Articulo de referencia

Evaluación crítica de la interpretación del genoma

Descripción general del concurso CAGI La Evaluación Crítica de la Interpretación del Genoma (CAGI) es una competición anual de bioinformática centrada en la interpretación de la...

Descripción general del concurso CAGI

La Evaluación Crítica de la Interpretación del Genoma (CAGI) es una competición anual de bioinformática centrada en la interpretación de la variación genómica . [ 1 ] Los experimentos de CAGI se basan en los protocolos desarrollados en el programa de Evaluación Crítica de la Predicción de Estructuras (CASP) , adaptados al ámbito de la genómica. A lo largo de una década, CAGI ha realizado cinco rondas de desafíos, atrayendo 738 propuestas de todo el mundo. [ 2 ] Los resultados se han publicado en la revista Human Mutation . [ 3 ]

Referencias

  1. "Colaboración a través de la competencia" . Nature Methods (editorial). 11 (7): 695. Julio de 2014. doi : 10.1038/nmeth.3026 . PMID 25110777 . 
  2. ^ Jainista, Shantanu; Bakolitsa, Constantina; Brenner, Steven E.; Radivojac, Predrag; Muda, John; Repo, Susana; Hoskins, Roger A.; Andreoletti, Gaia; Barsky, Daniel; Chellapan, Ajithavalli; Chu, Hoyin; Dabbiru, Navya; Kollipara, Naveen K.; Ly, Melissa; Neumann, Andrew J. (22 de febrero de 2024). "CAGI, la Evaluación Crítica de la Interpretación del Genoma, establece avances y perspectivas para los métodos computacionales de interpretación de variantes genéticas" . Biología del genoma . 25 (1): 53. doi : 10.1186/s13059-023-03113-6 . ISSN 1474-760X . PMC 10882881 . PMID 38389099 .   
  3. Andreoletti, Gaia; Pal, Lipika R.; Moult, John; Brenner, Steven E. (2019). "Informes de la quinta edición de CAGI: La evaluación crítica de la interpretación del genoma" . Human Mutation . 40 (9): 1197– 1201. doi : 10.1002/humu.23876 . ISSN 1098-1004 . PMC 7329230. PMID 31334884 .