digitales. Science 305: 84-86 Resumen.

Referencias

^ "Ofria y Owen reciben los premios Withrow". Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 4 de junio de 2016. Consultado el 2 de octubre de 2017 .
^ "Ofria y Tan reciben premios Withrow". Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 25 de marzo de 2015. Consultado el 2 de octubre de 2017 .
^ "Charles Ofria (senior)". FamilyCar.com. Archivado desde el original el 8 de febrero de 2013. Consultado el 11 de diciembre de 2011 .
^ Ciencias de la Computación Universidad Estatal de Michigan
^ "Poniendo a prueba a Darwin". Revista Discover . Febrero de 2005.
^ "Charles Ofria recibe el premio NSF CAREER". Universidad Estatal de Michigan . 2007. Archivado desde el original el 6 de abril de 2012.
^ "Ofria y Tan reciben premios Withrow". 2010.
^ "Jain, Ofria y Stirewalt ganan los premios Withrow". 2006.
^ "Premios William J. Beal a la Facultad Destacada 2017". 2017.
^ "Ofria nombrado miembro de la AAAS en un año récord para los inducidos espartanos - Ecología, evolución y comportamiento". 2022.
^ Clune, J; Misevic, D; Ofria, C; Lenski, RE; Elena, SF; Sanjuán, R (2008). "La selección natural no logra optimizar las tasas de mutación para la adaptación a largo plazo en paisajes de aptitud física accidentados". PLOS Computational Biology . 4 (9): e1000187. Bibcode :2008PLSCB...4E0187C. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000187 . PMC 2527516 . PMID 18818724.
^ Ofria, Charles; Huang, Wei; Torng, Eric (2007). "Sobre la evolución gradual de la complejidad y la aparición repentina de características complejas". Vida artificial . 14 (3): 255– 263. doi :10.1162/artl.2008.14.3.14302. PMID 18489251. S2CID 2010637.
^ Elena, Santiago F.; Wilke, Claus O.; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Efectos del tamaño de la población y la tasa de mutación en la evolución de la robustez mutacional". Evolution . 61 (3): 666– 674. doi : 10.1111/j.1558-5646.2007.00064.x . PMID 17348929. S2CID 14353070.
^ Ostrowski, Elizabeth A.; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Especialización ecológica y decadencia adaptativa en organismos digitales". The American Naturalist . 169 (1): E1–20. Bibcode :2007ANat..169E...1O. doi :10.1086/510211. JSTOR 10.1086/510211. PMID 17206577. S2CID 15024491.
^ Lenski, RE; Barrick, JE; Ofria, C (2006). "Equilibrio entre robustez y capacidad de evolución". PLOS Biology . 4 (12): e428. doi : 10.1371/journal.pbio.0040428 . PMC 1750925 . PMID 17238277.
^ Misevic, Dusan; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2005). "La reproducción sexual reconfigura la arquitectura genética de los organismos digitales". Actas de la Royal Society B: Biological Sciences . 273 (1585): 457– 464. doi :10.1098/rspb.2005.3338. PMC 1560214 . PMID 16615213.

Enlaces externos

Software Avida
Proyecto Avida-ED, dirigido por Robert T. Pennock
Un sitio para desarrolladores de Avida
El origen evolutivo de las características adaptativas complejas Archivado el 2 de marzo de 2009 en Wayback Machine Artículo de 2003 en Nature
Podcast 2010 con Carl Zimmer en Microbe WORLD
Publicaciones de Ofria sobre citas de Google Scholar

[1] "Ofria y Owen reciben los premios Withrow". Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 4 de junio de 2016. Consultado el 2 de octubre de 2017 .

[2] "Ofria y Tan reciben premios Withrow". Universidad Estatal de Michigan . Archivado desde el original el 25 de marzo de 2015. Consultado el 2 de octubre de 2017 .

[3] "Charles Ofria (senior)". FamilyCar.com. Archivado desde el original el 8 de febrero de 2013. Consultado el 11 de diciembre de 2011 .

[4] Ciencias de la Computación Universidad Estatal de Michigan

[5] "Poniendo a prueba a Darwin". Revista Discover . Febrero de 2005.

[6] "Charles Ofria recibe el premio NSF CAREER". Universidad Estatal de Michigan . 2007. Archivado desde el original el 6 de abril de 2012.

[7] "Ofria y Tan reciben premios Withrow". 2010.

[8] "Jain, Ofria y Stirewalt ganan los premios Withrow". 2006.

[9] "Premios William J. Beal a la Facultad Destacada 2017". 2017.

[10] "Ofria nombrado miembro de la AAAS en un año récord para los inducidos espartanos - Ecología, evolución y comportamiento". 2022.

[11] Clune, J; Misevic, D; Ofria, C; Lenski, RE; Elena, SF; Sanjuán, R (2008). "La selección natural no logra optimizar las tasas de mutación para la adaptación a largo plazo en paisajes de aptitud física accidentados". PLOS Computational Biology . 4 (9): e1000187. Bibcode :2008PLSCB...4E0187C. doi : 10.1371/journal.pcbi.1000187 . PMC 2527516 . PMID 18818724.

[12] Ofria, Charles; Huang, Wei; Torng, Eric (2007). "Sobre la evolución gradual de la complejidad y la aparición repentina de características complejas". Vida artificial . 14 (3): 255– 263. doi :10.1162/artl.2008.14.3.14302. PMID 18489251. S2CID 2010637.

[13] Elena, Santiago F.; Wilke, Claus O.; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Efectos del tamaño de la población y la tasa de mutación en la evolución de la robustez mutacional". Evolution . 61 (3): 666– 674. doi : 10.1111/j.1558-5646.2007.00064.x . PMID 17348929. S2CID 14353070.

[14] Ostrowski, Elizabeth A.; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2007). "Especialización ecológica y decadencia adaptativa en organismos digitales". The American Naturalist . 169 (1): E1–20. Bibcode :2007ANat..169E...1O. doi :10.1086/510211. JSTOR 10.1086/510211. PMID 17206577. S2CID 15024491.

[15] Lenski, RE; Barrick, JE; Ofria, C (2006). "Equilibrio entre robustez y capacidad de evolución". PLOS Biology . 4 (12): e428. doi : 10.1371/journal.pbio.0040428 . PMC 1750925 . PMID 17238277.

[16] Misevic, Dusan; Ofria, Charles; Lenski, Richard E. (2005). "La reproducción sexual reconfigura la arquitectura genética de los organismos digitales". Actas de la Royal Society B: Biological Sciences . 273 (1585): 457– 464. doi :10.1098/rspb.2005.3338. PMC 1560214 . PMID 16615213.