Araña química

La base de datos ChemSpider se puede actualizar con contribuciones de los usuarios, incluyendo el depósito de estructuras químicas , espectros y curación por parte de los usuarios. Este es un enfoque de colaboración abierta para desarrollar una base de datos química en línea. La curación de datos mediante colaboración abierta ha generado un diccionario de nombres químicos asociados a estructuras químicas que se ha utilizado en aplicaciones de minería de texto de la literatura biomédica y química. ^{[ 10 ]}

Sin embargo, no se renuncia a los derechos sobre la base de datos y no está disponible un volcado de datos ; de hecho, las preguntas frecuentes incluso afirman que solo se permiten descargas limitadas: ^{[ 11 ]} por lo tanto, no se garantiza el derecho a bifurcar y el proyecto no puede considerarse libre / abierto .

Se proporcionan varios módulos de búsqueda disponibles:

• La búsqueda estándar permite consultar nombres sistemáticos , nombres comerciales y sinónimos, así como números de registro.
• La búsqueda avanzada permite realizar búsquedas interactivas por estructura química, subestructura química, fórmula molecular, rango de peso molecular , números CAS , proveedores, etc. La búsqueda puede utilizarse para ampliar o restringir los resultados ya encontrados.
• La búsqueda de estructuras en dispositivos móviles se puede realizar utilizando aplicaciones gratuitas para iOS (iPhone/iPod/iPad) ^{[ 12 ]} y para Android (sistema operativo) . ^{[ 13 ]}

La base de datos ChemSpider se ha utilizado en combinación con minería de texto como base para el marcado de documentos químicos . ChemMantis, ^{[ 14 ]} el Sistema Integrado de Transformación de Marcado y Nomenclatura Química utiliza algoritmos para identificar y extraer nombres químicos de documentos y páginas web, y los convierte en estructuras químicas mediante algoritmos de conversión de nombre a estructura y búsquedas en diccionarios de la base de datos ChemSpider. El resultado es un sistema integrado entre documentos químicos y la búsqueda de información a través de ChemSpider en más de 150 fuentes de datos.

SyntheticPages es una base de datos interactiva gratuita de procedimientos de química sintética operada por la Royal Society of Chemistry . ^{[ 15 ]} Los usuarios envían procedimientos sintéticos que han realizado ellos mismos para su publicación en el sitio. Estos procedimientos pueden ser trabajos originales, pero con mayor frecuencia se basan en reacciones de la literatura. Se hacen citas al procedimiento original publicado cuando corresponde. Son revisados ​​por un editor científico antes de su publicación. Las páginas no se someten a una revisión por pares formal como un artículo de revista científica , pero los usuarios registrados pueden hacer comentarios. Los comentarios también son moderados por editores científicos. La intención es recopilar experiencia práctica sobre cómo realizar síntesis químicas útiles en el laboratorio. Mientras que los métodos experimentales publicados en una revista académica ordinaria se enumeran de manera formal y concisa, los procedimientos en ChemSpider SyntheticPages se presentan con más detalle práctico. Se fomenta la informalidad. También se incluyen los comentarios de los remitentes. Otras publicaciones con cantidades de detalle comparables incluyen Organic Syntheses e Inorganic Syntheses . El sitio SyntheticPages fue creado originalmente por los profesores Kevin Booker-Milburn ( Universidad de Bristol ), Stephen Caddick ( University College London ), Peter Scott ( Universidad de Warwick ) y Max Hammond. En febrero de 2010 se anunció una fusión ^{[ 16 ]} con el motor de búsqueda de estructuras químicas ChemSpider de la Royal Society of Chemistry y la formación de ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP).

Se ofrecen diversos servicios en línea. Estos incluyen la conversión de nombres químicos a estructuras químicas , la generación de cadenas SMILES e InChI , así como la predicción de numerosos parámetros fisicoquímicos y la integración con un servicio web que permite la predicción mediante RMN .

ChemSpider funcionó como repositorio de compuestos químicos en el marco del proyecto Open PHACTS , una iniciativa de medicamentos innovadores . Open PHACTS se desarrolló siguiendo estándares abiertos, con un enfoque de acceso abierto y web semántica para abordar los obstáculos en el descubrimiento de fármacos de molécula pequeña: fuentes de información dispares, falta de estándares y sobrecarga de información. ^{[ 18 ]}