Clostridiaceae

Las Clostridiaceae son una familia de la clase bacteriana Clostridia y contienen el género Clostridium .

La familia Clostridiaceae (nombre científico) definida por el esquema taxonómico del Manual de Bacteriología Sistemática de Bergey contiene como núcleo el género Clostridium ( sensu stricto ), así como Acetivibrio , Acidaminobacter , Alkaliphilus , Anaerobacter , Caloramator , Caloranaerobacter , Coprobacillus , Dorea , Natronincola , Oxobacter , Sarcina , Sporobacter , Thermobrachium , Thermohalobacter y Tindallia . La inclusión previa de estos géneros adicionales (como se ve a la derecha) en una familia Clostridiaceae se basa en gran medida en que las especies tipo de estos géneros están, en muchos casos , filogenéticamente relacionadas con especies mal clasificadas del género Clostridium . Sin embargo, con la excepción de Anaerobacter , Caloramator , Oxobacter , Sarcina y Thermobrachium , estos géneros quedan fuera de la radiación de lo que puede considerarse la verdadera familia Clostridiaceae y ahora se consideran pertenecientes a otras familias dentro del filo Gram-positivo de bajo contenido de G + C.

Esta clasificación errónea es el resultado de problemas bien conocidos de la estructura taxonómica actual del género tradicional Clostridium . El análisis filogenético de Collins (1994) fue la primera comparación a gran escala de secuencias del gen ARNr 16S de especies del género Clostridium y taxones relacionados. El hecho de que las especies del género Clostridium no formen un grupo monofilético se ha demostrado en varios estudios en los que se compararon pequeños grupos de especies de Clostridium ya en 1981. El estudio comparativo de Collins (1994) y estudios posteriores pueden utilizarse para concluir que más de la mitad de las especies actualmente asignadas a este género no están, de hecho, estrechamente relacionadas con la especie tipo, C. butyricum , y desde un punto de vista filogenético no deberían incluirse en un género Clostridium de nueva definición . ^{[ 2 ]}

Esta extensa diversidad genética del género Clostridium ya había sido demostrada en 1975 por Johnson y Francis mediante estudios de hibridación de ARNr 23S :ADN, pero el enfoque de la secuencia del gen ARNr 16S reveló las relaciones filogenéticas reales entre las especies de este género y otros géneros.

El género Clostridium actualmente comprende 152 especies válidamente descritas en la nomenclatura. ^{[ 3 ]} Sin embargo, sobre la base de los análisis de secuencias del gen ARNr 16S, solo 73 de ellas se encuentran dentro de la radiación de la especie tipo del género Clostridium .

La familia polifilética Clostridiaceae comprende lo siguiente:

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) ^{[ 4 ]} y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) ^{[ 5 ].}

• Lista de géneros de bacterias
• Lista de órdenes bacterianas