Códigos de nomenclatura

Los códigos de nomenclatura son los diversos conjuntos de reglas que rigen la denominación de los organismos vivos. La estandarización de los nombres científicos de los organismos biológicos permite a los investigadores debatir sus hallazgos (incluido el descubrimiento de nuevas especies).

A medida que el estudio de la biología se fue especializando cada vez más, se adoptaron códigos específicos para los diferentes tipos de organismos.

Para un usuario final que solo trabaja con nombres de especies , y que tiene cierto conocimiento de que las especies se pueden asignar a géneros , familias y otros taxones de rangos superiores , puede que no sea evidente que exista más de un código, pero más allá de este nivel básico, estos son bastante diferentes en la forma en que funcionan.

En taxonomía , la nomenclatura binomial ("sistema de nombres de dos términos"), también llamada nomenclatura binaria , es un sistema formal para nombrar especies de seres vivos asignando a cada una un nombre compuesto por dos partes, ambas con formas gramaticales latinas , aunque pueden basarse en palabras de otros idiomas. Dicho nombre se denomina nombre binomial (que puede abreviarse como "binomial"), binomen , nombre binominal o nombre científico ; de manera más informal, históricamente también se le conoce como nombre latino . En el código zoológico ICZN, el sistema también se denomina nomenclatura binomial (utilizando el sufijo -inal en lugar de -ial ), ^{[ 1 ]} que significa "sistema de nombres de dos nombres". ^{[ 2 ]}

La primera parte del nombre —el nombre genérico— identifica el género al que pertenece la especie, mientras que la segunda parte —el nombre específico o epíteto específico— distingue la especie dentro del género. Por ejemplo, los humanos modernos pertenecen al género Homo y, dentro de este género, a la especie Homo sapiens . Tyrannosaurus rex es probablemente el nombre binomial no humano más conocido. ^{[ 3 ]}

La introducción formal de este sistema de nomenclatura de especies se atribuye a Carl Linnaeus , comenzando efectivamente con su obra Species Plantarum en 1753. ^{[ 4 ]} Pero ya en 1622, Gaspard Bauhin introdujo en su libro Pinax theatri botanici (en español, Exposición ilustrada de plantas ) muchos nombres de géneros que posteriormente fueron adoptados por Linnaeus. ^{[ 5 ]} La introducción de nombres de dos partes (nomenclatura binomial) para las especies por parte de Linnaeus fue una simplificación bienvenida porque, a medida que se expandía nuestro conocimiento de la biodiversidad, también lo hacía la longitud de los nombres, muchos de los cuales se habían vuelto engorrosos. ^{[ 6 ]}

Con la adopción de la nomenclatura binomial por parte de todos los naturalistas del mundo, surgieron diversas corrientes de pensamiento sobre los detalles. Se hizo cada vez más evidente la necesidad de un conjunto detallado de reglas para regular los nombres científicos . Desde mediados del siglo XIX en adelante, se llevaron a cabo varias iniciativas para establecer conjuntos de reglas aceptados a nivel mundial. Actualmente, los códigos de nomenclatura rigen la denominación de:

• Algas , hongos y plantas : Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas ( ICN ), que en julio de 2011 reemplazó al Código Internacional de Nomenclatura Botánica ( ICBN ) y a las anteriores Reglas Internacionales de Nomenclatura Botánica .
• Animales – Código Internacional de Nomenclatura Zoológica ( ICZN ).
• Bacterias y arqueas que se cultivan en cultivos celulares – Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas ( ICNP ), que en 2008 reemplazó al Código Internacional de Nomenclatura de Bacterias ( ICNB ).
• Bacterias y arqueas descritas a partir de datos de secuencias – Código de nomenclatura de procariotas descritos a partir de datos de secuencias ( SeqCode ).
• Plantas cultivadas – Código Internacional de Nomenclatura para Plantas Cultivadas ( ICNCP ).
• Asociaciones de plantas – Código Internacional de Nomenclatura Fitosociológica (CIPN).
• Virus – Código Internacional de Clasificación y Nomenclatura de Virus (ICVCN); véase también clasificación de virus .

