Quitinophagaceae

Chitinophagaceae es una familia de bacterias aerobias o anaerobias facultativas y con forma de bastón perteneciente al filo Bacteroidota . ^[⁴^]^[⁵^]^[⁶^]^[⁷^]^[⁸^]

Genera

Agriterribacter Lee y Whang 2020
Arachidicoccus Madhaiyan et al . 2015
Arvibacter Chaudhary y Kim 2016
Aurantisolimonas Liu et al . 2018
Chitinophaga Sangkhobol y Skerman 1981
Cnuella Zhao y otros . 2014
Compostibacter Siddiqi et al . 2016
Deminuibacter Wang et al . 2019
Dinghuibacter Lv et al . 2016
Edaphobaculum Cao et al . 2017
" Edaphocola " Choi et al . 2019
Ferruginibacter Lim et al . 2009
Filimonas Shiratori et al . 2009
Flaviaesturariibacter Kang et al . 2015
Flavihumibacter Zhang et al . 2010
Flavipsychrobacter Liu et al . 2018
Flavisolibacter Yoon e Im 2007
Flavitalea Wang y otros . 2011
" Foetidibacter " Pu et al . 2021
" Ginsengibacter " Siddiqi et al . 2021
Gynurincola Zhang et al . 2019
Haoranjiania Zhang et al . 2016
Helimonas Leandro et al . 2013
Hydrobacter Eder et al . 2015
Hydrotalea Kämpfer et al . 2011
" Ilyomonas " Chhetri et al . 2019
Lacibacter Qu et al . 2009
Mucibacter Kim et al . 2020
Nemorincola Chaudhary et al . 2018
Niabella Kim y otros . 2007
Niastella Weon y otros . 2006
Niveitalea Hyeon et al . 2017
Panacibacter Siddiqi et al . 2016
Paracnuella Wang et al . 2019
Parafilimonas Kim et al . 2014
Paraflavitalea Heo et al . 2020
Parapseudoflavitalea Lawson et al . 2020
Parasediminibacterium Kang y col . 2016
Parasegetibacter Zhang et al . 2009
Phnomibacter Siddiqi y col . 2021
Pseudobacter Siddiqi e Im 2016
" Pseudocnuella " Maeng et al . 2021
Pseudoflavitalea Kim et al . 2016
Puia Lv et al . 2017
Rurimicrobium Dahal et al . 2017
Sediminibacterium Qu y Yuan 2008
Segetibacter An et al . 2007
" Solibius " Kim et al . 2010
Taibaiella Zhang y otros . 2013
Terrimonas Xie y Yokota 2006
Thermoflavifilum Anders et al . 2014

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura ^{[ 4 ]} y la filogenia se basa en secuencias de genoma completo. ^{[ 9 ]}^{[ a ]}

Notas

↑ Agriterribacter , Arvibacter , Aurantisolimonas , Compostibacter , Deminuibacter , Dinghuibacter , Edaphobaculum , Ferruginibacter , Flaviaesturariibacter , Flavipsychrobacter , Flavitalea , Gynurincola , Haoranjiania , Heliimonas , Lacibacter , Mucibacter , Nemorincola , Niveitalea , Panacibacter , Paracnuella , Paraflavitalea , Parapseudoflavitalea , Parasediminibacterium , Parasegetibacter , Phnomibacter , Pseudobacter , Pseudoflavitalea , Puia y Rurimicrobium no están incluidos en este árbol filogenético.

Referencias

↑ Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Filogenia revisada de Bacteroidetes y propuesta de dieciséis nuevos taxones y dos nuevas combinaciones, incluyendo Rhodothermaeota phyl. nov". Syst Appl Microbiol . 39 (5): 281– 296. Bibcode : 2016SyApM..39..281M . doi : 10.1016/j.syapm.2016.04.004 . PMID 27287844 .
↑ Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Corrección a "Filogenia revisada de Bacteroidetes y propuesta de dieciséis nuevos taxones y dos nuevas combinaciones que incluyen Rhodothermaeota phyl. nov." [ Syst. Appl. Microbiol . 39 (5) (2016) 281–296]". Syst Appl Microbiol . 39 (7): 491– 492. Bibcode : 2016SyApM..39..491M . doi : 10.1016/j.syapm.2016.08.006 . PMID 27639921 .
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1 2 Parker, Charles Thomas; Taylor, Dorothea; Garrity, George M (8 de octubre de 2009). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Resumen taxonómico para las familias". NamesforLife, LLC. doi : 10.1601/tx.14400 .{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )
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↑ Ralebitso-Senior, T. Komang (2018). Ecogenómica forense: Aplicación de análisis de ecología microbiana en contextos forenses . Academic Press. ISBN 9780128096093.
↑ García-López M, Meier-Kolthoff JP, Tindall BJ, Gronow S, Woyke T, Kyrpides NC, Hahnke RL, Göker M (2019). " Análisis de 1000 genomas de cepas tipo mejora la clasificación taxonómica de Bacteroidetes " . Front Microbiol . 10 : 2083. doi : 10.3389/fmicb.2019.02083 . PMC 6767994. PMID 31608019 .

