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Alineador de CodonCode

CodonCode Aligner es una aplicación comercial para el ensamblaje , alineación y edición de secuencias de ADN en Mac OS X y Windows . Características Las características incluyen...

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CodonCode Aligner es una aplicación comercial para el ensamblaje , alineación y edición de secuencias de ADN en Mac OS X y Windows .

Características

Las características incluyen edición de cromatogramas , recorte de extremos y recorte de vectores, ensamblaje de secuencias y edición de contigs, alineación de ADNc contra plantillas genómicas, alineación y edición de secuencias, alineación de contigs entre sí con ClustalW , MUSCLE o algoritmos integrados, detección de mutaciones, incluida la detección de polimorfismos de un solo nucleótido heterocigotos , análisis de inserciones y deleciones heterocigotas, inicio de búsquedas BLAST en línea , análisis de restricción (encuentra y visualiza sitios de corte de restricción), análisis RFLP, clonación virtual, incluido el ensamblaje de Gibson, clonación de restricción y clonación TA y TOPO, diseño de cebadores, árboles filogenéticos, tablas de diferencias, mejora de trazas y soporte para Phred , Phrap , ClustalW y MUSCLE .

Historia

La primera versión beta de CodonCode Aligner se lanzó en abril de 2003, seguida de la primera versión completa en junio de 2003. Se lanzaron actualizaciones importantes en 2003, 2004, 2006, 2007, 2009, 2010, 2012, 2013, 2014, 2015, 2017, 2018, 2019, 2021, 2023 y 2024.

En abril de 2009, CodonCode Aligner había sido citado en más de 400 publicaciones científicas. En 2025, CodonCode Aligner ha sido citado en miles de publicaciones científicas revisadas por pares. Las citas abarcan una amplia variedad de áreas de investigación biomédica, incluyendo investigación sobre el VIH, [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] biogeografía y biología ambiental, [ 4 ] [ 5 ] estudios de metilación del ADN, [ 6 ] enfermedades genéticas, [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] microbiología clínica, [ 10 ] [ 11 ] e investigación evolutiva y filogenética. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]

Véase también

Referencias

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  14. ↑ Stoeck T, Kasper J, Bunge J, Leslin C, Ilyin V, Epstein S (2007). "Diversidad de protistas en el Ártico: ¿un caso de paleoclima que moldea la biodiversidad moderna?" . PLOS ONE . ​​2 (8) e728. Bibcode : 2007PLoSO...2..728S . doi : 10.1371/journal.pone.0000728 . PMC 1940325 . PMID 17710128 .  Icono de acceso abierto
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