El punto de partida, es decir, el momento a partir del cual estos códigos entran en vigor (generalmente de forma retroactiva), varía de un grupo a otro, y a veces de un rango a otro. ^{[ 7 ]} En botánica y micología , el punto de partida suele ser el 1 de mayo de 1753 ( Linnaeus , Species plantarum ). En zoología , es el 1 de enero de 1758 (Linnaeus, Systema Naturae , 10.ª edición ). Por otro lado, la bacteriología comenzó de nuevo, haciendo una revisión completa en 1980 (Skerman et al., "Approved Lists of Bacterial Names"), aunque manteniendo los autores y las fechas de publicación originales. ^{[ 8 ]}

Excepciones en botánica: ^{[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]}

• Spermatophyta y Pteridophyta , nombres supragenéricos: 4 de agosto de 1789 ( Jussieu , Genera plantarum );
• Musci (excepto Sphagnaceae): 1 de enero de 1801 ( Hedwig , Species muscorum );
• Sphagnaceae y Hepaticae (incluidas las Anthocerotae ), nombres supragenéricos: 4 de agosto de 1789 (Jussieu, Genera plantarum );
• ( Hongos :) Los microsporidios se rigen por el ICZN (tratados como animales), y véase más abajo para los hongos fósiles ; ^{[ 12 ]}
• ( Algas :)
  • Nostocaceae homocysteae: 1 de enero de 1892 (Gomont, " Monographie des Oscillariées ");
  • Nostocaceae heterocysteae: 1 de enero de 1886 ( Bornet & Flahault , " Révision des Nostocacées hétérocystées ");
  • Desmidiaceae : 1 de enero de 1848 ( Ralfs , británica Desmidieae );
  • Oedogoniaceae : 1 de enero de 1900 ( Hirn , " Monographie und Iconographie der Oedogoniaceen ");
• Plantas fósiles , algas ( excepto diatomeas ) y hongos: 31 de diciembre de 1820 ( Sternberg , Flora der Vorwelt ).

Excepciones en zoología: ^{[ 13 ]}

• Arañas : 1757 ( Clerck , Aranei Svecici ).

También existen diferencias en la forma en que funcionan los códigos. Por ejemplo, el ICN (el código para algas, hongos y plantas) prohíbe los tautónimos , mientras que el ICZN (el código animal) los permite.

Estos códigos difieren en su terminología, y existe un proyecto a largo plazo para armonizarla. Por ejemplo, el ICN utiliza «válido» en «publicación válida de un nombre» (=el acto de publicar un nombre formal), mientras que el ICZN emplea el término «establecer un nombre» . El ICZN , por su parte , utiliza «válido» en «nombre válido» («nombre correcto»), mientras que el ICN emplea el término «nombre correcto». La armonización avanza muy lentamente.

Existen diferencias en cuanto a los tipos de cultivos que se utilizan. El código bacteriológico prefiere los cultivos vivos, pero permite otros tipos. Ha habido un debate continuo sobre qué tipo de cultivo es más útil en un caso como el de las cianobacterias . ^{[ 14 ]}

En 1997 se adoptó un enfoque más radical cuando el Comité Internacional de Bionomenclatura (ICB) de la IUBS / IUMS presentó el muy debatido borrador del BioCódigo , que proponía reemplazar todos los códigos existentes con una armonización de los mismos. ^{[ 15 ] [ 16 ]} La fecha de implementación prevista originalmente para el borrador del BioCódigo era el 1 de enero de 2000, pero no se llegó a un acuerdo para reemplazar los códigos existentes .

En 2011, se propuso un BioCódigo revisado que, en lugar de reemplazar los códigos existentes , proporcionaría un contexto unificado para ellos, haciendo referencia a ellos cuando fuera necesario. ^{[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]} Los cambios en los códigos existentes se están realizando lentamente en las direcciones propuestas. ^{[ 20 ] [ 21 ]} Sin embargo, los participantes en la última discusión seria del borrador del BioCódigo concluyeron que probablemente no se implementaría durante sus vidas. ^{[ 22 ]}

Muchos autores encontraron problemas al usar el sistema linneano en la clasificación filogenética. ^{[ 23 ]} De hecho, los primeros defensores de la nomenclatura basada en rangos, como Alphonse de Candolle y los autores de la versión de 1886 del código de nomenclatura de la Unión Americana de Ornitólogos , ya previeron que en el futuro, la nomenclatura basada en rangos tendría que abandonarse. ^{[ 24 ] [ 6 ]} Otro código que se desarrolló desde 1998 es el PhyloCode , que ahora regula los nombres definidos bajo la nomenclatura filogenética en lugar de la nomenclatura linneana tradicional . Este nuevo enfoque requiere el uso de definiciones filogenéticas que se refieren a "especificadores", análogos a "tipo" en la nomenclatura basada en rangos. Dichas definiciones delimitan taxones bajo una filogenia dada, y este tipo de nomenclatura no requiere el uso de rangos absolutos. El Código entró en vigor en 2020 con la publicación de Phylonyms , una monografía que incluye una lista de los nombres de pila establecidos bajo ese código.

