La Evaluación Crítica de la Predicción de Interacciones (CAPRI) es un experimento comunitario para modelar la estructura molecular de complejos proteicos , también conocido como acoplamiento proteína-proteína .
El CAPRI [ 1 ] es una serie continua de eventos en la que investigadores de toda la comunidad intentan acoplar las mismas proteínas, proporcionadas por los evaluadores. Las rondas se realizan aproximadamente cada seis meses. Cada ronda contiene entre uno y seis complejos proteína-proteína objetivo cuyas estructuras se han determinado experimentalmente recientemente. Las coordenadas se mantienen en privado por los evaluadores, con la cooperación de los biólogos estructurales que las determinaron. El experimento CAPRI es doble ciego , en el sentido de que los participantes desconocen la estructura resuelta y los evaluadores desconocen la correspondencia entre una propuesta y la identidad de su creador.
Véase también
- Evaluación crítica de técnicas para la predicción de la estructura de proteínas (CASP) : un ejercicio similar en el campo de la predicción de la estructura de proteínas.
- Evaluación Crítica de la Anotación Funcional (CAFA)
Referencias
- ↑ Joël Janin; Kim Henrick; John Moult; Lynn Ten Eyck; Michael JE Sternberg; Sandor Vajda; Ilya Vakser; Shoshana Wodak (1 de julio de 2003). "CAPRI: una evaluación crítica de interacciones predecidas". Proteins . 52 (1): 2– 9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355 . doi : 10.1002/PROT.10381 . ISSN 1097-0134 . PMID 12784359 . S2CID 31489448 . Wikidata Q28208450 .
Enlaces externos
- Sitio web oficial
- CAPRI o: ¿Cuál es el estado del acoplamiento proteína-proteína? Archivado el 12/11/2011 en Wayback Machine.
Lista de servidores de predicción que participan en CAPRI
- ClusPro
- GRAMM-X
- FireDock
- HADDOCK Archivado el 29/01/2020 en Wayback Machine — Acoplamiento proteína-proteína impulsado por alta ambigüedad
- pyDockWEB — Predicción estructural de interacciones proteína-proteína
- PatchDock
- SmoothDock
- 3D-Garden : Nexo de exploración de acoplamiento global y restringido
- SwarmDock archivado el 19 de abril de 2021 en Wayback Machine .
- MUELLE/PASTEL
- SPIDER - Puntuación de interacciones proteína-proteína
- Modelado molecular
- Esbozos de biología molecular y celular
- Fragmentos de física molecular