Hispanopedia WikiEn pocas palabras, el cistroma se refiere a un conjunto de elementos reguladores de un grupo de genes, incluyendo sitios de unión de factores de transcripción y modificaciones de histonas (acetilación, desacetilación, metilación, desmetilación, etc.). Más específicamente, "el conjunto de dianas cis-activas de un factor trans-activo a escala genómica, también conocido como la localización genómica in vivo de los sitios de unión de factores de transcripción o modificaciones de histonas ". [ 1 ] El término cistroma es una combinación de cistr (de cistrón ) + ome (de genoma ). El término cistroma fue acuñado por investigadores del Instituto de Cáncer Dana-Farber y la Facultad de Medicina de Harvard . [ 2 ]
Tecnologías como la inmunoprecipitación de cromatina combinada con el análisis de microarrays (" ChIP-on-chip ") o con la secuenciación masiva en paralelo de ADN (" ChIP-Seq ") han facilitado enormemente la definición del cistroma de los factores de transcripción y otras proteínas asociadas a la cromatina .
Referencias
- ↑ Liu T, Ortiz JA, Taing L, Meyer CA, Lee B, Zhang Y, Shin H, Wong SS, Ma J, Lei Y, Pape UJ, Poidinger M, Chen Y, Yeung K, Brown M, Turpaz Y, Liu XS (2011). " Cistrome: una plataforma integradora para estudios de regulación transcripcional" . Genome Biol . 12 (8): R83. doi : 10.1186/gb-2011-12-8-r83 . PMC 3245621. PMID 21859476 .
- ↑ "cistrome / Página principal" . PBWiki, Inc.
Lecturas adicionales
- Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (marzo de 2008). " FoxA1 traduce firmas epigenéticas en transcripción específica de linaje impulsada por potenciadores" . Cell . 132 (6): 958–70 . doi : 10.1016/j.cell.2008.01.018 . PMC 2323438. PMID 18358809 .
- Lupien M, Brown M (junio de 2009). "Cistrómica del cáncer hormonodependiente" . Endocr. Relat. Cancer . 16 (2): 381– 9. doi : 10.1677/ERC-09-0038 . PMID 19369485 .
- Genética molecular
- Esbozos genéticos