Algunos protistas , a veces llamados protistas ambirregnales , han sido considerados tanto protozoos como algas , o protozoos y hongos , y sus nombres se han publicado bajo la ICZN o la ICN , o ambas . ^{[ 25 ] [ 26 ]} El doble lenguaje resultante en los esquemas de clasificación de protistas generó confusión. ^{[ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]}

Los grupos que reclaman tanto los protozoólogos como los ficólogos incluyen euglenoides , dinoflagelados , criptomónadas , haptófitas , glaucofitas , muchos heterocontos (por ejemplo, crisofitas , rafidófitas , silicoflagelados , algunas xantofitas , proteromónadas ), algunas algas verdes monadoides ( volucodaleas y prasinofitas ), coanoflagelados , bicosoécidos , ebriidos y cloraraquniofitas .

Los mohos mucilaginosos , las formas plasmodiales y otros organismos " similares a hongos " mencionados tanto por protozoólogos como por micólogos incluyen micetozoos , plasmodiofóridos , acrásicos y laberintulomicetos . Los hongos mencionados tanto por protozoólogos como por micólogos incluyen quitridios , blastocládidos y los hongos intestinales .

Otros grupos problemáticos son las cianobacterias (ICNP/ICN), los rozellidáceos y los microsporidios (ICZN/ICN).

El código zoológico no regula los nombres de los taxones inferiores a la subespecie ni superiores a la superfamilia. Existen numerosos intentos de introducir cierto orden en la nomenclatura de estos taxones, ^{[ 30 ] [ 31 ]} incluyendo el PhyloCode , el Sistema Nomenclatural Duplotensional, ^{[ 32 ] [ 33 ]} y la nomenclatura circunscrita . ^{[ 34 ] [ 35 ]}

El código botánico se aplica principalmente a los rangos de superfamilia e inferiores. Existen algunas reglas para los nombres por encima del rango de superfamilia, pero el principio de prioridad no se aplica a ellos, y el principio de tipificación es opcional. Estos nombres pueden ser nombres tipificados automáticamente o nombres descriptivos . ^{[ 36 ] [ 37 ]} En algunas circunstancias, un taxón tiene dos nombres posibles (p. ej., Chrysophyceae Pascher, 1914, nom. descrip. ; Hibberd, 1976, nom. typificatum ). Los nombres descriptivos son problemáticos, ya que, si un taxón se divide, no es obvio qué nuevo grupo adopta el nombre existente. Mientras tanto, con los nombres tipificados, el nombre existente es adoptado por el nuevo grupo que aún conserva el tipo de este nombre. Sin embargo, los nombres tipificados presentan problemas especiales para los microorganismos. ^{[ 29 ]}

• nomenclatura binomial
• nomenclatura botánica
• nomenclatura química
• Nombre común
• nomenclatura genética
• Glosario de nomenclatura científica
• Lista de taxones nombrados mediante anagramas
• nomenclatura zoológica
• Árbol de la vida (biología)

• Lahr, Daniel JG; Lara, Enrique; Mitchell, Edward AD (2012). "Es hora de regular la nomenclatura de los eucariotas microbianos" . Biological Journal of the Linnean Society . 107 (3): 469– 476. doi : 10.1111/j.1095-8312.2012.01962.x .
• McNeill, J.; Barrie, Francia; Buck, WR; Demoulin, V.; Greuter, W.; Hawksworth, DL; Herendeen, PS; Knapp, S.; Marhold, K.; Prado, J.; Prud'homme Van Reine, WF; Smith, GF; Wiersema, JH; Turland, Nueva Jersey (2012). Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas (Código de Melbourne) adoptado por el Decimoctavo Congreso Botánico Internacional Melbourne, Australia, julio de 2011 . vol. Regnum Vegetabile 154. ARG Gantner Verlag KG. ISBN 978-3-87429-425-6.
• Turland, NJ; Wiersema, JH; Barry, FR; Greuter, W.; Hawksworth, DL; Herendeen, PS; Knapp, S.; Kusber, WH; Li, D.-Z.; Marhold, K.; May, TW; McNeill, J.; Monro, AM; Prado, J.; Price, MJ; Smith, GF (2018). Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas (Código de Shenzhen) adoptado por el Decimonoveno Congreso Botánico Internacional, Shenzhen, China, julio de 2017. Vol. Regnum Vegetabile 159. Koeltz Botanical Books. ISBN 978-3-946583-16-5.

• Biocode en acción en el Portal Oceánico Smithsoniano
• ICN : Código de Shenzhen (2018)
• ICZN : el "libro verde" (1999)
• Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (1997), por JP Euzéby
• PhyloCode