Código nuclear del condilostoma

El código nuclear de Condylostoma (tabla de traducción 28) es un código genético utilizado por el genoma nuclear del ciliado heterotrico Condylostoma magnum . ^[1]^[2] Este código, junto con las tablas de traducción 27 y 31, es notable porque cada uno de los 64 codones posibles puede ser un codón de sentido. La evidencia experimental sugiere que la terminación de la traducción depende del contexto, específicamente la proximidad a la cola de poli(A). Cerca de dicha cola, PABP podría ayudar a terminar la proteína al reclutar eRF1 y eRF3 para evitar que el ARNt cognado se una. ^[3]

El código (28)

AAs = FFLLSSSSYYQQCCWWLLLAPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG

Starts = ----------**--*--------------------M----------------------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Bases: adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T) o uracilo (U).

Aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln, Q), Glicina (Gly, G), Histidina (His, H), Isoleucina (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lisina (Lys, K), Metionina (Met, M), Fenilalanina (Phe, F), Prolina (Pro, P), Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Triptófano (Trp, W), Tirosina (Tyr, Y) y Valina (Val, V).

Diferencias con el código estándar

Véase también

Lista de todos los códigos genéticos : tablas de traducción 1 a 16 y 21 a 31.
La base de datos de códigos genéticos .

Referencias

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público . ^[2]

^ Heaphy, Stephen M.; Mariotti, Marco; Gladyshev, Vadim N.; Atkins, John F.; Baranov, Pavel V. (1 de noviembre de 2016). "Nuevas variantes del código genético de los ciliados, incluida la reasignación de los tres codones de terminación a codones de sentido en Condylostoma magnum". Biología molecular y evolución . 33 (11): 2885–2889. doi :10.1093/molbev/msw166. ISSN 0737-4038. PMC 5062323 . PMID 27501944.
^ ab Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos". Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Consultado el 18 de noviembre de 2016 .
^ Swart, Estienne Carl; Serra, Valentina; Petroni, Giulio; Nowacki, Mariusz (2016). "Códigos genéticos sin codón de parada específico: terminación de la traducción dependiente del contexto". Cell . 166 (3): 691–702. doi :10.1016/j.cell.2016.06.020. PMC 4967479 . PMID 27426948.

[1] Heaphy, Stephen M.; Mariotti, Marco; Gladyshev, Vadim N.; Atkins, John F.; Baranov, Pavel V. (1 de noviembre de 2016). "Nuevas variantes del código genético de los ciliados, incluida la reasignación de los tres codones de terminación a codones de sentido en Condylostoma magnum". Biología molecular y evolución . 33 (11): 2885–2889. doi :10.1093/molbev/msw166. ISSN 0737-4038. PMC 5062323 . PMID 27501944.

[NCBI-2] Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos". Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Consultado el 18 de noviembre de 2016 .

[3] Swart, Estienne Carl; Serra, Valentina; Petroni, Giulio; Nowacki, Mariusz (2016). "Códigos genéticos sin codón de parada específico: terminación de la traducción dependiente del contexto". Cell . 166 (3): 691–702. doi :10.1016/j.cell.2016.06.020. PMC 4967479 . PMID 27426948.