Genómica de los cordados

La profunda ramificación de la filogenia de los cordados ha sido aclarada por la genómica de los cordados. ^{[ 1 ]} La genómica de los cordados demuestra que los anfioxos son el clado vivo más basal dentro de los cordados, mientras que los tunicados son el clado hermano de los craneados . ^{[ 2 ]}

Una comparación de los genomas del anfioxo Branchiostoma floridae , un pez , el pollo Gallus gallus y los humanos Homo sapiens reveló una extensa macrosintenia con poca o ninguna microsintenia. Es decir, en todo el clado de los cordados se encuentran los mismos genes agrupados cerca unos de otros, aunque el orden de los genes dentro de los grupos se ha reordenado. ^{[ 3 ]} Hay 135 segmentos identificables en el genoma humano que conservan la sintenia con el cariotipo ancestral de los cordados .

El análisis de sintenia indica que había 17 cromosomas en el último ancestro común de los cordados. ^{[ 3 ]}

Múltiples líneas de evidencia experimental sugieren firmemente que el genoma ancestral de los cordados se duplicó dos veces en el linaje que conduce a los peces teleósteos . ^{[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]} Una comparación de los genomas del anfioxo Branchiostoma floridae , los tunicados Ciona intestinalis y Oikopleura dioica , la lamprea Petromyzon marinus , los peces Fugu rubripes y Gasterosteus aculeatus , el pollo Gallus gallus y el humano Homo sapiens confirmó que ocurrieron dos duplicaciones del genoma completo en la historia temprana del clado Vertebrata . ^{[ 8 ]}