[10] Agriterribacter , Arvibacter , Aurantisolimonas , Compostibacter , Deminuibacter , Dinghuibacter , Edaphobaculum , Ferruginibacter , Flaviaesturariibacter , Flavipsychrobacter , Flavitalea , Gynurincola , Haoranjiania , Heliimonas , Lacibacter , Mucibacter , Nemorincola , Niveitalea , Panacibacter , Paracnuella , Paraflavitalea , Parapseudoflavitalea , Parasediminibacterium , Parasegetibacter , Phnomibacter , Pseudobacter , Pseudoflavitalea , Puia y Rurimicrobium no están incluidos en este árbol filogenético.

[Munoz1-1] Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Filogenia revisada de Bacteroidetes y propuesta de dieciséis nuevos taxones y dos nuevas combinaciones, incluyendo Rhodothermaeota phyl. nov". Syst Appl Microbiol . 39 (5): 281– 296. Bibcode : 2016SyApM..39..281M . doi : 10.1016/j.syapm.2016.04.004 . PMID 27287844 .

[Munoz2-2] Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Corrección a "Filogenia revisada de Bacteroidetes y propuesta de dieciséis nuevos taxones y dos nuevas combinaciones que incluyen Rhodothermaeota phyl. nov." [ Syst. Appl. Microbiol . 39 (5) (2016) 281–296]". Syst Appl Microbiol . 39 (7): 491– 492. Bibcode : 2016SyApM..39..491M . doi : 10.1016/j.syapm.2016.08.006 . PMID 27639921 .

[3] Kämpfer P, Lodders N, Falsen E (2011). " Hydrotalea flava gen. nov., sp. nov., un nuevo miembro del filo Bacteroidetes y asignación de los géneros Chitinophaga , Sediminibacterium , Lacibacter , Flavihumibacter , Flavisolibacter , Niabella , Niastella , Segetibacter , Parasegetibacter , Terrimonas , Ferruginibacter , Filimonas e Hydrotalea a la familia Chitinophagaceae . nov" . Int J Syst Evol Microbiol . 61 (parte 3): 518– 523. doi : 10.1099/ijs.0.023002-0 . PMID 20382796 .

[LPSN-4] 1 2 3 Euzéby JP, Parte AC. " Chitinophagales " . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Recuperado el 25 de junio de 2021 .

[NfL-5] 1 2 Parker, Charles Thomas; Taylor, Dorothea; Garrity, George M (8 de octubre de 2009). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Resumen taxonómico para las familias". NamesforLife, LLC. doi : 10.1601/tx.14400 .{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )

[6] " Chitinophagaceae " . www.uniprot.org .

[7] Krieg, Noel R.; Ludwig, Wolfgang; Whitman, William B.; Hedlund, Brian P.; Paster, Bruce J.; Staley, James T.; Ward, Naomi; Brown, Daniel (2011).Manual de Bacteriología Sistemática de Bergey: Volumen 4: Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae y PlanctomycetesSpringer Science & Business Media. ISBN 9780387685724.

[8] Ralebitso-Senior, T. Komang (2018). Ecogenómica forense: Aplicación de análisis de ecología microbiana en contextos forenses . Academic Press. ISBN 9780128096093.

[García-López-9] García-López M, Meier-Kolthoff JP, Tindall BJ, Gronow S, Woyke T, Kyrpides NC, Hahnke RL, Göker M (2019). " Análisis de 1000 genomas de cepas tipo mejora la clasificación taxonómica de Bacteroidetes " . Front Microbiol . 10 : 2083. doi : 10.3389/fmicb.2019.02083 . PMC 6767994. PMID 31608019 .

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