El banco de datos de dinámica conformacional ( CDDB ) es una base de datos sobre la dinámica conformacional de proteínas pesadas y complejos proteicos . El CDDB es útil cuando se utiliza junto con datos estructurales estáticos para facilitar la investigación sobre la función de las proteínas . También es útil para identificar complejos proteicos que son esenciales para la función celular . [ 1 ]
El análisis se lleva a cabo mediante el cálculo de grano grueso de las estructuras presentes en el banco de datos de microscopía electrónica (EMDB). Este análisis muestra fluctuaciones térmicas de equilibrio y distribuciones de energía de deformación elástica , lo que permite identificar dominios proteicos rígidos y flexibles. Los resultados también proporcionan información sobre correlaciones en los movimientos moleculares que pueden utilizarse para identificar regiones moleculares altamente acopladas dinámicamente. [ 1 ]
Referencias
- 1 2 Kim, Do-Nyun; Altschuler Josiah; Strong Campbell; McGill Gaël; Bathe Mark (enero de 2011). "Banco de datos de dinámica conformacional: una base de datos para la dinámica conformacional de proteínas y ensamblajes supramoleculares de proteínas" . Nucleic Acids Res . 39 (número especial de bases de datos). Inglaterra: D451-5. doi : 10.1093/nar/gkq1088 . PMC 3013685. PMID 21051356 .
Enlaces externos
- sitio web del banco de datos
- bases de datos de proteínas
- Estructura de las proteínas
- Esbozos de bases de datos biológicas